微生物往往被視為“無處不在，無所不為”的生物，制作重組基因的載體和表達(dá)重組基因的受體也需要微生物。20世紀(jì)90年代后期開始了微生物基因組的研究。這項研究是從對微生物完整的全基因核苷酸測序入手，在分析基因結(jié)構(gòu)的基礎(chǔ)上，認(rèn)識微生物的完整生物學(xué)功能。 微生物基因組研究具有目標(biāo)明確、相對投入少、收效快、成果易于轉(zhuǎn)化為產(chǎn)品等許多優(yōu)點。目前大多數(shù)微生物基因組已被國外學(xué)者報道，或正在測序，但還有一些我國*的微生物資源，如投入力量進(jìn)行基因組研究，有可能很快獲得高起點的基地。

微生物是一群形體微小、肉眼看不見的生物，必須經(jīng)放大上千倍甚至數(shù)萬倍才能觀察到。在微生物諸多特性中，zui令人驚嘆的是它們具有極其多樣化的生理功能，可以在各種環(huán)境中生存：不僅在人或動植物體內(nèi)生存，還可在空氣稀薄的高空、高壓力的深海底和溫度高達(dá)90℃或－80℃的環(huán)境下生存，在礦井、油田、農(nóng)田，甚至沙漠中都有微生物的存在。因此微生物往往被視為“無處不在，無所不為”的生物。

目前一般將微生物分為真菌、放線菌、細(xì)菌、螺旋體、立克次體、衣原體、支原體和病毒。但隨著不斷發(fā)現(xiàn)新的微生物，種類還在不斷增多。病毒的種類（如流感病毒、肝炎病毒）在引起人類傳染病的各種病原體中占75%。放線菌是產(chǎn)生抗生素和微生物藥物的主要來源。細(xì)菌所致的嚴(yán)重人畜疾病仍占十分重要的地位，據(jù)世界衛(wèi)生組織預(yù)測，如無有效的防治措施，10年內(nèi)將有3000萬人因結(jié)核病死亡，3億人受結(jié)核菌感染。在過去的20年中，又發(fā)現(xiàn)30多種新病原微生物，比如新近發(fā)現(xiàn)幽門螺桿菌是引起胃潰瘍的病因，從而*改變了潰瘍病的治療原則。蛋白質(zhì)傳染粒子（Prion）引起的人類克－雅?。?/span>Creutzfeldt?Jakob）和瘋牛病將微生物致病病因覆蓋的領(lǐng)域更進(jìn)一步拓寬。在人類向外星球擴(kuò)展的過程中，微生物這一生命活動方式極其多樣化的特殊生物群體，將在科技的理論研究和開發(fā)應(yīng)用中占有十分重要的地位。

天然存在于腸道中的病毒，像居住在腸道中、構(gòu)成“微生物組”（microbiome）的細(xì)菌一樣發(fā)揮了維持健康以及對抗感染的作用。

在歷時兩年完成的一系列小鼠試驗中，該研究小組發(fā)現(xiàn)感染常見小鼠諾如病毒(murine norovirus,MNV)可幫助小鼠修復(fù)炎癥造成的腸組織損傷，在抗生素治療消滅微生物組后幫助恢復(fù)腸道的免疫防御。

 “我們的研究提供了令人信服的數(shù)據(jù)，表明小鼠腸道中病毒和細(xì)菌之間的相互支持關(guān)系，并為進(jìn)一步研究病毒組支持免疫系統(tǒng)的確切機(jī)制奠定了基礎(chǔ)，這有可能也適用于人類，”研究人員說。 “很久以前我們就知道人們老是感染病毒和細(xì)菌，并且他們不會生病?，F(xiàn)在我們獲得了科學(xué)證據(jù)證實，正如我們知道許多的細(xì)菌感染對于維持健康有益，并非所有的病毒感染都是不好的，實際上有可能有益于健康。”

根據(jù)研究人員所說，直到現(xiàn)在研究人員們還主要是追蹤病毒組存在的遺傳證據(jù)，但卻沒有人確認(rèn)它正常存在于腸道中，或是闡明其扮演的是有害、中立或有利的角色。

在他們的研究中，該研究小組借助了以往對于培育形成炎性腸病的小鼠的研究。人們認(rèn)為炎性腸病是一種受到微生物組細(xì)菌影響的疾病。該研究表明，在這些易感小鼠中慢性MNV感染可以對腸組織造成與慢性細(xì)菌暴露一樣的炎癥損傷，表明了一種相似的、免疫觸發(fā)作用。

在新研究中，Cadwell和同事們培育出了沒有正常腸道細(xì)菌，且由于缺乏細(xì)菌刺激和營養(yǎng)物免疫系統(tǒng)和腸均發(fā)育不全的小鼠，然后喂給這些小鼠MNV。相比于正常小鼠，這些小鼠缺乏免疫系統(tǒng)T細(xì)胞和B細(xì)胞，吸收營養(yǎng)物質(zhì)的腸絨毛萎縮、更細(xì)，在絨毛之間的隱窩中有一些小于正常的周圍組織。

在MNV感染兩周后，與其他病菌嚴(yán)格隔離的這些小鼠顯示免疫系統(tǒng)*恢復(fù)，幾乎*逆轉(zhuǎn)了腸損傷。

而在近期抗生素治療消滅了腸道微生物組的正常小鼠中，給予MNV同樣讓它們恢復(fù)了健康。它們血液中的T細(xì)胞水平增加了一倍，在腸組織和血液樣本中均可檢測到B細(xì)胞抗體。

另外的一些測試證實，MNV介導(dǎo)的治療效應(yīng)依賴于增強(qiáng)抗病毒1型干擾素蛋白傳遞的免疫系統(tǒng)信號，證實了這種病毒在驅(qū)動免疫反應(yīng)中發(fā)揮關(guān)鍵作用。