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案例解析 | 抗病毒生物大分子制藥治療

閱讀:676      發(fā)布時(shí)間:2020-3-25
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   近期爆發(fā)的新型冠狀病毒肺炎(COVID-19,對(duì)應(yīng)的病毒為SARS-CoV-2)突出了開(kāi)發(fā)有效治療方法的重要性。在近期的公眾號(hào)中,我們向大家介紹了“人民的希望”瑞德西韋的工作機(jī)制[1],在此,我們結(jié)合疫苗、血清、多肽和單抗的研究案例,向大家繼續(xù)介紹靶向病毒的大分子治療和我們的解決方案是如何推動(dòng)下一代治療研究的。
 
  針對(duì)MERS的疫苗優(yōu)化研究
 
  中東呼吸綜合征冠狀病毒(MERS-CoV),是近年來(lái)第二個(gè)造成大規(guī)模人群傳染的冠狀病毒,相較于SARS病毒,其致死率高、發(fā)病快,因此急需研發(fā)有效的疫苗用于被動(dòng)免疫。在2015年由NIH的Barney S. Graham主導(dǎo)的研究中,科學(xué)家評(píng)價(jià)和比較了靶向MERS的多種疫苗方案[2]。


 


 
  基于DNA和蛋白為免疫原的免疫流程,圖片源自參考資料2。
 
  圍繞MERS冠狀病毒的刺突蛋白(S),研究構(gòu)建了多種cDNA和蛋白免疫原,分別通過(guò)電轉(zhuǎn)和配合佐劑的形式免疫小鼠。為了提升研究的安全性,科學(xué)家建立了帶有化學(xué)發(fā)光報(bào)告基因的假病毒體系。通過(guò)檢測(cè)由病毒感染所致的化學(xué)發(fā)光,研究利用可溶性DPP4(MERS 靶點(diǎn))和DPP4抗體驗(yàn)證了假病毒的功能。


 
  MERS假病毒功能性驗(yàn)證,左圖:基于過(guò)表達(dá)技術(shù)驗(yàn)證DPP4過(guò)表達(dá)提升病毒的感染能力,Huh7.5內(nèi)源性高表達(dá)DPP4。中圖:基于可溶性DPP4的競(jìng)爭(zhēng)實(shí)驗(yàn)。右圖:利用DPP4抗體抑制假病毒的感染。假病毒的化學(xué)發(fā)光檢測(cè)基于96-well white/black Isoplate微孔板和Microbeta平臺(tái)。圖片源自參考資料2。
 
  借助假病毒體系,研究追蹤和評(píng)價(jià)了不同免疫策略產(chǎn)生的血清的中和能力和針對(duì)多種MERS病毒株的交叉中和能力。從結(jié)果可以看出,全程S1蛋白和2X S DNA-S1蛋白的免疫方案所獲得的抗體較為有效,且能中和多種MERS病毒株。通過(guò)進(jìn)一步的競(jìng)爭(zhēng)實(shí)驗(yàn)和血清吸附實(shí)驗(yàn),研究證實(shí)不同的免疫流程得到的血清靶向的S蛋白位置也不一樣。與經(jīng)典的微量中和實(shí)驗(yàn)(Microneutralization)相比,研究證實(shí)假病毒體系評(píng)價(jià)抗體中和能力更為敏感,靈敏度約有一個(gè)數(shù)量級(jí)的提升。通過(guò)解析抗體的亞型,研究發(fā)現(xiàn)基于S DNA的免疫方案能誘導(dǎo)IgG2a為主導(dǎo)的免疫反應(yīng),而S1蛋白刺激則產(chǎn)生IgG1為主導(dǎo)的免疫反應(yīng)。在小鼠中,IgG2a的出現(xiàn)反映了Th1型免疫反應(yīng),促進(jìn)了抗病毒相關(guān)因子如interferon-γ的釋放,提升了T細(xì)胞介導(dǎo)的抗病毒反應(yīng)。因此,相較于蛋白,基于DNA的疫苗可以通過(guò)建立T輔助細(xì)胞免疫應(yīng)答來(lái)更有效的控制病毒感染。


 
  血清的交叉中和能力檢測(cè)。假病毒的化學(xué)發(fā)光檢測(cè)基于96-well white/black Isoplate微孔板和Microbeta平臺(tái)。圖片源自參考資料2。
 
