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許多因素可以影響pcr的特異性，在此我們作一歸納，供大家參考：
1、退火步驟的嚴(yán)格性：提高退火溫度可以減少不匹配的雜交，從而提高特異性。
2、減短退火時間及延伸時間可以減少錯誤引發(fā)及錯誤延伸。
3、引物二聚體是最常見的副產(chǎn)品，降低引物及酶的濃度也可以減少錯誤引發(fā)，尤其是引物的二聚化。
4、改變mgcl2(有時kcl)濃度可以改進(jìn)特異性，這可能是提高反應(yīng)嚴(yán)格性或者對taq酶的直接作用。
一般認(rèn)為PCR產(chǎn)物應(yīng)在48h以內(nèi)完成電泳檢測，有些最好于當(dāng)日電泳檢測，大于48h后帶型就會出現(xiàn)不規(guī)則，甚至消失。
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