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  • 英國Anglia A.I.公司PhenoSeed自動(dòng)化種子發(fā)芽分析系統(tǒng)

英國Anglia A.I.公司PhenoSeed自動(dòng)化種子發(fā)芽分析系統(tǒng)

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  • 型號
  • 品牌
  • 所在地上海
  • 更新時(shí)間2024-12-31
  • 廠商性質(zhì)經(jīng)銷商
  • 入駐年限2
  • 實(shí)名認(rèn)證已認(rèn)證
  • 產(chǎn)品數(shù)量840
  • 人氣值14787
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上海澤泉科技股份有限公司(Zealquest Scientific Technology Co., Ltd.)成立于2000年,是一家專注于科研設(shè)備研發(fā)、系統(tǒng)集成、技術(shù)推廣、咨詢、銷售和、科研服務(wù)的*。公司注冊資金3500萬元人民幣,具有進(jìn)出口貿(mào)易權(quán)。

公司總部位于上海浦西,在北京設(shè)有分公司,在廣州、成都、武漢分別設(shè)有代表處。公司全體員工均具有高等教育背景,其中80%的技術(shù)研發(fā)、技術(shù)支持和銷售人員具有碩士和博士學(xué)位,參加過很多國家和省部級重大科研項(xiàng)目,具有豐富的科研工作經(jīng)驗(yàn)。上海澤泉科技股份有限公司是上海市*、上海市普陀區(qū)科技小巨人企業(yè)、上海市科技型企業(yè)、中華全國*合會(huì)/上海市*合會(huì)/上海市商會(huì)會(huì)員單位,還是上海市專業(yè)技術(shù)服務(wù)平臺(tái)——生理生態(tài)測量與分析平臺(tái)的依托單位和上海市*成果轉(zhuǎn)化項(xiàng)目承擔(dān)單位。2012年公司通過了ISO9001質(zhì)量管理體系認(rèn)證,獲得AA*信用資質(zhì)等級認(rèn)定,獲得普陀區(qū)科技小巨人企業(yè)認(rèn)定,成為上海市研發(fā)公共服務(wù)平臺(tái)加盟單位和“上海市*合會(huì)”/“上海市商會(huì)”會(huì)員單位 。2015年獲得“專精特新”中小企業(yè)認(rèn)定。2016年成為“上海市生態(tài)學(xué)學(xué)會(huì)常務(wù)理事單位” ,和“上海種子行業(yè)協(xié)會(huì)”會(huì)員單位。

上海澤泉科技股份有限公司非常注重自主知識產(chǎn)權(quán)的申報(bào)和保護(hù),截止2017年初已獲得發(fā)明9項(xiàng)、實(shí)用新型33項(xiàng)及軟件著作8項(xiàng),國內(nèi)外科研期刊發(fā)表科研論文20多篇。公司還參與承擔(dān)了國家自然科學(xué)基金重點(diǎn)項(xiàng)目(41030529)和*948項(xiàng)目(200907)。

公司秉承推進(jìn)中國生態(tài)環(huán)境改善、農(nóng)業(yè)興國的理念,服務(wù)涉及植物表型組學(xué)和基因組學(xué)、植物生理生態(tài)、土壤、環(huán)境氣象、水文水利等領(lǐng)域的科研和技術(shù)支持,服務(wù)對象主要為各級科研單位、高校和政府機(jī)構(gòu)。公司先后為*“973”項(xiàng)目和“863”項(xiàng)目、國家科技重大專項(xiàng)、國家科技支撐計(jì)劃、國家“211”工程和“985”工程、中科院知識創(chuàng)新工程、*“948”項(xiàng)目、*“948”項(xiàng)目等提供技術(shù)咨詢、儀器設(shè)備、系統(tǒng)解決方案和系統(tǒng)集成服務(wù),為項(xiàng)目的順利完成提供了有力支持。

多年來,公司積極參與相關(guān)領(lǐng)域的學(xué)術(shù)會(huì)議,并定期舉辦相關(guān)儀器設(shè)備的技術(shù)講座和培訓(xùn)班,在科研和監(jiān)測領(lǐng)域產(chǎn)生了積極的反響,獲得了良好的口碑。截止2016年底,澤泉科技舉辦公開技術(shù)講座200場,參會(huì)人員超過7100人次;同時(shí)在國內(nèi)外應(yīng)邀參加學(xué)術(shù)會(huì)議和展會(huì)139次,與相關(guān)領(lǐng)域的客戶有非常密切的交流合作。

