定量PCR方法:
a、競(jìng)爭(zhēng)法
選擇由突變克隆產(chǎn)生的含有一個(gè)新內(nèi)切位點(diǎn)的外源競(jìng)爭(zhēng)性模板。在同一反應(yīng)管中,待測(cè)樣品與競(jìng)爭(zhēng)模板用同一對(duì)引物同時(shí)擴(kuò)增(其中一個(gè)引物為熒光標(biāo)記)。擴(kuò)增后用內(nèi)切酶消化PCR產(chǎn)物,競(jìng)爭(zhēng)性模板的產(chǎn)物被酶解為兩個(gè)片段,而待測(cè)模板不被酶切,可通過電泳或高效液相將兩種產(chǎn)物分開,分別測(cè)定熒光強(qiáng)度,根據(jù)已知模板推測(cè)未知模板的起始拷貝數(shù)。
b、內(nèi)參照法
在不同的PCR反應(yīng)管中加入已定量的內(nèi)標(biāo)和引物,內(nèi)標(biāo)用基因工程方法合成。上游引物用熒光標(biāo)記,下游引物不標(biāo)記。在模板擴(kuò)增的同時(shí),內(nèi)標(biāo)也被擴(kuò)增。在PCR產(chǎn)物中,由于內(nèi)標(biāo)與靶模板的長(zhǎng)度不同,二者的擴(kuò)增產(chǎn)物可用電泳或高效液相分離開來,分別測(cè)定其熒光強(qiáng)度,以內(nèi)標(biāo)為對(duì)照定量待檢測(cè)模板。
c、PCR-ELISA法
利用di高辛或生物素等標(biāo)記引物,擴(kuò)增產(chǎn)物被固相板上特異的探針?biāo)Y(jié)合,再加入抗di高辛或生物素酶標(biāo)抗體-辣根過氧化物酶結(jié)合物,終酶使底物顯色。常規(guī)的PCR-ELISA法只是定性實(shí)驗(yàn),若加入內(nèi)標(biāo),作出標(biāo)準(zhǔn)曲線,也可實(shí)現(xiàn)定量檢測(cè)目的。
PCR在分子克隆和DNA分析中有多種用途,下面就向大家介紹PCR實(shí)驗(yàn)方法步驟:
方法
1:在冰浴中,按以下次序?qū)⒏鞒煞旨尤胍粺o菌0.5ml離心管中。
10×PCR buffer
5 μl dNTP mix (2mM)
4 μl 引物1(10pM)
2 μl 引物2(10pM)
2 μl Taq酶 (2U/μl)
1 μl DNA模板(50ng-1μg/μl)
1 μl 加ddH2O至 50 μl
產(chǎn)品名稱 | 規(guī)格 | 貨號(hào) |
Cy7-N-羥基琥珀酰亞胺酯 | 1 mg/5 mg | BJP1133 |
熒光定量PCR原理:
產(chǎn)品僅用于科研熒光定量PCR早稱TaqMan PCR,后來也叫Real-Time PCR,是美國(guó)PE(Perkin Elmer)公司1995年研制出來的一種新的核酸定量技術(shù)。該技術(shù)是在常規(guī)PCR基礎(chǔ)上加入熒光標(biāo)記探針或相應(yīng)的熒光染料來實(shí)現(xiàn)其定量功能的。其原理:隨著PCR反應(yīng)的進(jìn)行,PCR反應(yīng)產(chǎn)物不斷累計(jì),熒光信號(hào)強(qiáng)度也等比例增加。每經(jīng)過一個(gè)循環(huán),收集一個(gè)熒光強(qiáng)度信號(hào),這樣我們就可以通過熒光強(qiáng)度變化監(jiān)測(cè)產(chǎn)物量的變化,從而得到一條熒光擴(kuò)增曲線圖。
