PicoTwist單分子操縱磁鑷裝置 PicoTwist磁鑷裝置是基于的倒置顯微鏡,安裝在電動(dòng)平移和旋轉(zhuǎn)平臺(tái)的一套強(qiáng)大的單分子操縱磁鑷裝置。PicoTwist磁鑷裝置的原理是通過梯度分布的磁場(chǎng)對(duì)處于其中的可磁化小珠施力, 觀察并分析其運(yùn)動(dòng)。該磁鑷裝置使用一對(duì)強(qiáng)大的稀土磁鐵 (BdFeB)來使磁珠磁化強(qiáng)度能夠達(dá)到飽和值。由于應(yīng)用了高精度的溫度控制裝置、特殊的樣品固定裝置、保證磁珠快速旋轉(zhuǎn)的步進(jìn)電機(jī)和靈活管理的計(jì)算機(jī)軟件系統(tǒng)以及萬(wàn)像素的CCD相機(jī),可以同時(shí)實(shí)現(xiàn)多達(dá)40個(gè)單個(gè)分子的視頻采集和跟蹤測(cè)量,大大提單分子的高通量分析和統(tǒng)計(jì)水平。
中國(guó)代理服務(wù)商:北京思睿維科技有限公司 馬金龍 系統(tǒng)亮點(diǎn)概述 (1)極其穩(wěn)定健壯—PicoTwist單分子操縱磁鑷裝置具有非常低的圖像漂移設(shè)計(jì)
圖2一般商業(yè)顯微鏡和PicoTwist經(jīng)歷相同的熱環(huán)境過程中焦點(diǎn)位置漂移的比較 (2)高分辨率、力的范圍廣—具有非常薄的樣品固定裝置
圖3 PicoTwist樣品固定裝置 (3)可以同時(shí)實(shí)現(xiàn)多達(dá)40個(gè)單個(gè)分子的視頻采集和跟蹤測(cè)量,大大提單分子的高通量分析和統(tǒng)計(jì)水平。 (4)使用一對(duì)強(qiáng)大的磁鐵來控制 DNA 伸展和超螺旋 圖4 PicoTwist磁極控制磁珠過程示意圖
(5)并行的照明和攝像頭
圖5 通過磁珠圖像產(chǎn)生衍射環(huán)來計(jì)算磁珠的z軸位置 (6)配備磁珠跟蹤軟件,可實(shí)時(shí)進(jìn)行數(shù)據(jù)分析
圖6 磁珠跟蹤軟件工作界面 3、適用范圍 生物單分子研究將成為 21 世紀(jì)生命科學(xué)領(lǐng)域的一個(gè)重點(diǎn)研究方向,在生命科學(xué)領(lǐng)域有著廣泛的應(yīng)用前景。磁鑷是單分子研究的一種方法,PicoTwist單分子操縱磁鑷裝置通過磁場(chǎng)控制超順磁性小珠的移動(dòng),然后用這個(gè)小珠捕捉單分子,并進(jìn)行相關(guān)的力學(xué)實(shí)驗(yàn)。其主要的應(yīng)用范圍包括: 在單分子水平上對(duì)生物分子行為(包括構(gòu)象變化、相互作用、相互識(shí)別等)的實(shí)時(shí)﹑動(dòng)態(tài)檢測(cè)以及在此基礎(chǔ)上的操縱﹑調(diào)控等; 對(duì)單個(gè)生物大分子施以力或力矩,并測(cè)量它們的物理性質(zhì)(如DNA彈性、蛋白質(zhì)的力學(xué)變性等); 對(duì)單個(gè)生物大分子施以力或力矩,測(cè)量它們的力學(xué)生化反應(yīng)(如分子馬達(dá)); 研究機(jī)械力的作用如何影響細(xì)胞的生長(zhǎng)、分裂、運(yùn)動(dòng)、粘附以及信號(hào)的傳輸,基因的表達(dá); 在生物大分子上施加力以使之發(fā)生構(gòu)像上的變化,研究生物單分子形成新的結(jié)構(gòu),以及力學(xué)以及動(dòng)力學(xué)之間的相互等。 研究各種藥物可能導(dǎo)致的DNA、蛋白質(zhì)凝聚、變性過程; 給出分子實(shí)時(shí)行為與性質(zhì)的分布,有效避免對(duì)集群測(cè)量苛刻的同步(synchronization)要求,如DNA的解鏈(unzipping)、蛋白質(zhì)的折疊(folding)等 更多的科研Idea………
4、參數(shù)
圖7 PicoTwist部分組件的參數(shù) 5、使用方法 樣品(如DNA)的一端連接在直徑1um的超順磁性小球上,另一端連接在樣品固定裝置中的玻璃表面上。兩塊釹鐵硼磁鐵置于樣品上方,當(dāng)移動(dòng)磁鐵接近樣品時(shí),通過超順磁性小球給樣品施加皮牛級(jí)的拉力,同時(shí)旋轉(zhuǎn)小磁鐵可以向樣品施加扭轉(zhuǎn)應(yīng)力.小球的位置通過一臺(tái)倒置顯微鏡以大于60Hz的采樣頻率記錄. 測(cè)量樣品,如DNA 的力拉伸曲線、DNA長(zhǎng)度與小磁鐵旋轉(zhuǎn)圈數(shù)關(guān)系曲線、計(jì)算得到DNA 超螺旋結(jié)構(gòu),形成DNA超螺旋閾值處的結(jié)合和解離動(dòng)力學(xué)等。 參考文獻(xiàn) A. Dawid, F. Guillemot, C. Breme, V. Croquette, F. Heslot, Mechanically controlled DNA extrusion from a palindromic sequence by single molecule micromanipulation. Phys. Rev. Lett. (2006) 96-18 p. G. Lia, E. Praly, HA. Ferreira, C. Stockdale, YC. Tse-dinh, D. Dunlap, V. Croquette, D. Bensimon, T. Owen-hughes, Direct observation of DNA distortion by the RSC complex. Mol. Cell (2006) 21-3 p.417 R. Seidel, JGP. Bloom, J. Van Noort, CF. Dutta, NH. Dekker, K. Firman, MD. Szczelkun, C. Dekker, Dynamics of initiation, termination and reinitiation of DNA translocation by the motor protein EcoR124I. Embo J. (2005) 24-23 p.4188 KC. Neuman, OA. Saleh, T. Lionnet, G. Lia, JF. Allemand, D. Bensimon, V. Croquette,Statistical determination of the step size of molecular motors. J. Phys.