2014年2月,上海澤泉科技股份有限公司在上海浦東孫橋現(xiàn)代農(nóng)業(yè)園區(qū)投資成立了上海乾菲諾農(nóng)業(yè)科技有限公司,建設(shè)了亞洲*家AgriPhenoTM“高通量植物基因型-表型-育種服務(wù)平臺(tái)”,為植物科研和育種單位提供全面的樣品收集和栽培,實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)和項(xiàng)目合作,以及表型數(shù)據(jù)與生物信息學(xué)分析綜合服務(wù)。平臺(tái)運(yùn)營至今,成功主持了上海張江國家自主創(chuàng)新示范區(qū)專項(xiàng)發(fā)展資金重點(diǎn)項(xiàng)目“澤泉科技高通量植物基因型-表型-育種服務(wù)平臺(tái)”。作為主持單位或合作單位參與了上海市農(nóng)委和科委的30多項(xiàng)政府科研服務(wù)項(xiàng)目以及商業(yè)服務(wù)項(xiàng)目,如科技興農(nóng)種業(yè)發(fā)展項(xiàng)目“農(nóng)作物分子育種的技術(shù)創(chuàng)新研究”和“青菜高通量表型圖譜標(biāo)準(zhǔn)的建立及主要性狀分析”、科技興農(nóng)重點(diǎn)攻關(guān)項(xiàng)目“基于圖像分析及三維建模技術(shù)的黃瓜長勢快速評價(jià)方法研究”、 “蘭科觀賞花卉分子育種技術(shù)研究與產(chǎn)業(yè)化應(yīng)用”等。

結(jié)合Agripheno平臺(tái)現(xiàn)有實(shí)驗(yàn)室、溫室栽培和基礎(chǔ)科研條件,公司積極響應(yīng)上海市政府“崇明生態(tài)島建設(shè)”的發(fā)展方向,2016年12月澤泉科技在崇明城橋鎮(zhèn)投資成立了子公司—上海金盞農(nóng)業(yè)發(fā)展有限公司,擴(kuò)展建設(shè)田間智能化育種服務(wù)平臺(tái),以及智能化農(nóng)業(yè)物聯(lián)網(wǎng)“農(nóng)業(yè)云平臺(tái)”,以生態(tài)鄉(xiāng)村、能源鄉(xiāng)村的發(fā)展模式,展示并實(shí)施公司自主研發(fā)的*的農(nóng)業(yè)樓宇基礎(chǔ)設(shè)施、溫室與田間的智能化“多因子”調(diào)控的栽培管理模式;擬建成*擁有田間型高通量表型分析系統(tǒng)的“Agripheno智能化育種服務(wù)平臺(tái)”,提高上海種業(yè)商業(yè)化育種的進(jìn)程,并服務(wù)于全國和國外相關(guān)育種科研單位。

 展望未來,上海澤泉科技股份有限公司希望在社會(huì)多方資源的支持和關(guān)懷下,不斷提升自己,為社會(huì)提供更多、更優(yōu)秀的產(chǎn)品和的服務(wù)!

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PhenoSeed自動(dòng)化種子發(fā)芽分析系統(tǒng)是由英國AngliaA.I.公司研發(fā)的一款可實(shí)時(shí)對種子發(fā)芽性狀自動(dòng)分析的系統(tǒng),PhenoSeed系統(tǒng)可高通量分析種子發(fā)芽的形態(tài)特征、形態(tài)分類、發(fā)芽率等,數(shù)據(jù)穩(wěn)定可靠、重復(fù)性高,PhenoSeed系統(tǒng)兼容Jacobsen發(fā)芽床
英國Anglia A.I.公司PhenoSeed自動(dòng)化種子發(fā)芽分析系統(tǒng) 產(chǎn)品詳情

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PhenoSeed自動(dòng)化種子發(fā)芽分析系統(tǒng)是由英國Anglia A.I.公司研發(fā)的一款可實(shí)時(shí)對種子發(fā)芽性狀自動(dòng)分析的系統(tǒng),PhenoSeed系統(tǒng)可高通量分析種子發(fā)芽的形態(tài)特征、形態(tài)分類、發(fā)芽率等,數(shù)據(jù)穩(wěn)定可靠、重復(fù)性高,PhenoSeed系統(tǒng)兼容Jacobsen發(fā)芽床。


應(yīng)用領(lǐng)域

適用于小麥、玉米、苜蓿、水稻、谷子、高粱、蔬菜、花卉、樹木種子等的種子性狀研究,也可根據(jù)研究需求定制其它物種。


測量參數(shù)

  • 種子大小、顏色、形狀、發(fā)芽率、發(fā)芽時(shí)間、種子排序(1~5)、種子活力(基于形態(tài)變化)、發(fā)芽顏色等

  • 對上述分析的種子進(jìn)行種子分級


系統(tǒng)參數(shù)

1. PhenoSeed硬件系統(tǒng):

1.1 發(fā)芽床:

1.1.1 工作溫度為+4 ~ +40°C

1.1.2 溫度調(diào)整幅度:±0.1℃

1.1.3 溫度精確度:±0.5°C

1.1.4 外形尺寸:1650mm(寬) x 950mm(深) x 1010mm(高)

1.1.5 測量面積:1450mm(寬) x 820mm(深)

1.1.6 冷凝器:功率230V/ 50Hz, 1.6Kw

1.1.7 照明:帶空氣冷卻的照明系統(tǒng)

1.1.8 隔離罩:系統(tǒng)配備隔離罩,用于保持發(fā)芽環(huán)境的濕度

1.2 觸摸屏:7英寸(用于控制溫度、濕度、光線、晝夜循環(huán)、定時(shí)等)

