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1.進(jìn)口原裝elisa試劑盒甲基化的影響
從帶有DNA甲基化酶基因的宿主菌中制備的DNA,其堿基的一部分已經(jīng)被甲基化,因此即便使用能夠識(shí)別、切斷被甲基化部分的序列的限制酶,也幾乎無法切斷被甲基化的部分。被甲基化的部位,根據(jù)底物DNA及宿主種類的不同而不同。例如宿主菌為大腸桿菌的情況下,根據(jù)宿主的種類有以下兩種情況: 在進(jìn)行轉(zhuǎn)化時(shí),通常使用的菌株為C600、HB101、JM109等,因?yàn)槎紟в衐am、dcm甲基化酶,所以使用這些菌株制備的DNA時(shí),必須注意。另外,動(dòng)物由來的DNA,CG序列多為5mCG;植物由來的DNA,CG及CNG序列多為5mCG和5mCNG。
2. Star活性
限制酶在一些特定條件下使用時(shí),對(duì)于底物DNA的特異性可能降低。即可以把與原來識(shí)別的特定的DNA序列不同的堿基序列切斷,這個(gè)現(xiàn)象叫Star活性。Star活性出現(xiàn)的頻率,根據(jù)酶、底物DNA、反應(yīng)條件的不同而不同,可以說幾乎所有的限制酶都具有Star活性。并且,它們除了識(shí)別序列的范圍增大之外,還發(fā)現(xiàn)了在DNA的一條鏈上加入切口的單鏈切口活性,所以為了極力抑制Star活性,一般情況下,即使會(huì)降低反應(yīng)性能,我們也提倡在低甘油濃度、中性pH、高鹽濃度條件下進(jìn)行反應(yīng)。
3. 部分分解
如果使用預(yù)計(jì)的限制酶對(duì)底物DNA進(jìn)行作用,而未能*將其切斷,其原因除了上述兩點(diǎn)和酶失活之外,DNA的純度、反應(yīng)阻害物的影響、DNA的種類等也有關(guān)系。進(jìn)口原裝elisa試劑盒特別是由于DNA種類不同,它們的大小、切點(diǎn)數(shù)也不同,達(dá)到*分解時(shí),所需要的酶量也不同,從這些數(shù)據(jù)中計(jì)算出的 [*分解1 μg DNA所需要的限制酶預(yù)計(jì)量] 與 [實(shí)際量],也因限制酶的種類不同而有差別,這些差別被認(rèn)為是酶同其識(shí)別位點(diǎn)周圍的結(jié)構(gòu)親和程度而產(chǎn)生的。例如, 限制酶Nae I 在切斷pBR322 DNA時(shí),就有著非常難以切斷的部位。另外,因反應(yīng)液組成變化 (如添加精脒),也可以使切斷順序發(fā)生變化。
4. DNA結(jié)合物質(zhì)
限制酶切反應(yīng)后進(jìn)行電泳時(shí),有時(shí)會(huì)發(fā)生電泳帶無法確認(rèn)、電泳帶擴(kuò)散、電泳帶移動(dòng)距離異常等問題,這是由于酶蛋白自身或其它雜蛋白與DNA結(jié)合在一起,使DNA沒有進(jìn)入電泳凝膠中,或DNA難以被溴乙錠染色而造成的。發(fā)生這些現(xiàn)象時(shí),在試樣中加入一些蛋白質(zhì)變性劑 (如SDS,終濃度0.1%左右),便可改善電泳效果。
5. 其它
限制酶的保質(zhì)期一般是在檢定日以后的三年內(nèi),但幾乎所有的限制酶在超過保質(zhì)期后都不會(huì)急劇失活,因此購入后即使是經(jīng)過長(zhǎng)時(shí)間保存的酶,也*可以使用,但這些酶在使用前再測(cè)一次活性。另外,進(jìn)口原裝elisa試劑盒保存酶時(shí)即便讓其凍結(jié),大部分酶也不會(huì)急劇失活。
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