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鰓霉屬通用PCR檢測試劑盒實驗原理

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                       鰓霉屬通用PCR檢測試劑盒說明書

特點優(yōu)勢:


    1.   特異性:所有產(chǎn)品使用的引物均經(jīng)過詳盡的生物信息學(xué)分析,經(jīng)過GenBank及自建龐大數(shù)據(jù)庫的比對,確保所用的每一條引物均為種屬或血清型特異的基因序列區(qū)段,可實現(xiàn)對細菌種屬及血清型的特異檢測,特異性均達到100%。


    2.   重現(xiàn)性:該系列所有產(chǎn)品均經(jīng)過大量實驗菌株的驗證,重現(xiàn)性為100%。


    3.   靈敏性:該系列產(chǎn)品可實現(xiàn)對檢測菌的高靈敏檢測,當(dāng)樣品中細菌的濃度達到103cfu/ml時,可實現(xiàn)對其的直接檢測,無需繁瑣的增菌過程。


    4.   實用性:檢測范圍廣,涵蓋了對人體危害較為嚴重的17種呼吸道及腸道致病菌,可實現(xiàn)對臨床樣品及其他環(huán)境取樣的快速檢測,整個檢測過程為3-4個小時。


    5.   優(yōu)勢1:序列資源豐富,除GenBank公布的序列外,公司還進行了大量菌株的序列破譯,從理論上保證所選引物具有良好的保守性和特異性。


    6.   優(yōu)勢2:該系列試劑盒均經(jīng)過大量的保守性及特異性實驗驗證,憑借公司擁有的豐富的菌種資源,每一種檢測試劑盒均經(jīng)過了20余種標(biāo)準(zhǔn)菌株和臨床菌株的保守性驗證及40余種近緣標(biāo)準(zhǔn)菌株和臨床菌株的特異性驗證,確保在使用過程中不會出現(xiàn)任何的假陽性及假陰性報告結(jié)果。

 鰓霉屬通用PCR檢測試劑盒PCR使用方法:


一、樣品 DNA 的制備


1. 用自選方法純化樣品的 DNA,本產(chǎn)品跟市場上絕大多數(shù)核酸純化產(chǎn)品兼容。


2. 如果有 N 個樣品,則需要進行 N+2 個樣品提取,多出的一個用作樣品制備陽性對照管、另一個用作樣品制備陰性對照管。如果用本試劑盒自帶的 DNA 釋放劑試用裝。則按下面步驟操作: 


3. 配制溶液 A 工作液。以配制 1mL 工作液(足夠 10 個樣品)為例:在一干凈塑料


管中加入 10uL 溶液 A 成分一,20uL 溶液 A 成分二和 970uL 超純水,充分混合均勻即可。溶液 A 工作液可室溫放置,但最好在一周內(nèi)用完,不要長期放置。一次檢測一個樣品需要 100uL 溶液 A 工作液,1mL 工作液足夠 10 個樣品。如果待測樣品數(shù)量為其他數(shù)字,

配制的溶液 A 工作液的體積需要做相應(yīng)的調(diào)整。


4. 在標(biāo)記好的 N+2 個離心管中,加入 1-5mg 固體樣品(半粒芝麻大小,如奶酪)或5uL 液體樣品(如牛奶)待測樣品。在樣品制備陽性對照中加入 5uL 陽性對照,在樣品制備陰性對照中加入 5uL 水。


5. 在每個管中加入 100 uL 溶液 A 工作液,確保固體樣品被溶液淹埋,如果是液體樣品則震蕩混勻。


6. 95℃保溫 10 分鐘。


7. 待冷卻到常溫后加入 10uL 溶液 B 并混勻得 DNA 釋放液。每個樣品得到的 DNA釋放液足夠進行 50-100 次 PCR。

鰓霉屬通用PCR檢測試劑盒實驗規(guī)則:


1、要保證移液槍的準(zhǔn)確性,誤差不能超過2%??捎盟碗娮犹炱竭M行確定。但有專業(yè)人員進行矯正。

2、要配備20ul、50ul、100ul、1000ul和排槍各一支。吸取不同的液體后,要更換槍頭。即使是吸取標(biāo)準(zhǔn)品時。

3、要在實驗前1小時將試劑盒從冰箱中取出,使各種試劑都恢復(fù)到室溫,以使結(jié)果更穩(wěn)定。

4、實驗時,要使底物避光保存。

5、用槍吸取液體時速度不能太快,以免產(chǎn)生氣泡而使吸取量不準(zhǔn)確。

6、吸取液體時,要用量程和需要量接近的槍去吸,減少誤差。

7、將液體加到酶標(biāo)孔中時,避免槍頭和孔內(nèi)液體接觸,可使槍頭上的液滴和孔壁接觸,液滴會自然流下去。

8、液體全部加完后,可將酶標(biāo)板在桌子上平行輕輕晃動30秒,混勻液體。也可以用酶標(biāo)儀的晃動功能。

9、應(yīng)盡量做雙孔實驗,這樣才能保證數(shù)據(jù)的準(zhǔn)確性。

10、對結(jié)果有疑問的樣品要用其它方法進行確證。

PCR反應(yīng)流程常規(guī)程序


將PCR反應(yīng)所需的成分配置完后,在PCR儀上于94-96℃預(yù)加熱幾十秒至幾分鐘,使模板DNA充分變性,然后進入擴增循環(huán)。在每一個循環(huán)中,先于94℃保持30秒鐘使模板變性,然后將溫度降到復(fù)性溫度(一般50-60℃之間),一般保持30秒鐘,使引物與模板充分退火;在72℃保持1分鐘(擴增1kb片段),使引物在模板上延伸,合成DNA,完成一個循環(huán)。重復(fù)這樣的循環(huán)25~35次,使擴增的DNA片段大量累積。最后,在72℃保持3-7min,使產(chǎn)物延伸完整,4℃保存。


