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PCR的反應(yīng)條件:
因擴增片段的大小、反應(yīng)體積、使用擴增儀器的不同而不同。
◇ 循環(huán)次數(shù)
根據(jù)模板DNA的量以及擴增片段的大小,設(shè)定25~30個循環(huán)。
如果循環(huán)次數(shù)太少,擴增量不足;如果循環(huán)次數(shù)太多,則會出現(xiàn)Smear。
◇ Anneal以及Extension
合適的Anneal溫度通常在45~68℃之間 (預(yù)備實驗可2℃間隔進行)。另外,由于在60~68℃間,也有很高的活性, 因此可在此溫度范圍內(nèi)設(shè)定Anneal-Extension溫度, 進行2 Step PCR。Anneal-Extension溫度為68℃ 時,每kbp大體可設(shè)定30秒~1分鐘;當(dāng)溫度設(shè)定在68℃以下時, 時間設(shè)定可稍長一些。通常,Anneal溫度太高,有時會得不到擴增產(chǎn)物;Anneal溫度太低時,容易發(fā)生非特異性反應(yīng)。另外,Extension時間太短時,會得不到擴增產(chǎn)物或者會有一些短的非特異性產(chǎn)物優(yōu)成;而Extension時間太長時,會出現(xiàn)Smear。
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參數(shù)規(guī)格:
產(chǎn)品名稱:豬瘟病毒(CSFV)核酸檢測試劑盒
產(chǎn)品規(guī)格:50T
產(chǎn)品貨號:FS-P10305
產(chǎn)品分類:熒光PCR法
產(chǎn)品運輸:低溫運輸
儲存條件:-20℃避光保存,避免反復(fù)凍融。
運輸:低溫、避光,快遞免費送貨上門。
產(chǎn)品特點:
本產(chǎn)品就是根據(jù)保守區(qū)設(shè)計引物而開發(fā)的高靈敏 PCR檢測試劑盒 。
實驗過程:
一、試劑準(zhǔn)備
1. DNA模板
2.對應(yīng)目的基因的特異引物(在PCR反應(yīng)中,新合成的DNA是要接在一小段序列上才能繼續(xù)按照模板DNA復(fù)制,而不能從無到有,憑空合成。這一小段序列就是你所要有設(shè)計的引物??梢允荄NA也可以是RNA,一般20多bp,需要根據(jù)你的模板鏈設(shè)計。因此,擴增不同的基因需要設(shè)計不同的引物)
3.10×PCR Buffer
4.2mM dNTPmix:含dATP、dCTP、dGTP、dTTP各2mM
5.Taq酶
二、操作步驟
1.在冰浴中,按以下次序?qū)⒏鞒煞旨尤胍粺o菌0.5ml離心管中。
10×PCR buffer 5μl
dNTP mixl 4μl
引物1(10pM) 2μl
引物2(10PM) 2μl
Taq酶(2U/μl) 1μl
DNA模板(50ng-1μg/μl) 1 μl
加ddH2O至 50 μl
視PCR儀有無熱蓋,不加或添加石蠟油。
2.調(diào)整好反應(yīng)程序。將上述混合液稍加離心,立即置PCR儀上,執(zhí)行擴增。一般:在93℃預(yù)變性3-5min,進入循環(huán)擴增階段:93℃ 40s → 58℃ 30s → 72℃ 60s,循環(huán)30-35次,zui后在72℃ 保溫7min。
3.結(jié)束反應(yīng),PCR產(chǎn)物放置于4℃待電泳檢測或-20℃長期保存。
4.PCR的電泳檢測:如在反應(yīng)管中加有石蠟油,需用100μlLuFang進行抽提反應(yīng)混合液,以除去石蠟油;否則,直接取5-10μl電泳檢測。
定量PCR方法:
a、競爭法
