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由于水庫湖沼學學科發(fā)展相對于傳統(tǒng)的湖沼學、河流學較為滯后( 薩莫伊洛夫和李恒，1958;湖泊及流域?qū)W科發(fā)展戰(zhàn)略研究秘書組，2002 )，其作為現(xiàn)代湖沼學一個相對獨立的學科在 20 世紀 90 年代才正式出現(xiàn)( 林秋奇和韓博平,2001 ).在一定程度上阻礙了水庫生態(tài)安全(reservoir ecological security)問題的針對性分析與管理方法的探索。

現(xiàn)代水庫生態(tài)系統(tǒng)研究和主要結(jié)論來自研究自然湖泊稀少和水資源較為緊張地區(qū)的湖沼學者。捷克學者在這一領域開展的工作較早，也系統(tǒng)，Hrbacek的研究所在 20 世紀 60 年代對布拉格供水水庫斯拉皮水庫的生態(tài)學開展了系統(tǒng)研究，為水庫生態(tài)學理論的形成莫定了基礎，斯拉皮水庫生態(tài)系統(tǒng)的長期研究也為水庫生態(tài)學理論發(fā)展提供了系統(tǒng)的數(shù)據(jù)(Ulmann，1998: Hrbacek，1984 )20 世紀 80 年代后，水庫生態(tài)學受到世界各地學者和有關組織的重視，特別是美國和西歐水質(zhì)工程有關學者，亞洲( 中國、印度)的學者側(cè)重于水庫漁業(yè)的研究以水庫為對象的生態(tài)學研究經(jīng)費和研究論文數(shù)量有了飛速發(fā)展。1987 年屆國際水庫湖沼學和水質(zhì)管理大會的召開反映了人們對水庫生態(tài)學研究重要性的認識。本水庫湖沼學芝作于 1990 年由美國學者 Thorton 等編寫出版，國際理論與應用湖沼學會主席 Wetzel 教授在 1990 年為該書寫了結(jié)論性的章，這標志著水庫湖治學作為現(xiàn)代湖治學一個相對獨立的學科出現(xiàn)，水庫生態(tài)學也迎來了一個新的發(fā)展階段。

當前國際上水庫生態(tài)學的研究主要關注兩個方面:一是，將水庫作為一種特殊水體類型，研究如何豐富經(jīng)典的生態(tài)學和湖沼學( Tundisi and Straskraba,1999 )二是，以水庫特點為基礎，研究水庫生態(tài)管理存在的問題( 韓博平，2010;Ccchct al.，2007: Seda ct al.，2007) 等。例如，Duncan ( 1990 ) 研究了倫敦水庫的水庫生態(tài)管理和生物操作技術; Salencon 和 Thebault ( 1996)以法國中營養(yǎng)水庫為例研究了水庫生態(tài)系統(tǒng)管理的模擬模型;Vorosmarty 等(1997) 分析了世界范圍內(nèi)水庫對徑流的儲存及演化特征; Hamilton 和 Schladow(1997)研究了湖泊水庫水質(zhì)預測模型;Brierley 和 Harper ( 1999 )研究了深水水庫管理的生態(tài)學原則;Tuford 和 McKellar( 1999 )對南卡羅萊納州大型水庫的水動力時空特征和水質(zhì)模型技術進行了研究; Nilsson 和 Berggren ( 2000 )研究了水庫庫岸帶(消落帶)的變化特征;Kennedy ( 2001 ) 探討了建立水庫營養(yǎng)鹽基準的問題。

我國也是較早開展水庫湖沼學研究的國家之一。劉建康等( 1955)發(fā)表了我國水庫生態(tài)學研究的篇論文，揭開了我國水庫生態(tài)學/水庫湖沼學研究的序幕。我國水庫生態(tài)學大致分為 3 個階段,分別為 1955~1975 年的起步階段1976~2000 年以水庫漁業(yè)生產(chǎn)為目標的研究階段、2001 年至今以水庫水質(zhì)管理為目標的研究階段。