2.復(fù)性(退火)和延伸溫度


復(fù)性的溫度是PCR擴增是否順利的關(guān)鍵因素,通常在50-60℃之間。具體的溫度主要由引物的Tm值決定。延伸溫度絕大多數(shù)設(shè)定為72℃。如果復(fù)性的溫度很高,可以將延伸溫度和復(fù)性溫度設(shè)置成同一溫度,變成二步法PCR。


3.反應(yīng)時間


變性步驟一般使用30秒鐘,如果模板的G+C含量較高,或直接用細胞做模板,變性時間可適當(dāng)延長。復(fù)性時間有30秒種一般是足夠的。延伸時間由擴增產(chǎn)物的大小決定,一般采用1kb用1分鐘來保證充足的時間。


4.循環(huán)次數(shù)


循環(huán)次數(shù)主要與模板的起始數(shù)量有關(guān),在模板拷貝數(shù)為104~105數(shù)量級時,循環(huán)數(shù)通常為25~35次。


平臺效應(yīng)(plateaueffect):PCR擴增過程后期會出現(xiàn)的產(chǎn)物的積累按減弱的指數(shù)速率增長的現(xiàn)象。原因:底物和引物的濃度已經(jīng)降低,dNTP和DNA聚合酶的穩(wěn)定性或活性降低,產(chǎn)生的焦磷酸會出現(xiàn)末端產(chǎn)物抑制作用,非特異性產(chǎn)物或引物的二聚體出現(xiàn)非特異性競爭作用,擴增產(chǎn)物自身復(fù)性,高濃度擴增產(chǎn)物變性不ce底


5.PCR反應(yīng)液的配制


PCR反應(yīng)體系的配置方式有時也會影響反應(yīng)的正常進行。常規(guī)方法與其它酶學(xué)反應(yīng)一樣,在最后加入DNA聚合酶。早期的PCR儀沒有帶加熱的蓋子,要求在反應(yīng)液上覆蓋一層礦物油,防止水分蒸發(fā)。


對于使用具3’-5’外切活性的高溫DNA聚合酶時,有時會擴增不出產(chǎn)物。在遇到這個問題時,如果將反應(yīng)成分分開配制,A管含模板、引物和dNTP,以及調(diào)整體積的H2O,B管含緩沖液、DNA聚合酶和水,然后再將兩管溶液混合起來,可較好地克服這個問題。


按照常規(guī)的方法配制反應(yīng)體系,有時會出現(xiàn)非特異性擴增的問題。熱啟動(hotstart)PCR操作方式可較好解決這一問題。將dNTP、緩沖液,Mg2+和primer先配制好,然后加入一粒蠟珠(如AmpliWaxPCRQam100),加熱熔化,再冷卻,使蠟將溶液封住,最后加入模板和DNA聚合酶等剩余成分。只有當(dāng)PCR反應(yīng)進入高溫階段后,蠟層熔化,所有反應(yīng)成分才會混合在一起。

 鰓霉屬通用PCR檢測試劑盒實驗注意事項:


1)RT-PCR可以檢測組織、細胞、血液、細菌等很多材料,不同的樣本有不同要求,實驗前請充分溝通確認實驗方案和樣本情況;


2)客戶盡可能提供實驗的背景信息、物種、基因準(zhǔn)確的名稱和ID號;


3)客戶盡量不要提供DNA或RNA樣品。


4)樣本保存于液氮或干冰,也可以保存于Trizol液中。


實時熒光定量PCR(quantitative real-time PCR,qPCR)是指在PCR反應(yīng)體系中加入熒光基團,利用熒光信號積累實時監(jiān)測整個PCR進程,*通過標(biāo)準(zhǔn)曲線對未知模板進行定量分析的方法。實時熒光定量PCR的化學(xué)原理包括探針類和非探針類兩類,探針類是利用與靶細胞序列特異性雜交的探針來指示擴增產(chǎn)物的增加,非探針類是利用熒光染料或者特異性設(shè)計的引物來指示擴增的增加。運用該技術(shù)可以對DNA、RNA樣品進行定量(包括*定量和相對定量)和定性分析。


主要服務(wù):DNA或RNA的*定量分析、基因表達差異分析、基因分型。


主要技術(shù):引物設(shè)計、RNA提取、cDNA合成、qPCR。


試劑使用須知:

(1)請參照相關(guān)法規(guī)、文獻、MSDS等信息,理解并掌握好試劑的特性,再進行安全操作。產(chǎn)品僅用于科研

(2)通常購買試劑時一定要想到一次性用完。若估算不足有剩余的話,更加注意其他保管和管理。

(3)萬一試劑操作者并非專業(yè)技術(shù)人員。必須在專業(yè)人士的指導(dǎo)監(jiān)督下進行操作。對于使用后的廢棄物,不要或者舊的試劑,應(yīng)按照相關(guān)法律法規(guī)正當(dāng)處理。

(4)購買后,請務(wù)必確認標(biāo)簽上的注意事項;做好預(yù)防顛倒,摔壞的措施和管理體制;在使用前再次確認標(biāo)簽上的注意事項,做好必要的安全對策;對沒有標(biāo)明其危害特性、有害特性的,也要慎重地進行操作;必須帶好防護用具,小心翼翼進行操作。


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