  對(duì)應(yīng)的,在非人靈長(zhǎng)類動(dòng)物(印度恒河猴)模型上,全程S1蛋白和2X S DNA-S1蛋白的免疫方案產(chǎn)生的中和抗體滴度*于基于全程DNA的免疫方案。病毒接種后,相較于對(duì)照組,免疫組動(dòng)物顯著降低肺部病理指標(biāo)。疫苗中DNA免疫原的引入更是進(jìn)一步緩解肺部的損傷情況,并加速了康復(fù)過(guò)程。


 
  基于非人靈長(zhǎng)類動(dòng)物(印度恒河猴)模型的疫苗評(píng)價(jià)。上圖:免疫流程。下左圖:動(dòng)物血清中和實(shí)驗(yàn),基于96-well white/black Isoplate微孔板和Microbeta平臺(tái)。下右圖:通過(guò)CT評(píng)價(jià)疫苗的保護(hù)作用。圖片源自參考資料2。
 
  No.2基于轉(zhuǎn)基因牛的抗病毒血清研究
 
  在抗擊SARS和流感的臨床療法中,“恢復(fù)期血漿”治療(Convalescent?phase plasma therapy)獲得了一定的成效,有效降低了死亡率。但是,該法的療效很大程度上依賴于是否能及時(shí)獲得有效的血清。相比下,基于動(dòng)物的超免疫血清雖然能解決量的問(wèn)題,但其使用可能會(huì)導(dǎo)致嚴(yán)重的免疫反應(yīng)和毒性。單克隆抗體療法,又一種基于被動(dòng)免疫的治療方法,面臨耗時(shí)長(zhǎng)和出現(xiàn)耐藥突變病毒株等挑戰(zhàn)。
 
  為了解決上述的問(wèn)題,有研究人員將目光轉(zhuǎn)向了轉(zhuǎn)基因牛(Transchromosomic (Tc) bovines)來(lái)快速獲得大量、有效的抗病毒血清。通過(guò)基因工程,研究人員敲除牛自身的IgG,并引入完整的、可IgG亞型人抗體表達(dá)體系,來(lái)達(dá)到免疫系統(tǒng)人源化的效果。免疫后的牛每只每月可提供高達(dá)150到600 g的人IgG。目前,已有多項(xiàng)臨床前研究利用該技術(shù)對(duì)抗MERS和Ebola等傳染病[3,4]。在此,我們著重介紹靶向MERS的研究。

 
  在免疫原段,該研究利用了兩種材料:滅活的Jordan病毒株(WKVV)和基于Al-Hasa病毒株S蛋白的納米材料(SPNV)。兩種免疫原均能刺激產(chǎn)生S蛋白特異的血清和人IgG(SAB-300/301)?;诎踩院蜕a(chǎn)可行性等因素,研究主要圍繞基于SPNV產(chǎn)生的人IgG開(kāi)展動(dòng)物和臨床研究。


 
  上圖:基于轉(zhuǎn)基因牛的免疫過(guò)程。下圖:利用Anti-Spike抗體檢測(cè)所得血清(左)和純化人IgG(右)的有效含量。圖片源自參考資料3。
 
  除了特異性檢測(cè)外,研究利用免疫熒光成像技術(shù),結(jié)合Anti-Spike抗體來(lái)衡量免疫所得血清和抗體的抗病毒中和作用(FRNA50)。相較于只能完成一輪感染的假病毒體系,F(xiàn)RNA50能直觀、全面地反映藥物處理對(duì)于病毒感染能力的影響。在該研究中,此法還結(jié)合mRNA檢測(cè)驗(yàn)證病毒的滅活效果,確保疫苗的安全性。結(jié)合FRNA50和傳統(tǒng)的半數(shù)組織培養(yǎng)感染量(Tissue culture infectious dose-50%,TCID50)測(cè)定法,研究證明純化的血清含有高水平的中和多抗。在過(guò)表達(dá)DPP4的小鼠模型上,無(wú)論是預(yù)防性還是治療性給藥,SAB-301都能有效的控制肺部的病毒量。在安全性上,SAB-301不支持抗體依賴的病毒感染增強(qiáng)作用(Antibody-dependent enhancement,ADE)。目前,由SAB Biotherapeutics公司推出的SAB-301已進(jìn)入一期臨床試驗(yàn)。


