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ThePlantCell:DAP-seq應(yīng)用于水稻氣孔開(kāi)度調(diào)控機(jī)制文章

來(lái)源:藍(lán)景科信河北生物科技有限公司   2022年09月06日 15:50  

        2022年8月5日,揚(yáng)州大學(xué)江蘇省作物遺傳生理國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室、糧食作物現(xiàn)代產(chǎn)業(yè)技術(shù)協(xié)同創(chuàng)新中心的聯(lián)合研究成果在線發(fā)表在The Plant Cell上,文章題目為“Phytochrome interacting factor regulates stomatal aperture by coordinating red light and abscisic acid”。該期刊的影響因子為12.085。本研究使用DAP-seq技術(shù)發(fā)現(xiàn)水稻OsPIL15轉(zhuǎn)錄因子靶向OsABI5,進(jìn)一步研究表明,OsPIL15與OsHHO3相互作用促進(jìn)OsABI5的轉(zhuǎn)錄,揭示了PIFs在紅光介導(dǎo)的氣孔開(kāi)放中發(fā)揮作用的分子機(jī)制,證明了PIFs通過(guò)協(xié)調(diào)紅光和ABA信號(hào)傳導(dǎo)來(lái)調(diào)節(jié)氣孔運(yùn)動(dòng)。

        植物通過(guò)氣孔運(yùn)動(dòng)來(lái)響應(yīng)環(huán)境的變化。氣孔運(yùn)動(dòng)是協(xié)調(diào)光合作用和蒸騰作用的關(guān)鍵生理過(guò)程。藍(lán)光和紅光可以影響氣孔運(yùn)動(dòng)。藍(lán)光受體介導(dǎo)的藍(lán)光對(duì)氣孔運(yùn)動(dòng)的調(diào)控機(jī)制已被廣泛研究,但紅光受體光敏色素(phys)介導(dǎo)的氣孔運(yùn)動(dòng)調(diào)控途徑尚不清楚。植物光敏色素互作因子(PIF)作為phys的下游蛋白,可以直接與phys相互作用,并作為光反應(yīng)的負(fù)調(diào)控因子。PIF和PIF-like(PIL)蛋白參與植物的生長(zhǎng)發(fā)育,作為細(xì)胞信號(hào)樞紐協(xié)調(diào)轉(zhuǎn)錄調(diào)控網(wǎng)絡(luò)。然而,PIFs在調(diào)節(jié)氣孔運(yùn)動(dòng)的作用機(jī)制還不清楚。

        在水稻中,PIF家族基因OsPIL15是否參與了氣孔運(yùn)動(dòng)的調(diào)節(jié)?可能的機(jī)制是什么?對(duì)OsPIL15的過(guò)表達(dá)與敲除突變體的表型進(jìn)行分析發(fā)現(xiàn),OsPIL15通過(guò)負(fù)調(diào)控氣孔開(kāi)度來(lái)降低葉片的蒸騰速率。進(jìn)一步研究發(fā)現(xiàn)OsPIL15參與ABA誘導(dǎo)的氣孔關(guān)閉。通過(guò)DNA親和純化測(cè)序(DAP-seq)分析發(fā)現(xiàn)OsABI5是OsPIL15的潛在靶基因,并且OsABI5啟動(dòng)子區(qū)的PBE-box是OsPIL15的結(jié)合位點(diǎn)。雙熒光素酶(Dual-Luc)報(bào)告實(shí)驗(yàn)、電泳遷移測(cè)定(EMSA)實(shí)驗(yàn)、OsABI5突變體的表型實(shí)驗(yàn)進(jìn)一步驗(yàn)證了DAP-seq的結(jié)果。之后,使用酵母雙雜交篩選到OsHHO3是OsPIL15的互作蛋白,并且通過(guò)雙分子熒光互補(bǔ)實(shí)驗(yàn)、體外Pull-Down實(shí)驗(yàn)證實(shí)了OsHHO3與OsPIL15的相互作用。進(jìn)一步研究發(fā)現(xiàn),OsHHO3通過(guò)與OsPIL15互作,促進(jìn)OsPIL15與OsABI5啟動(dòng)子區(qū)域的結(jié)合,進(jìn)而增強(qiáng)OsABI5的轉(zhuǎn)錄,調(diào)節(jié)氣孔開(kāi)度和葉片蒸騰速率。此外,研究還發(fā)現(xiàn)玉米中,與水稻OsPIL15同源的ZmPIF1和ZmPIF3也具有調(diào)節(jié)玉米氣孔開(kāi)度的功能,這表明PIFs介導(dǎo)的氣孔開(kāi)度調(diào)控機(jī)制在植物中可能是保守的。

圖1. OsPIL15負(fù)調(diào)控水稻的蒸騰作用。


圖2. OsABI5 是OsPIL15的直接靶基因。


圖3. OsPIL15 的作用機(jī)制模式圖


本文總結(jié)

本研究發(fā)現(xiàn)了水稻PIF轉(zhuǎn)錄因子OsPIL15與OsHHO3相互作用促進(jìn)水稻OsABI5的轉(zhuǎn)錄。OsPIL15是調(diào)控ABA信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)的關(guān)鍵轉(zhuǎn)錄因子,通過(guò)與OsABI5啟動(dòng)子的PBE-box基序結(jié)合調(diào)控氣孔開(kāi)度。此外,與水稻OsPIL15同源的玉米PIF家族基因ZmPIF1和ZmPIF3也負(fù)調(diào)控玉米的氣孔開(kāi)度,表明PIF介導(dǎo)的氣孔開(kāi)度調(diào)控機(jī)制在植物中可能是保守的。本研究揭示了PIFs在紅光介導(dǎo)的氣孔開(kāi)放中發(fā)揮作用的分子機(jī)制,并證明了PIFs可以通過(guò)協(xié)調(diào)紅光和ABA信號(hào)傳導(dǎo)來(lái)調(diào)節(jié)氣孔開(kāi)度,同時(shí)也為作物抗旱育種研究提供了一條新思路。


藍(lán)景科信河北生物科技有限公司為作者提供了DAP-seq技術(shù)支持。

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