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瓊脂糖凝膠電泳檢測DNA的實驗原理
[實驗儀器與設備]
1. elisa定量檢測試劑盒恒溫培養(yǎng)箱 2. 瓊脂糖凝膠電泳系統(tǒng)
3. 高壓滅菌鍋 4. 紫外線透射儀
[實驗材料]
1.三羥甲基氨基甲烷(Tris) 2.硼酸
3.乙二胺四乙酸(EDTA) 4.溴酚藍
5.蔗糖 6.瓊脂糖
7.溴化乙錠 8.DNA marker
9.DNA樣品
[實驗步驟]
1.緩沖液的配制
① 5×TBE(5倍體積的TBE貯存液)
配1000ml 5×TBE:
Tris 54g
硼酸 27.5g
0.5mol/l EDTA 20ml
Ph8.0
② 凝膠加樣緩沖液(6×)
溴酚藍 0.25%
蔗糖 40%
③溴化乙錠溶液(EB) 0.5μg/ml
2.制備瓊脂糖凝膠
按照被分離DNA的大小,決定凝膠中瓊脂糖的百分含量。可參照下表:
瓊脂糖凝膠濃度 線性DNA的有效分離范圍
0.3% 5-60 kb
0.6% 1-20 kb
0.7% 0.8-10 kb
0.9% 0.5-7 kb
1.2% 0.4-6 kb
1.5% 0.2-4 kb
2.0% 0.1-3 kb
3.膠板的制備
(1)elisa定量檢測試劑盒 用高壓滅菌指示紙帶將洗靜、干燥的玻璃板的邊緣(或電泳裝置所皿備的塑料盤的開口)封住,形成一個膠膜(將膠膜放在工作臺的水平位置上,用水平儀校正)。
(2) 配制足夠用于灌滿電泳槽和制備凝膠所需的電泳緩沖液(1×TBE)。準確稱量的瓊脂糖粉。緩沖液不宜超過錐瓶或玻璃瓶的50%容量。 在電泳槽和凝膠中務必使用同一批次的電泳緩沖液,離子強度或pH值的微小差異會在凝膠中形成前沿,從而大大影響DNA段的遷移率 。
(3) 在錐瓶的瓶頸上松松地包上一層厚紙。如用玻璃瓶,瓶蓋須擰松。在沸水浴或微波爐中將懸浮加熱至瓊脂糖溶解。注意:瓊脂糖溶液若在微波爐里加熱過長時間,溶液將過熱并暴沸。應核對溶液的體積在煮沸過程中是否由于蒸發(fā)而減少,必要時用緩沖液補充。
(4) 使溶液冷卻至60℃。加入溴化乙錠(用水配制成10mg/ml的貯存液)到終濃度為0.5ug/ml,充分混勻。
(5) 用移液器吸取少量瓊脂糖溶液封固膠模邊緣,凝固后,在距離底板0.5-10mm的位置上放置梳子,以便加入瓊脂糖后可以形成完好的加樣孔。如果梳子距玻璃板太近,則拔出梳子時孔底將有破裂的危險,破裂后會使樣品從玻璃板之間滲透。
(6)將剩余的溫熱瓊脂糖溶液倒入膠模中。凝膠的厚度在3-5mm之間。檢查一下梳子的齒下或齒間是否有氣泡。
(7)在凝膠*凝固后(于室溫放置30-45分鐘) ,小心移去梳子和高壓滅菌紙帶,將凝膠放入電泳槽中。
低熔點瓊脂糖凝膠及濃度低于0.5%的瓊脂糖凝膠應冷卻至4℃,并在冷庫中電泳。
(8)加入恰好沒過膠面約1mm深的足量電泳緩沖液。
4.加樣
DNA樣品與所需加樣緩沖液混合后,用微量移液器,慢慢將混合物加至樣品槽中。此時凝膠已浸沒在緩沖液中。 一個加樣孔的大加樣量依據(jù)DNA的數(shù)量及大小而定,一般為20-30μl樣品。
已知大小的DNA標準,elisa定量檢測試劑盒應同時加在凝膠的左凝膠的左側和右側孔內(nèi)。確定未知DNA的大小。測量未知DNA的大小時,要所有樣品都用相同的樣品緩沖液。
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