一般而言,熒光擴(kuò)增曲線可以分成三個(gè)階段:熒光背景信號(hào)階段,熒光信號(hào)指數(shù)擴(kuò)增階段和平臺(tái)期。在熒光背景信號(hào)階段,擴(kuò)增的熒光信號(hào)被熒光背景信號(hào)所掩蓋,無法判斷產(chǎn)物量的變化。而在平臺(tái)期,擴(kuò)增產(chǎn)物已不再呈指數(shù)級(jí)的增加,PCR 的終產(chǎn)物量與起始模板量之間沒有線性關(guān)系,根據(jù)終的 PCR 產(chǎn)物量也不能計(jì)算出起始 DNA 拷貝數(shù)。只有在熒光信號(hào)指數(shù)擴(kuò)增階段, PCR產(chǎn)物量的對(duì)數(shù)值與起始模板量之間存在線性關(guān)系,我們可以選擇在這個(gè)階段進(jìn)行定量分析。為了定量和比較的方便,在實(shí)時(shí)熒光定量 PCR 技術(shù)中引入了兩個(gè)非常重要的概念:熒光閾值和 CT值。
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實(shí)時(shí)熒光定量PCR:
實(shí)時(shí)熒光定量PCR技術(shù)有效地解決了傳統(tǒng)定量只能終點(diǎn)檢測(cè)的局限,實(shí)現(xiàn)了每一輪循環(huán)均檢測(cè)一次熒光信號(hào)的強(qiáng)度,并記錄在電腦軟件之中,通過對(duì)每個(gè)樣品Ct值的計(jì)算,根據(jù)標(biāo)準(zhǔn)曲線獲得定量結(jié)果。因此,實(shí)時(shí)熒光定量PCR無需內(nèi)標(biāo)是建立在兩個(gè)基礎(chǔ)之上的:
1)Ct值的重現(xiàn)性PCR循環(huán)在到達(dá)Ct值所在的循環(huán)數(shù)時(shí),剛剛進(jìn)入真正的指數(shù)擴(kuò)增期(對(duì)數(shù)期),此時(shí)微小誤差尚未放大,因此Ct值的重現(xiàn)性*,即同一模板不同時(shí)間擴(kuò)增或同一時(shí)間不同管內(nèi)擴(kuò)增,得到的Ct值是恒定的。
2)Ct值與起始模板的線性關(guān)系由于Ct值與起始模板的對(duì)數(shù)存在線性關(guān)系,可利用標(biāo)準(zhǔn)曲線對(duì)未知樣品進(jìn)行定量測(cè)定,因此,實(shí)時(shí)熒光定量PCR是一種采用外標(biāo)準(zhǔn)曲線定量的方法。
外標(biāo)準(zhǔn)曲線的定量方法相比內(nèi)標(biāo)法是一種準(zhǔn)確的、值得信賴的科學(xué)方法。利用外標(biāo)準(zhǔn)曲線的實(shí)時(shí)熒光定量PCR是迄今為止定量準(zhǔn)確,重現(xiàn)性的定量方法,已得到*的*,廣泛用于基因表達(dá)研究、轉(zhuǎn)基因研究,藥物療效考核、病原體檢測(cè)等諸多領(lǐng)域。
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實(shí)驗(yàn)過程:
一、試劑準(zhǔn)備
1. DNA模板
2.對(duì)應(yīng)目的基因的特異引物(在PCR反應(yīng)中,新合成的DNA是要接在一小段序列上才能繼續(xù)按照模板DNA復(fù)制,而不能從無到有,憑空合成。這一小段序列就是你所要有設(shè)計(jì)的引物。可以是DNA也可以是RNA,一般20多bp,需要根據(jù)你的模板鏈設(shè)計(jì)。因此,擴(kuò)增不同的基因需要設(shè)計(jì)不同的引物)
3.10×PCR Buffer
4.2mM dNTPmix:含dATP、dCTP、dGTP、dTTP各2mM
5.Taq酶
二、操作步驟
1.在冰浴中,按以下次序?qū)⒏鞒煞旨尤胍粺o菌0.5ml離心管中。
10×PCR buffer 5μl
dNTP mixl 4μl
引物1(10pM) 2μl
引物2(10PM) 2μl
