主導產(chǎn)品:二氧化氯發(fā)生器|自來水廠消毒設備|醫(yī)院污水處理設備|小區(qū)污水一體化處理設備|游泳池水消毒設備|等專業(yè)水消毒殺菌設備。
鄭州市牙科醫(yī)院污水處理設備生產(chǎn)型號配置
實驗室AO反應器流程圖
1.2 DNA提取及PCR擴增
DNA提取采用PowerSoil® DNA Isolation Kit試劑盒,按照試劑盒流程提取DNA。以所提取各樣品DNA為模版,對其16S rDNA V4區(qū)擴增。反應體系為30 μL,上游引物為EUb341f:5′-cctacgggaggcagcag-3′,下游引物為Eub907r:5′-ccgtcaattcctttgagttt-3′。PCR擴增管中添加DNA模板0.5 μL,正反向引物各0.6 μL,滅菌水22.4 μL,dNTP 2.4 μL,3 μL緩沖液,ExTaq酶0.5 μL。PCR反應程序:先94 ℃預變性10 min,然后進行30個循環(huán)(94 ℃變性1 min,55 ℃退火1 min,72 ℃延伸1 min),Z后72 ℃延伸10 min。
擴增結(jié)束后,運用1%瓊脂糖凝膠電泳對PCR產(chǎn)物進行檢測,使用Axyprep DNA凝膠回收試劑盒(AXYGEN)切膠回收DNA。PCR擴增后的條帶亮度明顯,位置清晰,可直接用于后續(xù)測序分析。委托北京理化分析測試中心進行Illumina MiSeq高通量測序。
高通量測序數(shù)據(jù)分析
本研究采用Illumina MiSeq PE2 × 125測序方法進行測序。測序數(shù)據(jù)下機后,根據(jù)Barcode拆分不同樣本數(shù)據(jù),并去除Barcode序列及引物序列,利用FastQC對序列進行質(zhì)量控制。使用FLASH(v1.2.7,ccb.jhu.edu/software/FLASH/)根據(jù)overlap拼接Miseq雙端測序數(shù)據(jù),拼接成功率控制在90%以上。利用QIIME(1.8,qiime.org/)過濾低質(zhì)量序列,利用UCLUST對獲得的高質(zhì)量序列進行操作分類單元(OTU)劃分,97%作為相似性閾值,并將獲得的OTU與SILVA非冗余度0.9的16S序列數(shù)據(jù)庫比對,獲得各OTU代表序列的分類信息。基于OTU的聚類結(jié)果,使用QIIME(1.8,qiime.org/)軟件計算各個樣本α多樣性,以反映本次測序深度、物種均勻性等,并根據(jù)注釋結(jié)果,計算樣本間距離矩陣,進行PCA可視化。利用ANOVA(analysis of variance)方法計算污水廠與反應器中門和綱水平上物種注釋的豐度差異情況。利用冗余分析(RDA)解析微生物與環(huán)境因子的相關(guān)性。實驗設計原始數(shù)據(jù)上傳NCBI網(wǎng)zhan,數(shù)據(jù)項目編號(BioSample accession)為SAMN08107549。
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