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Alpha助力發(fā)現(xiàn)小分子化藥耐藥性

閱讀:122      發(fā)布時(shí)間:2019-12-16
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 大部分化療藥物如鉑類(lèi)藥物等,都是通過(guò)破壞腫瘤細(xì)胞中的DNA來(lái)抑制細(xì)胞的生長(zhǎng),從而達(dá)到治療效果。然而,“聰明”的腫瘤可以采用另一種替代性的DNA跨損傷合成(translesion synthesis,TLS)途徑來(lái)完成復(fù)制并獲得耐藥性。針對(duì)TLS的靶向化治療是非常有前景的開(kāi)發(fā)方案。

來(lái)自麻省理工學(xué)院和杜克大學(xué)的研究人員發(fā)現(xiàn)一種可阻斷TLS途徑的小分子化合物并發(fā)表在CELL上。同時(shí),用這種化合物和順鉑聯(lián)合治療體外腫瘤細(xì)胞和荷瘤小鼠時(shí),都有顯著的效果。

這樣有臨床應(yīng)用潛力的明星分子是如何被發(fā)現(xiàn)的呢?

在哺乳動(dòng)物細(xì)胞中,TLS的發(fā)生包括兩個(gè)步驟,首先插入TLS DNA聚合酶,如POL kPOL i、POL h或REV1,在損傷處引入一個(gè)核苷酸;接下來(lái)是募集b族聚合酶復(fù)合物POL z (POL z4: REV3L/REV7/POLD2/POLD3)進(jìn)行3’端的延伸。而其中起主要作用的是約100個(gè)氨基酸的REV1 C-terminal domain (CTD),它可以招募插入TLS的其他聚合酶POL k、POL i和POL h,并通過(guò)與REV7的相互作用來(lái)招募POL z。

基于此,作者首先分別構(gòu)建了His8-tagged REV7/3和FLAG-tagged POL k RIR-REV1 CTD表達(dá)系統(tǒng)并對(duì)融合蛋白進(jìn)行純化,然后基于ELISA方法對(duì)化合物庫(kù)中高達(dá)~10000種化合物進(jìn)行篩選,并將目標(biāo)鎖定了JH-RE-06。

然后作者采用高靈敏定量AlphaScreen技術(shù),通過(guò)抗FLAG供體微珠、抗His受體微珠構(gòu)建勻相反應(yīng)體系,進(jìn)一步確定了化合物JH-RE-06對(duì)REV1-REV7的阻斷作用,并得出了其IC50值為0.78 mM。

 

隨后,作者在分別在多種人類(lèi)癌細(xì)胞和人類(lèi)黑色素瘤小鼠模型上進(jìn)行了驗(yàn)證,證實(shí)此化合物可以提高癌細(xì)胞對(duì)順鉑類(lèi)化合物的敏感性和長(zhǎng)期化療的有效性,并對(duì)其他以DNA為作用靶標(biāo)的類(lèi)似藥物,都有同樣的類(lèi)似效果。

作者用清晰的思路論述了篩選和驗(yàn)證化合物的過(guò)程,并進(jìn)一步討論了化合物耐藥性機(jī)制:JH-RE-06能與Rev1結(jié)合并生成二聚體,而一旦形成這樣的二聚體結(jié)構(gòu),則不能與Rev3 / Rev7 TLS DNA聚合酶結(jié)合,直接阻止了TLS的發(fā)生和癌細(xì)胞的快速?gòu)?fù)制,同時(shí),也更進(jìn)一步制止了突變產(chǎn)生的可能性,避免了癌細(xì)胞獲得耐藥性。

 

在整個(gè)實(shí)驗(yàn)過(guò)程中,采用ALPHA技術(shù)對(duì)初篩得到的化合物JH-RE-06的功能驗(yàn)證是非常重要的一步:

ALPHA的方法采用單體氧作為能量擴(kuò)散的載體,其擴(kuò)散距離可以達(dá)到200nm,發(fā)光原理為化學(xué)反應(yīng)發(fā)光,具有背景干凈、信噪比高的特點(diǎn),同樣適合于復(fù)雜樣品的檢測(cè),如組織液、血清、組織裂解液等,步驟少、方法簡(jiǎn)單、均相反應(yīng)、不需要洗滌,因此實(shí)驗(yàn)結(jié)果質(zhì)量更高。同時(shí)推薦選擇具有HTS ALPHA檢測(cè)模塊的多功能酶標(biāo)儀進(jìn)行抗體的篩選,可以大大縮短檢測(cè)時(shí)間。

 

參考文獻(xiàn)

Jessica L. Wojtaszek, Nimrat Chatterjee, et al. ;(2019).A Small Molecule Targeting Mutagenic Translesion Synthesis Improves Chemotherapy. Cell. 178, 1–8,June 27

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