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PCR的反應(yīng)條件:
因擴增片段的大小、反應(yīng)體積、使用擴增儀器的不同而不同。
◇ 循環(huán)次數(shù)
根據(jù)模板DNA的量以及擴增片段的大小,設(shè)定25~30個循環(huán)。
如果循環(huán)次數(shù)太少,擴增量不足;如果循環(huán)次數(shù)太多,則會出現(xiàn)Smear。
◇ Anneal以及Extension
合適的Anneal溫度通常在45~68℃之間 (預(yù)備實驗可2℃間隔進行)。另外,由于在60~68℃間,也有很高的活性, 因此可在此溫度范圍內(nèi)設(shè)定Anneal-Extension溫度, 進行2 Step PCR。Anneal-Extension溫度為68℃ 時,每kbp大體可設(shè)定30秒~1分鐘;當(dāng)溫度設(shè)定在68℃以下時, 時間設(shè)定可稍長一些。通常,Anneal溫度太高,有時會得不到擴增產(chǎn)物;Anneal溫度太低時,容易發(fā)生非特異性反應(yīng)。另外,Extension時間太短時,會得不到擴增產(chǎn)物或者會有一些短的非特異性產(chǎn)物優(yōu)成;而Extension時間太長時,會出現(xiàn)Smear。
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參數(shù)規(guī)格:
產(chǎn)品名稱:超級細菌耐藥基因(NDM-1)核酸檢測試劑盒
產(chǎn)品規(guī)格:50T
產(chǎn)品貨號:FS-P10239
產(chǎn)品分類:熒光PCR法
產(chǎn)品運輸:低溫運輸
儲存條件:-20℃避光保存,避免反復(fù)凍融。
運輸:低溫、避光,快遞免費送貨上門。
產(chǎn)品特點:
本產(chǎn)品就是根據(jù)保守區(qū)設(shè)計引物而開發(fā)的高靈敏 PCR檢測試劑盒 。
實驗過程:
一、試劑準(zhǔn)備
1. DNA模板
2.對應(yīng)目的基因的特異引物(在PCR反應(yīng)中,新合成的DNA是要接在一小段序列上才能繼續(xù)按照模板DNA復(fù)制,而不能從無到有,憑空合成。這一小段序列就是你所要有設(shè)計的引物??梢允荄NA也可以是RNA,一般20多bp,需要根據(jù)你的模板鏈設(shè)計。因此,擴增不同的基因需要設(shè)計不同的引物)
3.10×PCR Buffer
4.2mM dNTPmix:含dATP、dCTP、dGTP、dTTP各2mM
5.Taq酶
二、操作步驟
1.在冰浴中,按以下次序?qū)⒏鞒煞旨尤胍粺o菌0.5ml離心管中。
10×PCR buffer 5μl
dNTP mixl 4μl
引物1(10pM) 2μl
引物2(10PM) 2μl
Taq酶(2U/μl) 1μl
DNA模板(50ng-1μg/μl) 1 μl
加ddH2O至 50 μl
視PCR儀有無熱蓋,不加或添加石蠟油。
2.調(diào)整好反應(yīng)程序。將上述混合液稍加離心,立即置PCR儀上,執(zhí)行擴增。一般:在93℃預(yù)變性3-5min,進入循環(huán)擴增階段:93℃ 40s → 58℃ 30s → 72℃ 60s,循環(huán)30-35次,zui后在72℃ 保溫7min。
3.結(jié)束反應(yīng),PCR產(chǎn)物放置于4℃待電泳檢測或-20℃長期保存。
4.PCR的電泳檢測:如在反應(yīng)管中加有石蠟油,需用100μlLuFang進行抽提反應(yīng)混合液,以除去石蠟油;否則,直接取5-10μl電泳檢測。
