人源細(xì)胞基因調(diào)控是一個(gè)遺傳和表觀遺傳修飾共同作用的復(fù)雜系統(tǒng),對患者的表觀遺傳基因組的深入研究對于在分子層次了解許多疾病的致病機(jī)理、優(yōu)化診斷和治療方案都具有非常重要的科學(xué)意義。本文作者以人類 T 細(xì)胞淋巴瘤(Cutaneous T cell lymphoma, CTCL)為研究對象,利用一種名為ATAC-seq 新技術(shù)研究CTCL患者個(gè)性化表觀遺傳調(diào)控機(jī)制及其對藥物敏感性的決定性作用。
CTCL是一種由T淋巴細(xì)胞克隆性增生造成的較為罕見的復(fù)雜性疾病,晚期的CTCL如Sézary綜合癥,癌細(xì)胞可以轉(zhuǎn)移至血液,導(dǎo)致T細(xì)胞白血病,是一種非常致命的疾病。本文作者通過流式分離正常人和患者新鮮血液中的CD4+ T細(xì)胞,利用ATAC-seq技術(shù)快速檢測正常人和患者血液中微量活體T淋巴人源細(xì)胞的染色質(zhì)開放位點(diǎn),整合各類組學(xué)數(shù)據(jù)和生物信息分析技術(shù),深度解析CTCL表觀遺傳指紋,構(gòu)建CTCL腫瘤特異性、患者特異性和細(xì)胞特異性基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)。作者還通過追蹤患者在組蛋白脫乙酰酶抑制劑(HDACi)抗癌藥物治療過程中各個(gè)時(shí)間點(diǎn)的表觀遺傳狀態(tài),在時(shí)間尺度上深入研究表觀遺傳基因組和關(guān)鍵性轉(zhuǎn)錄因子對患者藥物敏感性的動(dòng)態(tài)調(diào)控機(jī)制,并準(zhǔn)確預(yù)測患者對HDACi抗癌藥物的敏感性。本文是*實(shí)時(shí)構(gòu)建癌癥個(gè)性化表觀遺傳調(diào)控網(wǎng)絡(luò)的工作,一方面為研究其他疾病的個(gè)性化表觀遺傳調(diào)控機(jī)制建立了模板,另一方面為患者的醫(yī)療方案提供了科學(xué)依據(jù),人源細(xì)胞因此對推動(dòng)醫(yī)療的發(fā)展有非常重要的科學(xué)意義。
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