-Condes. Matter (2005) 17-47 p.S3811 G. Charvin, TR. Strick, D. Bensimon, V. Croquette, Topoisomerase IV bends and overtwists DNA upon binding. Biophys. J. (2005) 89-1 p.384 H. Shroff, BM. Reinhard, M. Siu, H. Agarwal, A. Spakowitz, J. Liphardt, Biocompatible force sensor with optical readout and dimensions of 6 nm(3). Nano Lett. (2005) 5-7 p.1509 G. Charvin, A. Vologodskii, D. Bensimon, V. Croquette, Braiding DNA: Experiments, simulations, and models. Biophys. J. (2005) 88-6 p.4124 OA. Saleh, JF. Allemand, V. Croquette, D. Bensimon, Single-molecule manipulation measurements of DNA transport proteins. Chem. Phys. Chem. (2005) 6-5 p.813 DA. Koster, V. Croquette, C. Dekker, S. Shuman, NH. Dekker, Friction and torque govern he relaxation of DNA supercoils by eukaryotic topoisomerase IB. Nature (2005) 434-7033 p.671 A. Revyakin, RH. Ebright, TR. Strick, Single-molecule DNA nanomanipulation: Improved resolution through use of shorter DNA fragments. Nat. Methods (2005) 2-2 p.127 KC. Neuman, G. Charvin, D. Bensimon, V. Croquette,Single-molecule study of DNA unlinking by topoisomerase IV: Influence of the crossing angle. Biophys. J. (2005) 88-1 p.15A J. Gore, MD. Stone, Z. Bryant, NJ. Crisona, S. Miheiser, A. Maxwell, NR. Cozzarelli, C. Bustamante, Single molecule investigations of the mechanochemical cycle of DNA gyrase. Biophys. J. (2005) 88-1 p.184A D. Koster, S. Shuman, C. Dekker, NH. Dekker, Topoisomerase 1B: its mechanism and interactions with spinning DNA studied at the single molecule level. Biophys. J. (2005) 88-1 p.381A JA. Abels, F. Moreno-herrero, T. Van Der Heijden, PTM. Veenhuizen, MM. Bruinink, C. Dekker, NH. Dekker, Single-molecule measurements of the persistence length of double-stranded RNA. Biophys. J. (2005) 88-1 p.570A D. Ristic, M. Modesti, T. Van Der Heijden, J. Van Noort, C. Dekker, R. Kanaar, C. Wyman,Human Rad51 filaments on double- and single-stranded DNA: correlating regular and irregular forms with recombination function. Nucleic Acids Res. (2005) 33-10 p.3292 S. Neukirch, Extracting DNA twist rigidity from experimental supercoiling data. Phys. Rev. Lett. (2004) 93-19 p. D. Skoko, B. Wong, RC. Johnson, JF. Marko, Micromechanical analysis of the binding of DNA-bending proteins HMGB1, NHP6A, and HU reveals their ability to form highly stable DNA-protein complexes. Biochemistry (2004) 43-43 p.13867 BD. Matthews, DA. Lavan, DR. Overby, J. Karavitis, DE. Ingber, Electromagnetic needles with submicron pole tip radii for nanomanipulation of biomolecules and living cells. Appl. Phys. Lett. (2004) 85-14 p.2968 Y. Harada, Studies on biomolecules using single molecule imaging and manipulation techniques. Sci. Technol. Adv. Mater. (2004) 5-5-6 p.709 附件: 現(xiàn)在已經(jīng)有很多單分子的操縱技術(shù):原子力懸臂、光鑷、磁鑷以及流場(chǎng)拖曳、生物膜力探針(BFP)等。在這些實(shí)驗(yàn)中,生物分子的一端固定于一表面,另一端與力傳感器相連。 表 1 各種生物單分子實(shí)驗(yàn)技術(shù)的比較 方法 | 力量程(pN) | 時(shí)間量程 | 實(shí)際運(yùn)用 | 光鑷 | 0.1—150 | >10 ms | 肌動(dòng)蛋白、DNA、蛋白質(zhì)、分子馬達(dá) | 磁鑷 | 0.01—100 | >1 s | 拉伸、扭轉(zhuǎn) DNA | 微探針 | >0.1 | >100 ms | 拉伸、扭轉(zhuǎn)、解旋DNA | BFP | 0.5—1000 | >1 ms | 配體受體 | AFM | >1 | >10 us | DNA、蛋白質(zhì) |
圖1 力傳感器的示意圖 A. AFM 實(shí)驗(yàn)示意圖,懸臂用來作分子間力作用的傳感器,懸臂的位移由激光束獲得; B. 光學(xué)纖維作力傳感器的例子;C. 光鑷的示意圖;D. 磁鑷示意圖。
|