 
  利用FRNA50檢測(cè)所得血清(左)和純化人IgG(右)靶向MERS病毒的中和能力。FRNA50基于Operetta高內(nèi)涵平臺(tái)和配套微孔板。圖片源自參考資料3。
 
  No.3利用ADCC抗擊H7N9禽流感的單抗研究
 
  作為腫瘤免疫療法的主要推動(dòng)者,單克隆抗體(單抗)也被廣泛用于抗擊SARS和HIV等多種病毒的研究中。此外,基于HIV-1和流感中和單抗的研究也為疫苗設(shè)計(jì)提供了新的思路。但是,基于雜交瘤技術(shù)的傳統(tǒng)單抗制備面臨著耗時(shí)長(zhǎng),步驟多且繁瑣等問(wèn)題,限制了其對(duì)可能出現(xiàn)的新型疫情爆發(fā)的應(yīng)對(duì)能力。相比下,噬菌體展示技術(shù)為快讀獲得高親和力人源單抗提供了新的途徑?;谠摷夹g(shù)平臺(tái),復(fù)旦大學(xué)研究人員建立超大型天然全人源抗體庫(kù),并成功鑒定靶向MERS和流感的強(qiáng)力抗體[5,6]。


 
  在抗擊H7N9流感的工作中,為了獲得低突變的高特異抗體,研究人員以重組表達(dá)的HA和HA1蛋白為抗原,基于健康人B細(xì)胞來(lái)源的天然抗體庫(kù)開(kāi)展多輪篩選,獲得單抗m826。經(jīng)序列分析,研究人員證明m826與胚系基因高度同源,是胚系抗體。相較于體細(xì)胞高度突變的抗體,胚系抗體建立時(shí)間短,安全性高且成藥性更好,適用于靶向急性感染的抗體和疫苗研發(fā)。


 
  基于噬菌體展示技術(shù)的H7N9抗體篩選,圖片源自參考資料6。
 
  非常有意思的是,在紅細(xì)胞凝集抑制 (Hemagglutination inhibition,HI)反應(yīng)中,m826僅表現(xiàn)出微弱的抗病毒能力。進(jìn)一步的細(xì)胞病變效應(yīng)(Cytopathic effect,CPE)檢測(cè)和免疫熒光法中和實(shí)驗(yàn)證明m826不能中和流感病毒,抑制其在靶細(xì)胞的增殖。利用親脂性熒光染料R18和SP-DiOC18(3)來(lái)標(biāo)記病毒,研究發(fā)現(xiàn)m826對(duì)病毒與靶細(xì)胞的結(jié)合和膜融合過(guò)程無(wú)顯著影響。但是,m826能很強(qiáng)結(jié)合表達(dá)H7N9 HA蛋白的細(xì)胞,是ADCC(Antibody-dependent cell-mediated cytotoxicity,抗體依賴的細(xì)胞介導(dǎo)的細(xì)胞毒性作用)活力的強(qiáng)力介導(dǎo)者。同時(shí),由于不能中和H7N9病毒,m826還能成為高價(jià)值的工具性抗體。在動(dòng)物模型上,IgG1 m826能有效的預(yù)防和控制H7N9的感染。因此,m826依賴于ADCC,而不是中和能力抗擊流感病毒。這一發(fā)現(xiàn)為抗病毒抗體的篩選和研發(fā)提供了新的思路和途徑。


 
  左圖:基于免疫熒光成像技術(shù)(熒光標(biāo)記病毒)的中和實(shí)驗(yàn),H7N4抗體為中和陽(yáng)性對(duì)照。右上:病毒結(jié)合檢測(cè),紅色熒光探針R18標(biāo)記病毒,感染30分鐘后進(jìn)行成像檢測(cè)。NA為結(jié)合陰性對(duì)照;m336為陰性對(duì)照抗體。右下:利用熒光探針R18和SP-DiOC18(3)雙標(biāo)記病毒,病毒膜融合發(fā)生會(huì)誘導(dǎo)SP-DiOC18(3)綠色熒光信號(hào)加強(qiáng)。Baf A1為融合陰性對(duì)照。上述高通量成像檢測(cè)均基于Opera或Operetta高內(nèi)涵平臺(tái)。圖片源自參考資料6。
 