Taq酶(2U/μl) 1μl
DNA模板(50ng-1μg/μl) 1 μl
加ddH2O至 50 μl
視PCR儀有無熱蓋,不加或添加石蠟油。
2.調(diào)整好反應(yīng)程序。將上述混合液稍加離心,立即置PCR儀上,執(zhí)行擴(kuò)增。一般:在93℃預(yù)變性3-5min,進(jìn)入循環(huán)擴(kuò)增階段:93℃ 40s → 58℃ 30s → 72℃ 60s,循環(huán)30-35次,zui后在72℃ 保溫7min。
3.結(jié)束反應(yīng),PCR產(chǎn)物放置于4℃待電泳檢測(cè)或-20℃長(zhǎng)期保存。
4.PCR的電泳檢測(cè):如在反應(yīng)管中加有石蠟油,需用100μlLuFang進(jìn)行抽提反應(yīng)混合液,以除去石蠟油;否則,直接取5-10μl電泳檢測(cè)。
三、注意事項(xiàng)
1.PCR反應(yīng)應(yīng)該在一個(gè)沒有DNA污染的干凈環(huán)境中進(jìn)行。設(shè)立一個(gè)的PCR實(shí)驗(yàn)室。
2.純化模板所選用的方法對(duì)污染的風(fēng)險(xiǎn)有極大影響。一般而言,只要能夠得到可靠的結(jié)果,純化的方法越簡(jiǎn)單越好。
3.所有試劑都應(yīng)該沒有核酸和核酸酶的污染。操作過程中均應(yīng)戴手套。
4.PCR試劑配制應(yīng)使用zui高質(zhì)量的新鮮雙蒸水,采用0.22μm濾膜過濾除菌或高壓滅菌。
5.試劑都應(yīng)該以大體積配制,試驗(yàn)一下是否滿意,然后分裝成僅夠一次使用的量?jī)?chǔ)存,從而確保實(shí)驗(yàn)與實(shí)驗(yàn)之間的連續(xù)性。
6.產(chǎn)品僅用于科研試劑或樣品準(zhǔn)備過程中都要使用一次性滅菌的塑料瓶和管子,玻璃器皿應(yīng)洗滌干凈并高壓滅菌。
7.PCR的樣品應(yīng)在冰浴上化開,并且要充分混勻。
人胰腺衍生因子 Kit多少錢EOMES (D8D1R) Rabbit mAb (Alexa Fluor® 647 Conjugate)100µg
人瘦素 Kit圖片MHC Class II (I-A/I-E) (M5/114.15.2) Rat mAb (FITC Conjugate)100 ul
小鼠P-選擇素糖蛋白配體1 Kit圖片Acetyl-Histone H3 (Lys36) (D9T5Q) Rabbit mAb (Alexa Fluor® 488 Conjugate)100 ul
小鼠SSA Kit多少錢Tri-Methyl-Histone H3 (Lys79) Antibody100 ul
小鼠β防御素 Kit品牌Phospho-SRF (Ser103) Antibody100 ul
小鼠單核細(xì)胞趨化蛋白-1 Kit多少錢Rab10 Antibody100 ul
兔白介素12 Kit多少錢PI3 Kinase Class III (D9A5) Rabbit mAb100 ul
大提柱式植物 RNAout5次品牌FXR1 (L662) Antibody100 ul
柱式土壤 RNAout50 次哪里有賣STOP (175) Mouse mAb100 ul
柱式 DNA 清除劑50 次品牌SOD1 (71G8) Mouse mAb20 ul
豬D-乳酸脫氫酶(D-LDH)分析檢測(cè)試劑盒SOD1 (71G8) Mouse mAb300 ul
小鼠水通道蛋白2(AQP-2)分析檢測(cè)試劑盒EGF Receptor (D38B1) XP® Rabbit mAb100 ul
小鼠瘦素(LEP)分析檢測(cè)試劑盒EGF Receptor (D38B1) XP® Rabbit mAb20 ul