定量PCR方法:
a、競爭法
選擇由突變克隆產(chǎn)生的含有一個新內(nèi)切位點的外源競爭性模板。在同一反應(yīng)管中,待測樣品與競爭模板用同一對引物同時擴增(其中一個引物為熒光標(biāo)記)。擴增后用內(nèi)切酶消化PCR產(chǎn)物,競爭性模板的產(chǎn)物被酶解為兩個片段,而待測模板不被酶切,可通過電泳或高效液相將兩種產(chǎn)物分開,分別測定熒光強度,根據(jù)已知模板推測未知模板的起始拷貝數(shù)。
b、內(nèi)參照法
在不同的PCR反應(yīng)管中加入已定量的內(nèi)標(biāo)和引物,內(nèi)標(biāo)用基因工程方法合成。上游引物用熒光標(biāo)記,下游引物不標(biāo)記。在模板擴增的同時,內(nèi)標(biāo)也被擴增。在PCR產(chǎn)物中,由于內(nèi)標(biāo)與靶模板的長度不同,二者的擴增產(chǎn)物可用電泳或高效液相分離開來,分別測定其熒光強度,以內(nèi)標(biāo)為對照定量待檢測模板。
c、PCR-ELISA法
利用di高辛或生物素等標(biāo)記引物,擴增產(chǎn)物被固相板上特異的探針?biāo)Y(jié)合,再加入抗di高辛或生物素酶標(biāo)抗體-辣根過氧化物酶結(jié)合物,最終酶使底物顯色。常規(guī)的PCR-ELISA法只是定性實驗,若加入內(nèi)標(biāo),作出標(biāo)準(zhǔn)曲線,也可實現(xiàn)定量檢測目的。
實時熒光定量PCR:
實時熒光定量PCR技術(shù)有效地解決了傳統(tǒng)定量只能終點檢測的局限,實現(xiàn)了每一輪循環(huán)均檢測一次熒光信號的強度,并記錄在電腦軟件之中,通過對每個樣品Ct值的計算,根據(jù)標(biāo)準(zhǔn)曲線獲得定量結(jié)果。因此,實時熒光定量PCR無需內(nèi)標(biāo)是建立在兩個基礎(chǔ)之上的:
1)Ct值的重現(xiàn)性PCR循環(huán)在到達Ct值所在的循環(huán)數(shù)時,剛剛進入真正的指數(shù)擴增期(對數(shù)期),此時微小誤差尚未放大,因此Ct值的重現(xiàn)性,即同一模板不同時間擴增或同一時間不同管內(nèi)擴增,得到的Ct值是恒定的。
2)Ct值與起始模板的線性關(guān)系由于Ct值與起始模板的對數(shù)存在線性關(guān)系,可利用標(biāo)準(zhǔn)曲線對未知樣品進行定量測定,因此,實時熒光定量PCR是一種采用外標(biāo)準(zhǔn)曲線定量的方法。
外標(biāo)準(zhǔn)曲線的定量方法相比內(nèi)標(biāo)法是一種準(zhǔn)確的、值得信賴的科學(xué)方法。利用外標(biāo)準(zhǔn)曲線的實時熒光定量PCR是迄今為止定量最準(zhǔn)確,重現(xiàn)性*定量方法,已得到的*,廣泛用于基因表達研究、轉(zhuǎn)基因研究,藥物療效考核、病原體檢測等諸多領(lǐng)域。
米舒青霉培養(yǎng)基: 0013模式菌株: no土壤提供形式: 凍干物安全等級: 1生長條件: 25-28℃ 液氮超低溫凍結(jié)法;真空冷凍干燥法
-164℃冰箱凍結(jié);真空冷凍干燥
IMI265297citrinin模式菌株: no種屬: Penicillium│aurantiogriseum提供形式: 凍干物安全等級: 1培養(yǎng)基: 0015生長條件: 25-28℃
Alternaria constricta培養(yǎng)基: CM0014模式菌株: no莖提供形式: 凍結(jié)物安全等級: 1生長條件: 25C -80℃冰箱凍結(jié);礦物油法
