(貨號(hào):WLRE8205KIT)
原理概述:
本試劑盒基于一種常溫恒溫核酸快速擴(kuò)增技術(shù):在常溫恒溫下,特殊修飾的反轉(zhuǎn)錄酶利用特異性引物DNA和模板RNA合成cDNA鏈,反應(yīng)體系中的重組酶、單鏈DNA結(jié)合蛋白和DNA聚合酶以新合成的cDNA鏈為模板進(jìn)行快速核酸擴(kuò)增反應(yīng)。本試劑盒在42 oC下,依賴核酸外切酶的作用,加入根據(jù)模版設(shè)計(jì)的特異的分子探針,使用熒光監(jiān)測(cè)設(shè)備能實(shí)現(xiàn)對(duì)目標(biāo)片段擴(kuò)增過程的實(shí)時(shí)監(jiān)控。適用于實(shí)驗(yàn)室級(jí)別的RNA擴(kuò)增以及其他檢測(cè)用途的RNA擴(kuò)增使用。
產(chǎn)品特點(diǎn):
本試劑盒具有靈敏度高、特異性強(qiáng)、反應(yīng)時(shí)間短(僅需20 mins)等優(yōu)點(diǎn),反應(yīng)組分為干粉狀態(tài),操作簡(jiǎn)便,易于保存。
可適用于各種品牌的熒光定量PCR儀,恒溫?zé)晒鈹U(kuò)增儀器等熒光檢測(cè)設(shè)備。
引物設(shè)計(jì):
建議使用長(zhǎng)度在 30-35 bp的引物,引物過短會(huì)影響擴(kuò)增速度和檢測(cè)靈敏度;引物設(shè)計(jì)避免形成二級(jí)結(jié)構(gòu)而影響擴(kuò)增;擴(kuò)增子長(zhǎng)度建議在150-300 bp,通常不超過500 bp。
熒光探針設(shè)計(jì):
探針序列不與特異性引物識(shí)別位點(diǎn)重疊,長(zhǎng)度為46-52 nt,序列避免回文序列、內(nèi)部二級(jí)結(jié)構(gòu)和連續(xù)的重復(fù)堿基。探針共有四個(gè)修飾位點(diǎn):距離5’端的≥35 nt的中部位置標(biāo)記一個(gè)dSpacer(四氫呋喃,THF),作為核酸外切酶的識(shí)別位點(diǎn);THF位點(diǎn)的上游標(biāo)記一個(gè)熒光基團(tuán),下游標(biāo)記一個(gè)粹滅基團(tuán),兩個(gè)基團(tuán)的間距為2-4 nt;THF距離3’末端≥15 nt,并且3’末端標(biāo)記一個(gè)修飾基團(tuán),例如胺基、磷酸基團(tuán)或C3-spacer。
試劑盒組成:
組成 | 含量 |
A Buffer | 1.6 mL×1管 |
B Buffer | 150 μL×1管 |
試劑 | 48份 |
使用說明書 | 1份 |
試劑盒儲(chǔ)存:
運(yùn)輸條件:低溫運(yùn)輸;
儲(chǔ)存條件:儲(chǔ)存溫度 ≤ -20 oC,避光保存,避免重壓、反復(fù)凍融;
產(chǎn)品有效期:12個(gè)月。
操作步驟:提前30分鐘將試劑盒所需組分取出,室溫融化,震蕩混勻。
1) 每個(gè)干粉反應(yīng)管加入29.4 μL A buffer(注意:A buffer需融化混勻,否則會(huì)對(duì)實(shí)驗(yàn)效果產(chǎn)生影響);
2) 每個(gè)反應(yīng)管分別加入2 μL上游引物、2 μL下游引物和0.6 μL探針(引物和探針濃度為10 μM,對(duì)于多個(gè)反應(yīng)、步驟1和步驟2可以混合后再分裝至反應(yīng)管中);
3) 向反應(yīng)管中依次加入11.5 μL ddH2O和2 μL核酸模板(可根據(jù)核酸濃度調(diào)整加入的核酸模板體積,并相應(yīng)調(diào)整加入的ddH2O體積,至模板與ddH2O總體積為13.5 μL);
4) 最后向反應(yīng)管中加入2.5 μL B Buffer并充分混合(對(duì)于多個(gè)反應(yīng),建議將B Buffer加至反應(yīng)管的蓋子內(nèi)側(cè),上下顛倒反應(yīng)管8-10次混勻);
5) 混勻后,將反應(yīng)液甩(或快速離心)至管子底部,然后立即將反應(yīng)管放入熒光檢測(cè)設(shè)備中。熒光檢測(cè)程序設(shè)置為:恒溫42 oC;每30 s采集一次FAM通道(信號(hào)采集通道的選擇與熒光探針設(shè)計(jì)一致)熒光值;反應(yīng)時(shí)間20 min。
注:如使用ABI系列PCR儀,請(qǐng)務(wù)必于passive reference和quencher處均選擇“none”。
體系配制
組分 | 體積(μL) |
A Buffer | 29.4 |
上游引物(10 μM) | 2 |
下游引物(10 μM) | 2 |
探針(10 μM) | 0.6 |
ddH2O和RNA模板 | 13.5 |
B Buffer | 2.5 |
總體積 | 50 |
注意事項(xiàng):
1. 由于試劑盒靈敏度非常高,在進(jìn)行反應(yīng)時(shí)請(qǐng)注意避免微量待擴(kuò)增RNA的污染,并盡量考慮設(shè)置空白對(duì)照以確認(rèn)是否有待擴(kuò)增RNA的污染。
2. 試劑盒保質(zhì)期12個(gè)月。每次使用時(shí),請(qǐng)取出實(shí)驗(yàn)所需的MIRA反應(yīng)單元的數(shù)量,置于冰浴條件下并在8小時(shí)內(nèi)使用;剩余部分,請(qǐng)置于存儲(chǔ)條件下。