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PCR在分子克隆和DNA分析中有多種用途,下面就向大家介紹PCR實驗方法步驟:
方法
1:在冰浴中,按以下次序?qū)⒏鞒煞旨尤胍粺o菌0.5ml離心管中。
10×PCR buffer
5 μl dNTP mix (2mM)
4 μl 引物1(10pM)
2 μl 引物2(10pM)
2 μl Taq酶 (2U/μl)
1 μl DNA模板(50ng-1μg/μl)
1 μl 加ddH2O至 50 μl
產(chǎn)品名稱 | 規(guī)格 | 貨號 |
磺基羅丹明101磺酰肼 | 5 mg | BJP1256 |
熒光定量PCR原理:
產(chǎn)品僅用于科研熒光定量PCR早稱TaqMan PCR,后來也叫Real-Time PCR,是美國PE(Perkin Elmer)公司1995年研制出來的一種新的核酸定量技術(shù)。該技術(shù)是在常規(guī)PCR基礎(chǔ)上加入熒光標(biāo)記探針或相應(yīng)的熒光染料來實現(xiàn)其定量功能的。其原理:隨著PCR反應(yīng)的進(jìn)行,PCR反應(yīng)產(chǎn)物不斷累計,熒光信號強(qiáng)度也等比例增加。每經(jīng)過一個循環(huán),收集一個熒光強(qiáng)度信號,這樣我們就可以通過熒光強(qiáng)度變化監(jiān)測產(chǎn)物量的變化,從而得到一條熒光擴(kuò)增曲線圖。
一般而言,熒光擴(kuò)增曲線可以分成三個階段:熒光背景信號階段,熒光信號指數(shù)擴(kuò)增階段和平臺期。在熒光背景信號階段,擴(kuò)增的熒光信號被熒光背景信號所掩蓋,無法判斷產(chǎn)物量的變化。而在平臺期,擴(kuò)增產(chǎn)物已不再呈指數(shù)級的增加,PCR 的終產(chǎn)物量與起始模板量之間沒有線性關(guān)系,根據(jù)終的 PCR 產(chǎn)物量也不能計算出起始 DNA 拷貝數(shù)。只有在熒光信號指數(shù)擴(kuò)增階段, PCR產(chǎn)物量的對數(shù)值與起始模板量之間存在線性關(guān)系,我們可以選擇在這個階段進(jìn)行定量分析。為了定量和比較的方便,在實時熒光定量 PCR 技術(shù)中引入了兩個非常重要的概念:熒光閾值和 CT值。
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實時熒光定量PCR:
實時熒光定量PCR技術(shù)有效地解決了傳統(tǒng)定量只能終點檢測的局限,實現(xiàn)了每一輪循環(huán)均檢測一次熒光信號的強(qiáng)度,并記錄在電腦軟件之中,通過對每個樣品Ct值的計算,根據(jù)標(biāo)準(zhǔn)曲線獲得定量結(jié)果。因此,實時熒光定量PCR無需內(nèi)標(biāo)是建立在兩個基礎(chǔ)之上的:
1)Ct值的重現(xiàn)性PCR循環(huán)在到達(dá)Ct值所在的循環(huán)數(shù)時,剛剛進(jìn)入真正的指數(shù)擴(kuò)增期(對數(shù)期),此時微小誤差尚未放大,因此Ct值的重現(xiàn)性*,即同一模板不同時間擴(kuò)增或同一時間不同管內(nèi)擴(kuò)增,得到的Ct值是恒定的。
2)Ct值與起始模板的線性關(guān)系由于Ct值與起始模板的對數(shù)存在線性關(guān)系,可利用標(biāo)準(zhǔn)曲線對未知樣品進(jìn)行定量測定,因此,實時熒光定量PCR是一種采用外標(biāo)準(zhǔn)曲線定量的方法。
外標(biāo)準(zhǔn)曲線的定量方法相比內(nèi)標(biāo)法是一種準(zhǔn)確的、值得信賴的科學(xué)方法。利用外標(biāo)準(zhǔn)曲線的實時熒光定量PCR是迄今為止定量準(zhǔn)確,重現(xiàn)性的定量方法,已得到*的*,廣泛用于基因表達(dá)研究、轉(zhuǎn)基因研究,藥物療效考核、病原體檢測等諸多領(lǐng)域。
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定量PCR方法:
a、競爭法