海科貝特氏菌潛在固氮菌研究模式菌株: no水樣/上層海水提供形式: 斜面培養(yǎng)物安全等級: 1培養(yǎng)基: 471生長條件: 25-28℃
抵抗微桿菌培養(yǎng)基: 745有機污染物降解菌/十六烷降解菌;生物活性微生物/表面活性劑沉積物/深海沉積物提供形式: 凍干物模式菌株: no生長條件: 26℃ 液氮超低溫凍結(jié)法;-80℃冰箱凍結(jié)法;真空冷凍干燥法
白色假絲酵母菌培養(yǎng)基: CM0013模式菌株: no痰提供形式: 凍干物安全等級: 2生長條件: 36℃ -80℃冰箱凍結(jié)法
肺炎鏈球菌培養(yǎng)基: CM0109(10%脫纖維羊血營養(yǎng)瓊脂)診斷血清 IV提供形式: 凍干物安全等級: 2模式菌株: no生長條件: 37℃ 真空冷凍干燥法
-165℃冰箱凍結(jié);真空冷凍干燥
出芽短梗霉近海酵母模式菌株: no生物樣/桐花樹/葉提供形式: 斜面培養(yǎng)物安全等級: 1培養(yǎng)基: 513生長條件: 28℃
大腸埃希氏菌培養(yǎng)基: 2主要用于根瘤菌固氮機理的研究提供形式: 凍干物安全等級: 1模式菌株: no生長條件: 37℃ 真空冷凍干燥法;定期移植法
釀酒酵母培養(yǎng)基: CM0013釀造酒精。提供形式: 凍干物安全等級: 1模式菌株: no生長條件: 28-30℃ 真空冷凍干燥法
熒光假單胞菌生長條件: 30℃培養(yǎng)基: 0002提供形式: 凍干物安全等級: 1模式菌株: no 液氮超低溫凍結(jié)法;真空冷凍干燥法
圍小從殼培養(yǎng)基: 14模式菌株: no喜樹提供形式: 斜面培養(yǎng)物安全等級: 1生長條件: 28 定期移植法
擬囊體側(cè)耳生長條件: 25℃培養(yǎng)基: 0017提供形式: 斜面培養(yǎng)物安全等級: 1模式菌株: no 液氮超低溫凍結(jié)法;礦物油法
-166℃冰箱凍結(jié);真空冷凍干燥
CaseinAgar
MR-VP培養(yǎng)基 Methyl Red Voges Proskauer Broth 大腸桿菌的甲基紅和VP試驗(SN標(biāo)準(zhǔn))
磷鹽葡萄糖胨水培養(yǎng)基 Phosphate Glucose Peptone Water Medium 250 甲基紅試驗
CATC瓊脂250g/瓶含TTC,腸球菌的分離和培養(yǎng)incubationmediaCATC瓊脂250g/瓶含TTC,腸球菌的分離和培養(yǎng)
TSIAgar
LB肉湯 LB Broth 250克 分子生物學(xué)實驗中大腸桿菌的保存和培養(yǎng)
LB瓊脂 LB Agar 250克 大腸桿菌增殖
LB-Top Agar LB-Top Agar 250克 大腸桿菌增殖
LB營養(yǎng)瓊脂 LB Nutrient Agar 250克 發(fā)酵工程、基因工程和分子生物學(xué)中大腸桿菌的培養(yǎng)
超級細菌耐藥基因(NDM-1)核酸檢測試劑盒ITC肉湯添加劑規(guī)格:1ml*5用途:每支添加于100mlITC肉湯中
改良V-P培養(yǎng)基規(guī)格:250g用途:用于蠟樣芽孢桿菌的V-P試驗 (SN標(biāo)準(zhǔn))
乙型溶血性鏈球菌規(guī)格:1.8ml瓷珠管用途:即用型,3代工作菌
尿素酶瓊脂基礎(chǔ)規(guī)格:40%尿素水用途:5ml
幽門螺旋桿菌添加劑規(guī)格:1ml*5用途:每支添加于93ml幽門螺旋桿菌培養(yǎng)基中
可溶性淀粉瓊脂規(guī)格:250g用途:用于微生物的淀粉水解試驗
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