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1.WB
WB的蛋白經(jīng)過加熱變性之后都變成線性的結(jié)構(gòu)。因此*好的抗體是采用非常特異序列的人工合成多肽的方法來做實驗,結(jié)果也非常特異。
2.IP/CHIP
我們用抗體去結(jié)合生理狀態(tài)下的蛋白質(zhì),因此IP的抗體最好使用純化的天然蛋白制作的抗體來做,也可以用純化的重組蛋白的抗體。最好不要用人工合成多肽制作的抗體,因為這種抗體識別的位點可能被深深地藏在了蛋白的內(nèi)心深處。CHIP和IP沒有太大的區(qū)別,唯 yi 的問題在于,如果抗體識別的表位和該蛋白質(zhì)與DNA結(jié)合的部位一致,則會導(dǎo)致CHIP實驗的失敗。
3. IF/IHC
免疫熒光和免疫組化中需要進行固定一步,固定是為了盡量讓細胞的形態(tài)結(jié)構(gòu)維持和原有的一致。這種化學(xué)物質(zhì)的固定使蛋白質(zhì)變性凝固,與天然狀態(tài)下的蛋白質(zhì)有了一定的區(qū)別,但是又不同WB中加熱變性變成了線性的結(jié)構(gòu)。因此在做IF/IHC實驗中,最合適的抗體可以是純化的重組蛋白得到的抗體,也可以是人工合成多肽得到的抗體(多肽是在蛋白質(zhì)的表面)
4.FC
流式細胞中分為兩種,一種是活細胞的流式,這種流失最好采用是天然蛋白或者重組蛋白的抗體來做,另外一種是經(jīng)過固定之后的流式,和IF/IHC 所用抗體一致。 在做流式細胞中,我們有直接標(biāo)記和間接標(biāo)記,間接標(biāo)記不如直接標(biāo)記真實準(zhǔn)確。因此我們選擇流式抗體要采用帶有熒光標(biāo)記的抗體;如果研究的蛋白沒有直接標(biāo)記的抗體,那么就采用間接標(biāo)記抗體,需要添加熒光二抗。
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