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在生活中水的應(yīng)用非常廣泛，而現(xiàn)在水質(zhì)的問題日趨嚴重。想要了解水質(zhì)變化的具體情況，檢測水中微生物是一種比較直觀的方法，因為水污染產(chǎn)生的大量有機物質(zhì)能培養(yǎng)處各種微生物。另外生活中如果無法對水中微生物進行有效檢測，就會造成一些健康問題。尤其是一些食品行業(yè)，水中微生物的來源有很多種，其中主要來源于人或動物糞便污染的水體，從而引起可能導(dǎo)致腸道傳染病的傳播，造成更大的健康隱患，另外水體中微生物過多是也會造成藻類大量生長，造成水中氧氣量不足,導(dǎo)致魚蝦因缺氧死亡。因此要定時的對水中微生物進行檢測。 

水質(zhì)中微生物的測試主要針對常見及致病的幾種，例如總腸菌群、糞大腸菌群、大腸埃希氏菌、腸球菌、綠膿假單胞菌、隱孢子蟲、菌落總數(shù)等，主要是為了防止微生物過多對水質(zhì)產(chǎn)生影響，不用的行業(yè)對于水質(zhì)中微生物檢測指標要求也不一樣。

目前檢測水質(zhì)微生物的主要方法可分為多管發(fā)酵法和酶底物法這兩種，多管發(fā)酵法是使用相應(yīng)的培養(yǎng)液在36攝氏度的環(huán)境中，對采集樣品進行初步發(fā)酵實驗，接著進行平板分離和復(fù)發(fā)酵實驗得到最終的結(jié)果。而酶底物法是利用微生物所產(chǎn)生的β2酶分解產(chǎn)生的物質(zhì)，使培養(yǎng)液所呈現(xiàn)的顏色來確定水中是否含有相應(yīng)的微生物。其中多管發(fā)酵法的優(yōu)勢在于沒有雜菌污染，微生物檢測結(jié)果相對準確，而酶底物法的優(yōu)勢在于操作簡單，對于環(huán)境要求不高，檢測范圍相對較廣以及時間短等優(yōu)勢。