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實(shí)時熒光定量PCR:
實(shí)時熒光定量PCR技術(shù)有效地解決了傳統(tǒng)定量只能終點(diǎn)檢測的局限,實(shí)現(xiàn)了每一輪循環(huán)均檢測一次熒光信號的強(qiáng)度,并記錄在電腦軟件之中,通過對每個樣品Ct值的計算,根據(jù)標(biāo)準(zhǔn)曲線獲得定量結(jié)果。因此,實(shí)時熒光定量PCR無需內(nèi)標(biāo)是建立在兩個基礎(chǔ)之上的:
1)Ct值的重現(xiàn)性PCR循環(huán)在到達(dá)Ct值所在的循環(huán)數(shù)時,剛剛進(jìn)入真正的指數(shù)擴(kuò)增期(對數(shù)期),此時微小誤差尚未放大,因此Ct值的重現(xiàn)性,即同一模板不同時間擴(kuò)增或同一時間不同管內(nèi)擴(kuò)增,得到的Ct值是恒定的。
2)Ct值與起始模板的線性關(guān)系由于Ct值與起始模板的對數(shù)存在線性關(guān)系,可利用標(biāo)準(zhǔn)曲線對未知樣品進(jìn)行定量測定,因此,實(shí)時熒光定量PCR是一種采用外標(biāo)準(zhǔn)曲線定量的方法。
外標(biāo)準(zhǔn)曲線的定量方法相比內(nèi)標(biāo)法是一種準(zhǔn)確的、值得信賴的科學(xué)方法。利用外標(biāo)準(zhǔn)曲線的實(shí)時熒光定量PCR是迄今為止定量最準(zhǔn)確,重現(xiàn)性*定量方法,已得到的*,廣泛用于基因表達(dá)研究、轉(zhuǎn)基因研究,藥物療效考核、病原體檢測等諸多領(lǐng)域。
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參數(shù)規(guī)格:
產(chǎn)品名稱:非洲豬瘟(ASFV)核酸檢測試劑盒
產(chǎn)品規(guī)格:50T
產(chǎn)品貨號:FS-P10298
產(chǎn)品分類:熒光PCR法
產(chǎn)品運(yùn)輸:低溫運(yùn)輸
儲存條件:-20℃避光保存,避免反復(fù)凍融。
運(yùn)輸:低溫、避光,快遞免費(fèi)送貨上門。
產(chǎn)品特點(diǎn):
本產(chǎn)品就是根據(jù)保守區(qū)設(shè)計引物而開發(fā)的高靈敏 PCR檢測試劑盒 。
實(shí)驗(yàn)過程:
一、試劑準(zhǔn)備
1. DNA模板
2.對應(yīng)目的基因的特異引物(在PCR反應(yīng)中,新合成的DNA是要接在一小段序列上才能繼續(xù)按照模板DNA復(fù)制,而不能從無到有,憑空合成。這一小段序列就是你所要有設(shè)計的引物??梢允荄NA也可以是RNA,一般20多bp,需要根據(jù)你的模板鏈設(shè)計。因此,擴(kuò)增不同的基因需要設(shè)計不同的引物)
3.10×PCR Buffer
4.2mM dNTPmix:含dATP、dCTP、dGTP、dTTP各2mM
5.Taq酶
二、操作步驟
1.在冰浴中,按以下次序?qū)⒏鞒煞旨尤胍粺o菌0.5ml離心管中。
10×PCR buffer 5μl
dNTP mixl 4μl
引物1(10pM) 2μl
引物2(10PM) 2μl
Taq酶(2U/μl) 1μl
DNA模板(50ng-1μg/μl) 1 μl
加ddH2O至 50 μl
視PCR儀有無熱蓋,不加或添加石蠟油。
2.調(diào)整好反應(yīng)程序。將上述混合液稍加離心,立即置PCR儀上,執(zhí)行擴(kuò)增。一般:在93℃預(yù)變性3-5min,進(jìn)入循環(huán)擴(kuò)增階段:93℃ 40s → 58℃ 30s → 72℃ 60s,循環(huán)30-35次,zui后在72℃ 保溫7min。
3.結(jié)束反應(yīng),PCR產(chǎn)物放置于4℃待電泳檢測或-20℃長期保存。