選擇由突變克隆產(chǎn)生的含有一個新內(nèi)切位點的外源競爭性模板。在同一反應(yīng)管中,待測樣品與競爭模板用同一對引物同時擴(kuò)增(其中一個引物為熒光標(biāo)記)。擴(kuò)增后用內(nèi)切酶消化PCR產(chǎn)物,競爭性模板的產(chǎn)物被酶解為兩個片段,而待測模板不被酶切,可通過電泳或高效液相將兩種產(chǎn)物分開,分別測定熒光強(qiáng)度,根據(jù)已知模板推測未知模板的起始拷貝數(shù)。
b、內(nèi)參照法
在不同的PCR反應(yīng)管中加入已定量的內(nèi)標(biāo)和引物,內(nèi)標(biāo)用基因工程方法合成。上游引物用熒光標(biāo)記,下游引物不標(biāo)記。在模板擴(kuò)增的同時,內(nèi)標(biāo)也被擴(kuò)增。在PCR產(chǎn)物中,由于內(nèi)標(biāo)與靶模板的長度不同,二者的擴(kuò)增產(chǎn)物可用電泳或高效液相分離開來,分別測定其熒光強(qiáng)度,以內(nèi)標(biāo)為對照定量待檢測模板。
c、PCR-ELISA法
利用di高辛或生物素等標(biāo)記引物,擴(kuò)增產(chǎn)物被固相板上特異的探針?biāo)Y(jié)合,再加入抗di高辛或生物素酶標(biāo)抗體-辣根過氧化物酶結(jié)合物,終酶使底物顯色。常規(guī)的PCR-ELISA法只是定性實驗,若加入內(nèi)標(biāo),作出標(biāo)準(zhǔn)曲線,也可實現(xiàn)定量檢測目的。
人堿性成纖維細(xì)胞生長因子 Kit品牌SignalSilence® eIF4E siRNA II100µl
人巨噬細(xì)胞集落刺激因子 Kit品牌L-asparaginase/ASRGL1 Antibody100 ul
人血管性血友病因子 Kit品牌Granzyme B (D2H2F) Rabbit mAb (PE Conjugate)300 ul
人煙酰腺嘌呤二核苷酸磷酸 Kit品牌SignalSilence® mTOR siRNA II100 ul
人胰高血糖素樣肽-1 Kit說明書PDP1 (D8Y6L) Rabbit mAb100 ul
人血小板因子4 Kit圖片ALDH1A1 (D9Q8E) XP® Rabbit mAb (PE Conjugate)300 ul
人生長激素釋放肽 Kit說明書SignalSilence® p21 Waf1/Cip1 siRNA II300 ul
小鼠I型前膠原羧基端肽 Kit多少錢SignalSilence® p44/42 MAPK (Erk1/2) siRNA100 ul
小鼠β抑制蛋白-2 Kit多少錢Mcl-1 (D2W9E) Rabbit mAb (PE Conjugate)300 ul
小鼠白蛋白 Kit多少錢SignalSilence® p53 siRNA II100 ul
小鼠雌二醇 Kit說明書TMOD1 (E7E3A) XP®Rabbit mAb20 ul
小鼠內(nèi)皮型一氧化氮合酶 Kit多少錢TMOD1 (E7E3A) XP®Rabbit mAb300 ul
兔C-反應(yīng)蛋白CRP Kit說明書SignalSilence® p38 MAPK siRNA I100 ul
兔白介素8 Kit多少錢Arg3.1 (D6H9N) Rabbit mAb1 Kit
兔高密度脂蛋白HDL Kit多少錢PTMScan® Cell Growth and Death Antibody Sampler Kit300 ul
兔細(xì)胞間粘附分子1 ICAM-1 Kit品牌SignalSilence® p70/85 S6 Kinase siRNA I150 ul
柱式動物 RNAout50 次哪里有賣SignalSilence® Control siRNA (Unconjugated)100 ul
磺基羅丹明101磺酰肼Volvariella│bombycina斜面培養(yǎng)物安全等級: 1模式菌株: no應(yīng)用領(lǐng)域: 食用培養(yǎng)基: 0014生長條件: 25℃存儲條件: 真空冷凍干燥法;礦物油法;定期移植法
Streptomyces│sp.分離基物: 土壤凍干物安全等級: 1模式菌株: no應(yīng)用領(lǐng)域: 抗HIV培養(yǎng)基: CM0027生長條件: 28C存儲條件: 真空冷凍干燥
Vibrio│cholerae non-O1凍干物安全等級: 3模式菌株: no應(yīng)用領(lǐng)域: 制備VBO血清 非O1 VBO-83培養(yǎng)基: CM0116生長條件: 37℃存儲條件: 真空冷凍干燥法
