CUT&RUN（Cleavage Under Targets and Release Using Nuclease）在細(xì)胞內(nèi)利用抗體靶向定位目標(biāo)蛋白, 再由pA/G-微球菌核酸酶（Micrococcal nucleasel, MNase）對(duì)目標(biāo)蛋白兩端的DNA進(jìn)行切割，從而將目標(biāo)蛋白質(zhì)-DNA復(fù)合物釋放到細(xì)胞外。
作為ChIP的高效替代方案, CUT&RUN技術(shù)在蛋白質(zhì)-DNA研究中將會(huì)被越來越廣泛地使用。以下為CUT&RUN與Chip-seq對(duì)比圖：
圖：分別對(duì)K-562細(xì)胞的H3K4me3和H3K27me3所結(jié)合的DNA進(jìn)行測(cè)序，用于ChIP的細(xì)胞數(shù)量為2000萬,用于 CUT&RUN的細(xì)胞數(shù)為50萬。對(duì)測(cè)序結(jié)果進(jìn)行分析，CUT&RUN有著 靈敏度和信噪比，測(cè)序深度減少了10倍以上，細(xì)胞的需求減少了40倍。
艾美捷 EpiGentek EpiNext CUT＆RUN快速套件,以優(yōu)惠價(jià)格從低輸入提供無超聲破碎，以可靠地識(shí)別真正的目標(biāo)蛋白質(zhì)富集區(qū)域并實(shí)現(xiàn)高分辨率定位?？蓾M足用戶快速富集蛋白質(zhì)結(jié)合的DNA并繪制全基因組蛋白質(zhì)/DNA相互作用的圖譜的需求。
EpiNext CUT＆RUN快速套件包含執(zhí)行測(cè)試所需的所有必要試劑從哺乳動(dòng)物細(xì)胞或分離的細(xì)胞核/染色質(zhì)開始成功切割和運(yùn)行。在反應(yīng)中,，細(xì)胞核是從細(xì)胞中分離出來的。靶蛋白DNA復(fù)合物與芯片級(jí)結(jié)合/捕獲感興趣的抗體。使用*的核酸裂解酶混合物，染色質(zhì)片段化，目標(biāo)蛋白質(zhì)/DNA復(fù)合物兩端的DNA序列劈開/移除。同時(shí)，目標(biāo)蛋白占據(jù)的DNA序列不受影響。然后純化和洗脫靶蛋白結(jié)合的DNA。富集的DNA可用于用各種方法分析蛋白質(zhì)與DNA的相互作用，特別是下一代測(cè)序。試劑盒中包括陽性對(duì)照抗體（抗H3K9me3），陰性對(duì)照非免疫IgG，和對(duì)照染色質(zhì)，可用于證明試劑盒的有效性和現(xiàn)場(chǎng)性能PCR/生物分析儀步驟。
