QuantStudio 3D 數(shù)字實(shí)時(shí) PCR 系統(tǒng)
經(jīng)濟(jì)實(shí)惠、緊湊易用的數(shù)字 PCR 系統(tǒng)。
概述
Applied Biosystems QuantStudio 3D 數(shù)字 PCR 系統(tǒng)是一個(gè)簡(jiǎn)單、經(jīng)濟(jì)實(shí)惠的平臺(tái)，采用密封芯片技術(shù)，為進(jìn)行數(shù)字 PCR 提供了高效、可靠和穩(wěn)定的方法。基于一站式芯片的工作流程讓您可以加載芯片、密封并繼續(xù)擴(kuò)增。
QuantStudio 3D 系統(tǒng)擴(kuò)展了傳統(tǒng)實(shí)時(shí) PCR 的界限，可以定量，無(wú)需使用標(biāo)準(zhǔn)曲線。
特點(diǎn)
QuantStudio 3D 數(shù)字系統(tǒng)提供：
每個(gè)芯片20,000個(gè)納米級(jí)反應(yīng)孔 與基于液滴的方法相比，樣品加載控制更佳，未完成的反應(yīng)更少，從而確保定量的更高精度
一次熱循環(huán)多達(dá)24個(gè)芯片 QuantStudio 3D 數(shù)字 PCR 系統(tǒng)只需不到30秒即可讀取每個(gè)芯片，從而利用簡(jiǎn)單、高效的工作流程來(lái)進(jìn)行數(shù)字 PCR。
基于芯片的一站式工作流程 簡(jiǎn)單的工作流程；只需加載和密封即可進(jìn)行 PCR 和分析，如下所示：
樣品數(shù)據(jù)
QuantStudio 3D 數(shù)字 PCR 系統(tǒng)精度
利用 8個(gè)assay的TaqMan 基因表達(dá)Assay Panel擴(kuò)增五個(gè)獨(dú)立的重復(fù)。所有檢測(cè)值均在相應(yīng)平均值（綠線）的 ±10%（紅線）范圍內(nèi)。(A) 低水平基因表達(dá)的結(jié)果（HPRT1、MYC 和 VEGFA）。(B) 高水平基因表達(dá)的結(jié)果（18S、B2M、GAPDH、GUSB 和 PPIA）。
QuantStudio 3D 數(shù)字 PCR 系統(tǒng)的準(zhǔn)確度
經(jīng)過(guò)評(píng)估，QuantStudio 3D 數(shù)字 PCR 系統(tǒng)定量的準(zhǔn)確度與兩種正交定量方法一致。使用男性基因組 DNA，利用 QuantStudio 12K Flex OpenArray 數(shù)字 PCR 板 (OA) 上的 UV 分光光度計(jì)和數(shù)字 PCR 測(cè)定兩種濃度的拷貝數(shù)/μL，并在 QuantStudio 3D 數(shù)字 PCR 系統(tǒng) (QS3D) 上測(cè)定5個(gè)技術(shù)重復(fù)兩種濃度的拷貝數(shù)/μL，然后進(jìn)行對(duì)比。兩種樣品的預(yù)期目標(biāo)濃度為300個(gè)拷貝/μL 和1,500個(gè)拷貝/μL，均在預(yù)期值范圍內(nèi)，而 QuantStudio 3D 數(shù)字 PCR 系統(tǒng)得出的檢測(cè)結(jié)果與其他方法相比具有的精度。
在9份獨(dú)立 DNA 樣品（相當(dāng)于0–8個(gè)拷貝）中，對(duì)17號(hào)染色體上的 CCL3L1 基因位點(diǎn)的拷貝數(shù)分析所顯示的精度和準(zhǔn)確度。
(A) 實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)和所檢測(cè)樣品組的結(jié)果數(shù)據(jù)。每個(gè)數(shù)字 PCR 檢測(cè)值均落在預(yù)期值的標(biāo)準(zhǔn)差范圍內(nèi)。值得注意的是，所有檢測(cè)值變異系數(shù) (CV) 均小于2.55%，充分表明可以達(dá)到很高的精度。
(B) A 中所顯示相同數(shù)據(jù)的圖形表現(xiàn)。由于達(dá)到很高的精度，數(shù)字 PCR 結(jié)果可以區(qū)分出含有7個(gè)拷貝和8個(gè)拷貝的樣品。
通過(guò)數(shù)字 PCR 進(jìn)行 KRAS 微量等位基因定量的示例在 QuantStudio 3D 數(shù)字 PCR 系統(tǒng)上，利用針對(duì)數(shù)字 PCR 進(jìn)行了優(yōu)化的定制 TaqMan SNP 基因分型分析檢測(cè) KRAS G12V 突變。
每份樣品的結(jié)果表示突變質(zhì)粒在野生型基因組 DNA 中的比例。0.1%目標(biāo)表示在野生型基因組 DNA 背景中的突變細(xì)胞系中的突變基因組 DNA。所有樣品均使用配備相對(duì)定量模塊的 QuantStudio 3D AnalysisSuite Cloud Software 進(jìn)行分析。(A) 目標(biāo)檢出突變率為10%。突變檢出率為10.384%，置信區(qū)間為8.235–13.076%。(B) 目標(biāo)檢出突變率為1%。突變檢出率為1.393%，置信區(qū)間為0.772–2.507%。(C) 目標(biāo)檢出突變率為0.1%。突變檢出率為0.142%，置信區(qū)間為0.064–0.310%。(D) 野生型對(duì)照樣品。
性能數(shù)據(jù)
| QuantStudio 3D 數(shù)字 PCR 儀器 | |
| 讀取一份樣品的時(shí)間 | 約30秒 |
| PCR 檢測(cè)方法 | 終點(diǎn) |
| 樣品光源 | LED |
| 樣品檢測(cè) | CMOS |
| 檢測(cè)通道 | FAM/SYBR Green、VIC、ROX |
| 讀取器尺寸（高 x 寬 x 深） | 21 x 13.5 x 23.25 cm（8.3 x 5.3 x 9.15 英寸） |
| 重量 | 2.4 kg（5.3磅） |
| QuantStudio 3D 數(shù)字 PCR 20K 芯片 | |
| 分區(qū) | 芯片反應(yīng)孔 |
| 每個(gè)芯片的樣品 | 1 |
| 每個(gè)芯片的目標(biāo) | 2 |
| 熱循環(huán)儀中的芯片容量 | 24 |
| 每份樣品的反應(yīng)孔 | 20,000 |
| 加載體積 | 14.5 μL |
| 密封工作流程 | 是 |
| 性能 | |
| 動(dòng)態(tài)范圍 | 5個(gè)對(duì)數(shù)級(jí) |
| 95%置信區(qū)間的精度 | ±10% |
| 兼容的化學(xué)品 | TaqMan 和 SYBR Green 化學(xué)品 |