Bacillus│firmus Bredemann and Werner分離基物: 根際土斜面培養(yǎng)物安全等級: 1模式菌株: no培養(yǎng)基: 141生長條件: 28存儲條件: 定期移植法
Saccharomyces│cerevisiae凍干物安全等級: 1模式菌株: no應(yīng)用領(lǐng)域: 釀造酒精。培養(yǎng)基: CM0013生長條件: 28-30℃存儲條件: 真空冷凍干燥法
Bacillus│sp.分離基物: 土壤凍干物安全等級: 1模式菌株: no應(yīng)用領(lǐng)域: 分類學(xué)研究培養(yǎng)基: 2生長條件: 37℃存儲條件: -80℃冰箱凍結(jié)法
Mesorhizobium│huakuii分離基物: 分離自黃棕壤中生長的紫云英根瘤凍干物安全等級: 1模式菌株: no應(yīng)用領(lǐng)域: 主要用于研究質(zhì)粒之間的相互作用培養(yǎng)基: 63生長條件: 28℃存儲條件: 真空冷凍干燥法
Bacillus│licheniformis分離基物: 土壤凍干物安全等級: 1模式菌株: no培養(yǎng)基: 598生長條件: 30℃存儲條件: 真空冷凍干燥法
Bacillus megaterium凍干物安全等級: 1模式菌株: no應(yīng)用領(lǐng)域: 有機(jī)垃圾處理培養(yǎng)基: 營養(yǎng)肉汁瓊脂: 3.0g,蛋白胨 10.0g,NaCl 5.0g,瓊脂 15.0g,蒸餾水 1.0L,pH7.0。[注] 培養(yǎng)芽孢桿菌時加入5mg MnSO4·H2O,則有利于產(chǎn)生芽孢。pH7.0。121℃,15min。生長條件: 37℃,好氧存儲條件: 液氮超低溫凍結(jié)法;真空冷凍干燥法
實驗過程:
一、試劑準(zhǔn)備
1. DNA模板
2.對應(yīng)目的基因的特異引物(在PCR反應(yīng)中,新合成的DNA是要接在一小段序列上才能繼續(xù)按照模板DNA復(fù)制,而不能從無到有,憑空合成。這一小段序列就是你所要有設(shè)計的引物??梢允荄NA也可以是RNA,一般20多bp,需要根據(jù)你的模板鏈設(shè)計。因此,擴(kuò)增不同的基因需要設(shè)計不同的引物)
3.10×PCR Buffer
4.2mM dNTPmix:含dATP、dCTP、dGTP、dTTP各2mM
5.Taq酶
二、操作步驟
1.在冰浴中,按以下次序?qū)⒏鞒煞旨尤胍粺o菌0.5ml離心管中。
10×PCR buffer 5μl
dNTP mixl 4μl
引物1(10pM) 2μl
引物2(10PM) 2μl
Taq酶(2U/μl) 1μl
DNA模板(50ng-1μg/μl) 1 μl
加ddH2O至 50 μl
視PCR儀有無熱蓋,不加或添加石蠟油。
2.調(diào)整好反應(yīng)程序。將上述混合液稍加離心,立即置PCR儀上,執(zhí)行擴(kuò)增。一般:在93℃預(yù)變性3-5min,進(jìn)入循環(huán)擴(kuò)增階段:93℃ 40s → 58℃ 30s → 72℃ 60s,循環(huán)30-35次,zui后在72℃ 保溫7min。
3.結(jié)束反應(yīng),PCR產(chǎn)物放置于4℃待電泳檢測或-20℃長期保存。
4.PCR的電泳檢測:如在反應(yīng)管中加有石蠟油,需用100μlLuFang進(jìn)行抽提反應(yīng)混合液,以除去石蠟油;否則,直接取5-10μl電泳檢測。
三、注意事項
1.PCR反應(yīng)應(yīng)該在一個沒有DNA污染的干凈環(huán)境中進(jìn)行。設(shè)立一個的PCR實驗室。
2.純化模板所選用的方法對污染的風(fēng)險有極大影響。一般而言,只要能夠得到可靠的結(jié)果,純化的方法越簡單越好。
3.所有試劑都應(yīng)該沒有核酸和核酸酶的污染。操作過程中均應(yīng)戴手套。
4.PCR試劑配制應(yīng)使用zui高質(zhì)量的新鮮雙蒸水,采用0.22μm濾膜過濾除菌或高壓滅菌。
5.試劑都應(yīng)該以大體積配制,試驗一下是否滿意,然后分裝成僅夠一次使用的量儲存,從而確保實驗與實驗之間的連續(xù)性。
6.產(chǎn)品僅用于科研試劑或樣品準(zhǔn)備過程中都要使用一次性滅菌的塑料瓶和管子,玻璃器皿應(yīng)洗滌干凈并高壓滅菌。
7.PCR的樣品應(yīng)在冰浴上化開,并且要充分混勻。
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