4.PCR的電泳檢測:如在反應(yīng)管中加有石蠟油,需用100μlLuFang進(jìn)行抽提反應(yīng)混合液,以除去石蠟油;否則,直接取5-10μl電泳檢測。
定量PCR方法:
a、競爭法
選擇由突變克隆產(chǎn)生的含有一個新內(nèi)切位點(diǎn)的外源競爭性模板。在同一反應(yīng)管中,待測樣品與競爭模板用同一對引物同時擴(kuò)增(其中一個引物為熒光標(biāo)記)。擴(kuò)增后用內(nèi)切酶消化PCR產(chǎn)物,競爭性模板的產(chǎn)物被酶解為兩個片段,而待測模板不被酶切,可通過電泳或高效液相將兩種產(chǎn)物分開,分別測定熒光強(qiáng)度,根據(jù)已知模板推測未知模板的起始拷貝數(shù)。
b、內(nèi)參照法
在不同的PCR反應(yīng)管中加入已定量的內(nèi)標(biāo)和引物,內(nèi)標(biāo)用基因工程方法合成。上游引物用熒光標(biāo)記,下游引物不標(biāo)記。在模板擴(kuò)增的同時,內(nèi)標(biāo)也被擴(kuò)增。在PCR產(chǎn)物中,由于內(nèi)標(biāo)與靶模板的長度不同,二者的擴(kuò)增產(chǎn)物可用電泳或高效液相分離開來,分別測定其熒光強(qiáng)度,以內(nèi)標(biāo)為對照定量待檢測模板。
c、PCR-ELISA法
利用di高辛或生物素等標(biāo)記引物,擴(kuò)增產(chǎn)物被固相板上特異的探針?biāo)Y(jié)合,再加入抗di高辛或生物素酶標(biāo)抗體-辣根過氧化物酶結(jié)合物,最終酶使底物顯色。常規(guī)的PCR-ELISA法只是定性實(shí)驗(yàn),若加入內(nèi)標(biāo),作出標(biāo)準(zhǔn)曲線,也可實(shí)現(xiàn)定量檢測目的。
PCR的反應(yīng)條件:
因擴(kuò)增片段的大小、反應(yīng)體積、使用擴(kuò)增儀器的不同而不同。
◇ 循環(huán)次數(shù)
根據(jù)模板DNA的量以及擴(kuò)增片段的大小,設(shè)定25~30個循環(huán)。
如果循環(huán)次數(shù)太少,擴(kuò)增量不足;如果循環(huán)次數(shù)太多,則會出現(xiàn)Smear。
◇ Anneal以及Extension
合適的Anneal溫度通常在45~68℃之間 (預(yù)備實(shí)驗(yàn)可2℃間隔進(jìn)行)。另外,由于在60~68℃間,也有很高的活性, 因此可在此溫度范圍內(nèi)設(shè)定Anneal-Extension溫度, 進(jìn)行2 Step PCR。Anneal-Extension溫度為68℃ 時,每kbp大體可設(shè)定30秒~1分鐘;當(dāng)溫度設(shè)定在68℃以下時, 時間設(shè)定可稍長一些。通常,Anneal溫度太高,有時會得不到擴(kuò)增產(chǎn)物;Anneal溫度太低時,容易發(fā)生非特異性反應(yīng)。另外,Extension時間太短時,會得不到擴(kuò)增產(chǎn)物或者會有一些短的非特異性產(chǎn)物優(yōu)成;而Extension時間太長時,會出現(xiàn)Smear。
黑孢霉培養(yǎng)基: 0014模式菌株: no華山松皰銹病感病植株樹皮提供形式: 凍干物安全等級: 1生長條件: 25℃ 液氮超低溫凍結(jié)法;真空冷凍干燥法
釀酒酵母培養(yǎng)基: CM0013制酒精。提供形式: 凍干物安全等級: 1模式菌株: no生長條件: 25-28℃ 真空冷凍干燥法
CCTCCAA97021模式菌株模式菌株: yes種屬: Saccharomonospora│xinjiangensis提供形式: 凍干物安全等級: 1培養(yǎng)基: 0234生長條件: 28℃
-258℃冰箱凍結(jié);真空冷凍干燥