選擇由突變克隆產(chǎn)生的含有一個新內(nèi)切位點的外源競爭性模板。在同一反應(yīng)管中,待測樣品與競爭模板用同一對引物同時擴增(其中一個引物為熒光標(biāo)記)。擴增后用內(nèi)切酶消化PCR產(chǎn)物,競爭性模板的產(chǎn)物被酶解為兩個片段,而待測模板不被酶切,可通過電泳或高效液相將兩種產(chǎn)物分開,分別測定熒光強度,根據(jù)已知模板推測未知模板的起始拷貝數(shù)。
b、內(nèi)參照法
在不同的PCR反應(yīng)管中加入已定量的內(nèi)標(biāo)和引物,內(nèi)標(biāo)用基因工程方法合成。上游引物用熒光標(biāo)記,下游引物不標(biāo)記。在模板擴增的同時,內(nèi)標(biāo)也被擴增。在PCR產(chǎn)物中,由于內(nèi)標(biāo)與靶模板的長度不同,二者的擴增產(chǎn)物可用電泳或高效液相分離開來,分別測定其熒光強度,以內(nèi)標(biāo)為對照定量待檢測模板。
c、PCR-ELISA法
利用di高辛或生物素等標(biāo)記引物,擴增產(chǎn)物被固相板上特異的探針?biāo)Y(jié)合,再加入抗di高辛或生物素酶標(biāo)抗體-辣根過氧化物酶結(jié)合物,最終酶使底物顯色。常規(guī)的PCR-ELISA法只是定性實驗,若加入內(nèi)標(biāo),作出標(biāo)準(zhǔn)曲線,也可實現(xiàn)定量檢測目的。
實時熒光定量PCR:
實時熒光定量PCR技術(shù)有效地解決了傳統(tǒng)定量只能終點檢測的局限,實現(xiàn)了每一輪循環(huán)均檢測一次熒光信號的強度,并記錄在電腦軟件之中,通過對每個樣品Ct值的計算,根據(jù)標(biāo)準(zhǔn)曲線獲得定量結(jié)果。因此,實時熒光定量PCR無需內(nèi)標(biāo)是建立在兩個基礎(chǔ)之上的:
1)Ct值的重現(xiàn)性PCR循環(huán)在到達Ct值所在的循環(huán)數(shù)時,剛剛進入真正的指數(shù)擴增期(對數(shù)期),此時微小誤差尚未放大,因此Ct值的重現(xiàn)性,即同一模板不同時間擴增或同一時間不同管內(nèi)擴增,得到的Ct值是恒定的。
2)Ct值與起始模板的線性關(guān)系由于Ct值與起始模板的對數(shù)存在線性關(guān)系,可利用標(biāo)準(zhǔn)曲線對未知樣品進行定量測定,因此,實時熒光定量PCR是一種采用外標(biāo)準(zhǔn)曲線定量的方法。
外標(biāo)準(zhǔn)曲線的定量方法相比內(nèi)標(biāo)法是一種準(zhǔn)確的、值得信賴的科學(xué)方法。利用外標(biāo)準(zhǔn)曲線的實時熒光定量PCR是迄今為止定量最準(zhǔn)確,重現(xiàn)性*定量方法,已得到的*,廣泛用于基因表達研究、轉(zhuǎn)基因研究,藥物療效考核、病原體檢測等諸多領(lǐng)域。
ivcas7.01205模式菌株: no安全等級: 2種屬: Bacillus│cereus牛奶提供形式: 凍干物培養(yǎng)基: 0002生長條件: 30℃
IFFI3078培養(yǎng)基: 50釀酒種屬: RhzopusarrhizusFisher安全等級: 1模式菌株: no生長條件: 28-30℃
發(fā)酵乳桿菌培養(yǎng)基: MRS培養(yǎng)基:酪胨 10.0g,牛肉粉 8.0g,酵母粉 4.0 g,葡萄糖 20.0 g,硫鎂 0.2 g,乙鈉 5.0 g,檸檬三銨 2.0 g,磷氫二鉀 2.0 g,硫錳 0.05 g,吐溫80 1.0 g,蒸餾水 1000mL。pH6.2±0.2。121℃,15min。模式菌株: no奶提供形式: 凍干物安全等級: 1生長條件: 37℃,微好氧 真空冷凍干燥法
-274℃冰箱凍結(jié);真空冷凍干燥
鏈霉菌分類學(xué)及微生物藥物學(xué)的研究模式菌株: no表面土壤提供形式: 其他安全等級: 1培養(yǎng)基: 12生長條件: 28℃