  No.4靶向膜融合的廣譜抗病毒多肽研究
 
  作為動(dòng)物來(lái)源的病毒,冠狀病毒因其多樣性,較高的傳播能力和進(jìn)化能力限制了單一的靶向療法的臨床應(yīng)用。因此,從長(zhǎng)遠(yuǎn)角度來(lái)看,能作用于多種冠狀病毒的新型廣譜抗病毒藥物,會(huì)成為抗擊流行性和新型冠狀病毒感染的武器。相較于高度變異的受體結(jié)合區(qū)(Receptor-binding domain, RBD),病毒膜融合涉及的Heptad repeat (HR)區(qū)高度保守。同時(shí)膜融合也是病毒感染和復(fù)制重要的功能性過(guò)程。因此,該區(qū)域成為了抑制性多肽的研究重點(diǎn)。靶向冠狀病毒的膜融合過(guò)程,來(lái)自于復(fù)旦大學(xué)的研究團(tuán)隊(duì)研發(fā)出廣譜多肽抑制劑EK1,為抗擊冠狀病毒和類似病毒提供了新的大分子治療策略[7]。

 
  冠狀病毒可通過(guò)胞內(nèi)體膜融合途徑(Endosomal pathway)或/和細(xì)胞表面胞漿膜融合途徑(Non-endosomal pathway)進(jìn)入細(xì)胞。病毒通過(guò)結(jié)合宿主細(xì)胞受體激活其S2亞基的HR1和HR2區(qū),互相結(jié)合形成對(duì)膜融合至關(guān)重要的6-HB(Six-helix bundle)結(jié)構(gòu)。


 
  冠狀病毒的膜融合過(guò)程和競(jìng)爭(zhēng)性多肽工作機(jī)制,圖片源自參考資料7。
 
  鑒于此,研究人員以多種冠狀病毒的保守HR區(qū)為模板,合成HR1和HR2區(qū)來(lái)源的多肽(HR1P和HR2P)用于競(jìng)爭(zhēng)。通過(guò)過(guò)表達(dá)技術(shù),研究進(jìn)一步建立靶向多種冠狀病毒的細(xì)胞細(xì)胞融合實(shí)驗(yàn),系統(tǒng)性篩查HR1P和HR2P對(duì)細(xì)胞融合的抑制。結(jié)果顯示由OC43株來(lái)源的HR2P具有廣譜且強(qiáng)效的抑制融合能力。在此基礎(chǔ)上,研究人員通過(guò)引入氨基酸和突變等方法,進(jìn)一步優(yōu)化多肽的可溶性和成藥性。所獲得的多肽EK1,在進(jìn)一步的一系列體外檢測(cè),包括細(xì)胞細(xì)胞融合實(shí)驗(yàn),假病毒法,Blam-Vpr法和活病毒增殖能力檢測(cè)中,都表現(xiàn)出強(qiáng)效的廣譜抗病毒能力。


 
  細(xì)胞細(xì)胞融合實(shí)驗(yàn),過(guò)表達(dá)病毒S蛋白并帶有GFP信號(hào)的293T細(xì)胞為作用細(xì)胞,Huh-7為靶細(xì)胞,圖片源自參考資料7。
 
  除了可以用于免疫缺陷和老年患者外,多肽類藥物的另一優(yōu)勢(shì)是支持非侵入性鼻腔給藥,適合用于靶向呼吸道的病毒感染。因此,檢測(cè)鼻腔給藥下的EK1的體內(nèi)分布非常重要。基于活體成像技術(shù),研究觀察到Cy5熒光標(biāo)記的EK1可廣泛分布于整個(gè)呼吸道中,并集中在肺部。此外,一些肺外的器官,包括肝臟、腎和脾,都能檢測(cè)到EK1的分布,表明EK1可以進(jìn)入血液循環(huán)系統(tǒng)和其他臟器中。因此,EK1還可能作用于由冠狀病毒導(dǎo)致的系統(tǒng)性或多器官感染。在OC43和MERS感染小鼠模型上,EK1均表現(xiàn)出強(qiáng)力的抗病毒能力,有效抑制了因感染帶來(lái)的體重減輕和死亡現(xiàn)象。從體外到體內(nèi)的多方面安全性評(píng)價(jià)表明通過(guò)鼻腔給藥的EK1是低免疫原性,安全的治療策略。因此,EK1是一個(gè)新型、有潛力的廣譜抗冠狀病毒藥物,值得進(jìn)一步的深入研究。