曲霉培養(yǎng)基: 475大洋絲狀真菌水樣/下層海水提供形式: 斜面培養(yǎng)物模式菌株: no生長條件: 25℃ 液氮超低溫凍結(jié)法;-80℃冰箱凍結(jié)法;真空冷凍干燥法
肺炎克雷伯氏菌 -80℃冰箱凍結(jié)法;真空冷凍干燥法生長條件: 22℃提供形式: 凍干物;凍結(jié)物模式菌株: no培養(yǎng)基: 820
高地芽孢桿菌培養(yǎng)基: 820模式菌株: no土壤提供形式: 凍干物安全等級: 1生長條件: 29℃ 真空冷凍干燥法
產(chǎn)黃青霉培養(yǎng)基: 475研究水樣/深層海水提供形式: 斜面培養(yǎng)物模式菌株: no生長條件: 25℃ 液氮超低溫凍結(jié)法;-80℃冰箱凍結(jié)法;真空冷凍干燥法
蠟狀芽孢桿菌飼料添加劑模式菌株: no炒山楂提供形式: 斜面培養(yǎng)物安全等級: 1培養(yǎng)基: 33生長條件: 37℃
根瘤菌固氮模式菌株: no長豇豆根瘤提供形式: 斜面培養(yǎng)物安全等級: 1培養(yǎng)基: 63生長條件: 28-30
-259℃冰箱凍結(jié);真空冷凍干燥
LMG24574模式菌株: yes安全等級: 1種屬: Donghicola│xiamenensis海水提供形式: 凍干物模式菌株培養(yǎng)基: 223
鏈霉菌屬菌種生長條件: 28C培養(yǎng)基: CM0027提供形式: 凍干物安全等級: 1模式菌株: no -80℃冰箱凍結(jié);真空冷凍干燥
嗜寡養(yǎng)單胞菌用于提高石油采收率模式菌株: no油田油水樣提供形式: 斜面培養(yǎng)物;凍干物安全等級: 1培養(yǎng)基: 2生長條件: 37℃
芽胞桿菌培養(yǎng)基: 745潛在的有機(jī)污染物降解菌/分離自石油降解菌群水樣/表層海水提供形式: 斜面培養(yǎng)物模式菌株: no生長條件: 28℃ 液氮超低溫凍結(jié)法;-80℃冰箱凍結(jié)法;真空冷凍干燥法
棒形小克銀漢霉培養(yǎng)基: 0014模式菌株提供形式: 凍干物安全等級: 1模式菌株: yes生長條件: 25-28℃ 液氮超低溫凍結(jié)法;真空冷凍干燥法
GetrimideAgarMedium
MEE肉湯 250(g) incubation media MEE肉湯 250(g)
葡萄糖銨培養(yǎng)基 Ammonium Dextrose Medium 250克 志賀氏菌的葡萄糖銨試驗(yàn)
WL營養(yǎng)瓊脂250啤酒和發(fā)酵產(chǎn)品中酵母菌和細(xì)菌的計數(shù)incubationmediaWL營養(yǎng)瓊脂250啤酒和發(fā)酵產(chǎn)品中酵母菌和細(xì)菌的計數(shù)
ThiosulfateCitrateBileSaltsSucroseAgar
麥芽糖發(fā)酵管 麥芽糖發(fā)酵管 20支 BR
乳糖發(fā)酵管 乳糖發(fā)酵管 20支 BR
1% NaC1乳糖發(fā)酵管 1% NaC1乳糖發(fā)酵管 20支 BR
3% NaC1乳糖發(fā)酵管 3% NaC1乳糖發(fā)酵管 20支 BR
非洲豬瘟(ASFV)核酸檢測試劑盒無菌采樣袋(12cm*18cm)(帶壓條)規(guī)格:100個/包用途:用于樣品的采樣(小號采樣袋)
青霉素敏感紙片規(guī)格:20片用途:炭疽桿菌檢測用配套試劑
吖啶黃素(2.25mg)規(guī)格:1ml/支*5用途:每支添加于225ml HB4186中
細(xì)菌蛋白胨規(guī)格:250g用途:培養(yǎng)基原材料,提供細(xì)菌生長所需的生長因子
無機(jī)磷細(xì)菌培養(yǎng)基規(guī)格:250g用途:用于測定磷細(xì)菌肥料中磷細(xì)菌分解無機(jī)磷的效能
WLN培養(yǎng)基規(guī)格:250g用途:用于釀造和工業(yè)發(fā)酵過程中細(xì)菌、酵母菌和霉菌培養(yǎng)
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