果生鏈核盤菌培養(yǎng)基: 14模式菌株: no自然發(fā)病果提供形式: 斜面培養(yǎng)物安全等級: 1生長條件: 22-25 定期移植法
米曲霉酒精糖化用。模式菌株: no酒曲提供形式: 凍干物安全等級: 1培養(yǎng)基: CM0085生長條件: 28-30℃
產(chǎn)氣腸桿菌培養(yǎng)基: 2模式菌株: no污泥提供形式: 凍干物安全等級: 1生長條件: 30℃ -80℃冰箱凍結(jié)法;真空冷凍干燥法
黑曲霉培養(yǎng)基: CM0013產(chǎn)檸檬。提供形式: 斜面培養(yǎng)物安全等級: 1模式菌株: no生長條件: 35℃ 礦物油法
黑木耳培養(yǎng)基: 14分類學(xué)研究,栽培農(nóng)藝性狀研究提供形式: 斜面培養(yǎng)物安全等級: 1模式菌株: no生長條件: 25℃ 定期移植法
-275℃冰箱凍結(jié);真空冷凍干燥
黑沙假單胞菌潛在的有機污染物降解菌/分離自原油富集菌群模式菌株: no水樣/深海底層水樣提供形式: 斜面培養(yǎng)物安全等級: 1培養(yǎng)基: 1001生長條件: 28℃
圈卷產(chǎn)色鏈霉菌淺色變種生長條件: 28℃培養(yǎng)基: 0014提供形式: 凍干物安全等級: 1模式菌株: no 液氮超低溫凍結(jié)法;真空冷凍干燥法
地衣芽胞桿菌微生物/高溫菌(55℃)模式菌株: no沉積物/深海沉積物提供形式: 凍干物安全等級: 1培養(yǎng)基: 823生長條件: 55℃
大腸埃希氏菌培養(yǎng)基: 2主要用于根瘤菌固氮機理的研究及構(gòu)建生態(tài)安全性菌株提供形式: 凍干物安全等級: 1模式菌株: no生長條件: 37℃ 真空冷凍干燥法;定期移植法
3,15(3,15),34 y 1,5模式菌株: no種屬: Salmonella│thomasville提供形式: 凍干物安全等級: 2培養(yǎng)基: CM0051生長條件: 37℃
MUGNutrientAgar
MCP瓊脂 MCP Agar 產(chǎn)氣莢膜梭菌的計數(shù)和培養(yǎng)
華倫斯坦實驗室營養(yǎng)瓊脂 WL Nutrient Agar 250克 啤酒和發(fā)酵產(chǎn)品中酵母菌和細菌的計數(shù)
腸球菌瓊脂(膽鹽-七葉苷-疊鈉瓊脂)250腸球菌和腸道致病菌的分離培養(yǎng)(Acumedia方法)incubationmedia腸球菌瓊脂(膽鹽-七葉苷-疊鈉瓊脂)250腸球菌和腸道致病菌的分離培養(yǎng)(Acumedia方法)
ManitolSaltAgar
木糖-明膠培養(yǎng)基發(fā)酵管 木糖-明膠培養(yǎng)基發(fā)酵管 20支 BR
七葉苷發(fā)酵管 七葉苷發(fā)酵管 20支 BR
水楊苷發(fā)酵管 水楊苷發(fā)酵管 20支 BR
OF發(fā)酵管 OF發(fā)酵管 20支 BR
豬瘟病毒(CSFV)核酸檢測試劑盒腦心浸液肉湯(BHI)規(guī)格:250g用途:用于營養(yǎng)苛求細菌的增菌培養(yǎng)
沙氏瓊脂培養(yǎng)基(SDA)規(guī)格:250g用途:用于醫(yī)藥工業(yè)潔凈室(區(qū))沉降菌中霉菌酵母菌的測試(GB/T 16294-2010)
衛(wèi)矛醇(甜醇)規(guī)格:10g用途:微生物指示劑
含青霉素酶接觸皿培養(yǎng)基平板(6.5cm)規(guī)格:10個/包用途:用于環(huán)境、器皿、設(shè)備和表面的無菌檢測
液體硫乙醇鹽培養(yǎng)基規(guī)格:300ml/袋*10用途:用于藥品,生物制品無菌試驗,用于需氧菌、厭氧菌的培養(yǎng)
PLET 瓊脂基礎(chǔ)規(guī)格:250g用途:用于炭疽桿菌的分離鑒別
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