 
  上:基于活體成像檢測(cè)鼻腔給藥下Cy5標(biāo)記的EK1在小鼠體內(nèi)的分布;小動(dòng)物活體成像檢測(cè)基于IVIS平臺(tái)。下:EK1處理對(duì)模型鼠死亡率、體重和病毒滴度的影響,圖片源自參考資料7。
 
  總結(jié)
 
  通過(guò)上述四個(gè)案例,我們總體介紹了靶向病毒段的大分子療法的研究流程和關(guān)注點(diǎn)。助力此類治療方法的研發(fā),珀金埃爾默提供成熟的整體應(yīng)用解決方案。針對(duì)攜帶螢火蟲(chóng)報(bào)告基因的假病毒研究,我們提供全面、配套的涵蓋化學(xué)發(fā)光試劑,微孔板和高通量檢測(cè)平臺(tái)的解決方案。對(duì)于基于慢病毒包裝系統(tǒng)的假病毒,我們還可以提供p24檢測(cè)解決方案,用于快速衡量病毒的感染能力。此外,基于成像平臺(tái)的解決方案,我們還可以分析短程和長(zhǎng)程的復(fù)雜亞細(xì)胞活動(dòng),例如由病毒介導(dǎo)的膜融合過(guò)程。在血清和抗體的篩查和分析中,強(qiáng)大的高內(nèi)涵解決方案能更大程度發(fā)揮表型篩選的優(yōu)勢(shì),發(fā)現(xiàn)具有中和能力、安全的潛在抗體。同時(shí),ADCC,作為關(guān)鍵的抗感染抗體工作機(jī)制之一,也是我們的主要應(yīng)用關(guān)注點(diǎn)。針對(duì)ADCC的檢測(cè),我們提供金標(biāo)準(zhǔn)、靈活的放射和非放射解決方案,助力抗體類藥物的深入評(píng)價(jià)[8]。然后,在臨床前動(dòng)物研究中,除了中和檢測(cè)外,我們提供覆蓋功能到結(jié)構(gòu)的活體成像解決方案,助力病理檢測(cè)、藥物分析和藥效評(píng)價(jià)等核心工作。
 
  參考文獻(xiàn)
 
  1. 藥物機(jī)制解讀 | “人民的希望”抗病毒藥物瑞德西韋(Remdesivir)
 
  2. Wang L, et al. Evaluation of candidate vaccine approaches for MERS-CoV. Nat Commun. 2015 Jul 28;6:7712.
 
  3. Luke T, et al. Human polyclonal immunoglobulin G from transchromosomic bovines inhibits MERS-CoV in vivo. Sci Transl Med. 2016 Feb 17;8(326):326ra21.
 
  4. Thomas Luke, et al. Fully Human Immunoglobulin G From Transchromosomic Bovines Treats Nonhuman Primates Infected With Ebola Virus Makona Isolate. J Infect Dis. 2018 Dec 15; 218(Suppl 5): S636–S648.
 
  5. Ying T, et al. Junctional and allele-specific residues are critical for MERS-CoV neutralization by an exceptionally potent germline-like antibody. Nat Commun. 2015 Sep 15;6:8223.
 
  6. Fei Yu,et al. A potent germline-like human monoclonal antibody targets a pH-sensitive epitope on H7N9 influenza hemagglutinin. Cell Host Microbe. 2017 Oct 11; 22(4): 471–483.e5.
 
  7. Shuai Xia,et al. A pan-coronavirus fusion inhibitor targeting the HR1 domain of human coronavirus spike. Sci Adv. 2019 Apr; 5(4): eaav4580
 
  8. DELFIA經(jīng)典技術(shù)應(yīng)用于單抗研發(fā)及細(xì)胞治療——AD0116細(xì)胞殺傷專題之ADCChttps://mp.weixin.qq.com/s/0lkBdDHL5MFIyoeoFV4wWQ
 

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