小鼠克拉拉細(xì)胞蛋白(CC16)分析檢測(cè)試劑盒EGF Receptor (D38B1) XP® Rabbit mAb100 ul
小鼠可溶性凝集素樣氧化低密度脂蛋白受體1(sLOX-1)分析檢測(cè)試劑盒Fer (5D2) Mouse mAb100 ul
小鼠降鈣素基因相關(guān)肽(CGRP)分析檢測(cè)試劑盒Ron (1B5) Mouse mAb100 ul
小鼠成纖維細(xì)胞生長(zhǎng)因子8(FGF8)分析檢測(cè)試劑盒Non-phospho (Active) β-Catenin (Ser33/37/Thr41) Antibody100 ul
Cy7-N-羥基琥珀酰亞胺酯Psychrobacter│sp.分離基物: 沉積物/褐棕色沉積物凍干物模式菌株: no應(yīng)用領(lǐng)域: 產(chǎn)酶微生物/產(chǎn)脂肪酶菌株(三丁酸甘油酯法)培養(yǎng)基: 821生長(zhǎng)條件: 15℃存儲(chǔ)條件: 液氮超低溫凍結(jié)法;-80℃冰箱凍結(jié)法;真空冷凍干燥法
Salmonella│paratyphi A分離基物: 血其他安全等級(jí): 2模式菌株: no應(yīng)用領(lǐng)域: 研究培養(yǎng)基: CM0051生長(zhǎng)條件: 37℃存儲(chǔ)條件: 定期移植法
Pseudoalteromonas│sp.分離基物: 沉積物/深海沉積物凍干物模式菌株: no應(yīng)用領(lǐng)域: 大洋細(xì)菌,產(chǎn)酶微生物/ 蛋白酶培養(yǎng)基: 471生長(zhǎng)條件: 4-20℃存儲(chǔ)條件: 液氮超低溫凍結(jié)法;-80℃冰箱凍結(jié)法;真空冷凍干燥法
鏈霉菌種屬: Streptomyces│sp.分離基物: 土壤凍干物安全等級(jí): 1模式菌株: no培養(yǎng)基: 0012生長(zhǎng)條件: 28℃存儲(chǔ)條件: 液氮超低溫凍結(jié)法;真空冷凍干燥法
Escherichia│coli凍干物安全等級(jí): 1模式菌株: no應(yīng)用領(lǐng)域: 病毒生活周期及病毒基因表達(dá)調(diào)控的研究培養(yǎng)基: 304生長(zhǎng)條件: 37℃存儲(chǔ)條件: 真空冷凍干燥法
球形芽孢桿菌種屬: Bacillus│sphaericus斜面培養(yǎng)物安全等級(jí): 1模式菌株: no應(yīng)用領(lǐng)域: 殺蚊蟲高毒菌株培養(yǎng)基: 266生長(zhǎng)條件: 30℃存儲(chǔ)條件: 真空冷凍干燥法
Pichia│pastoris斜面培養(yǎng)物安全等級(jí): 1模式菌株: no應(yīng)用領(lǐng)域: 高效表達(dá)、分泌、生產(chǎn)脂肪酶培養(yǎng)基: 0013生長(zhǎng)條件: 30℃存儲(chǔ)條件: -80℃冰箱凍結(jié)法;真空冷凍干燥法;礦物油法
Microsphaeropsis│arundinis分離基物: 莖凍結(jié)物安全等級(jí): 1模式菌株: no應(yīng)用領(lǐng)域: 抗金黃色葡萄球菌和大腸桿菌培養(yǎng)基: CM0014生長(zhǎng)條件: 25C存儲(chǔ)條件: -80℃冰箱凍結(jié);礦物油法
Brevundimonas│diminuta分離基物: 油田水樣斜面培養(yǎng)物;凍干物安全等級(jí): 1模式菌株: no應(yīng)用領(lǐng)域: 用于微生物采油和含油污水處理培養(yǎng)基: 2生長(zhǎng)條件: 37℃存儲(chǔ)條件: -80℃冰箱凍結(jié)法;真空冷凍干燥法