1.3 帶USB的板載數(shù)據(jù)記錄儀功能

1.4種子萌發(fā)自動(dòng)成像系統(tǒng)

1.4.1 成像單元:1套高清自動(dòng)對焦成像單元

1.4.2 像素:1800 - 2400萬像素

1.4.3 多光譜成像單元:可選配多光譜成像單元

1.4.4 成像系統(tǒng)尺寸:1650mm(寬) x 950mm(深) x 350mm(高)

1.4.5 結(jié)構(gòu):鋁型材框架,可自動(dòng)在測量面積內(nèi)對種子進(jìn)行成像

1.4.6 連接:RJ45以太網(wǎng),Wi-Fi

1.4.7 界面:7寸電容觸摸屏

1.4.8 電源要求:220~240V交流

1.4.9 成像:種子層的俯視圖,1小時(shí)間隔,每張圖片1800 - 2400萬像素

 

2. PhenoSeed控制軟件:

2.1 用于二維碼生成和識別技術(shù)的服務(wù)器或基于云的控制軟件

2.2 自動(dòng)管理多個(gè)項(xiàng)目、實(shí)驗(yàn)、植物基因型和物種

2.3 數(shù)據(jù)可以下載到USB存儲(chǔ)器或以編程方式提取(RESTful API)用于工作流集成

2.4 采用7英寸觸摸屏界面控制

 

3. PhenoSeed分析軟件:

3.1 基于圖形用戶界面(GUI)的分析軟件,可以在Windows操作系統(tǒng)中操作

3.2 基于GUI的性狀表型分析模塊:種子大小、顏色、形狀、發(fā)芽率、發(fā)芽時(shí)間、種子排序(1~5)、種子活力(基于形態(tài)變化)、發(fā)芽顏色。

3.3 對上述分析的種子進(jìn)行種子分級(對于多光譜評估,需要不同的相機(jī)設(shè)置)

3.4 基于數(shù)據(jù)庫的數(shù)據(jù)管理

3.5 可下載的基于csv的文件、處理過的圖像(.jpg)和發(fā)芽相關(guān)特征圖(.jpg)

 

應(yīng)用案例

近日,南京農(nóng)業(yè)大學(xué)作物表型組學(xué)交叉研究中心周濟(jì)教授作為通訊作者與英國約翰.英納斯中心(John Innes Centre)的Steven Penfield教授、先正達(dá)種業(yè)集團(tuán)(Syngenta Seeds,歐洲區(qū))的Rene Benjamins博士共同在國際植物學(xué)期刊《新植物學(xué)家》(New Phytologist主要出版植物學(xué)領(lǐng)域高質(zhì)量和創(chuàng)新性研究內(nèi)容,影響因子8.512)上發(fā)表了關(guān)于種子發(fā)芽表型自動(dòng)化采集和基于機(jī)器學(xué)習(xí)分析的高通量作物種子發(fā)芽表型監(jiān)測平臺(tái)——SeedGerm: a cost‐effective phenotyping platform for automated seed imaging and machine‐learning based phenotypic analysis of crop seed germination



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本文對自主開發(fā)的自動(dòng)化表型采集和分析平臺(tái)SeedGerm如何完成作物種子發(fā)芽的自動(dòng)化時(shí)序拍攝、基于圖像的表型分析和基于監(jiān)督式的機(jī)器學(xué)習(xí)、針對不同作物類型的高通量性狀分析進(jìn)行了詳細(xì)的介紹。SeedGerm系統(tǒng)基于經(jīng)濟(jì)型的硬件和開源軟件設(shè)計(jì),涵蓋了對小麥、大麥、玉米、番茄、辣椒和油菜等不同作物類型的種子發(fā)芽試驗(yàn)、發(fā)芽時(shí)序圖像,泛化圖像處理、實(shí)時(shí)訓(xùn)練和基于機(jī)器學(xué)習(xí)的表型性狀分析;生成可靠的發(fā)芽性狀分析數(shù)據(jù)集以供量化分析。本文還從統(tǒng)計(jì)上分析了幼根突破種皮的時(shí)間和評價(jià)標(biāo)準(zhǔn),通過生物學(xué)家的評判相關(guān)性、動(dòng)態(tài)發(fā)芽曲線、多個(gè)發(fā)芽率梯度等重要發(fā)芽性狀,對88個(gè)油菜品種進(jìn)行基因型-表型關(guān)聯(lián)分析,并定位到了一個(gè)關(guān)于脫落酸(abscisic acid,ABA)信號轉(zhuǎn)導(dǎo)的相關(guān)基因。此外,本文還介紹了開源SeedGerm系統(tǒng)在作物發(fā)芽研究、育種和種子監(jiān)測中的應(yīng)用,顯示了其在科學(xué)研究和生產(chǎn)實(shí)踐中廣泛的應(yīng)用前景。


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SeedGerm的硬件設(shè)備(兩種類型:有線和無線連接)
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SeedGerm的軟件系統(tǒng)
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SeedGerm的核心分析算法
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SeedGerm用于檢測88種具有不同發(fā)芽特性的甘藍(lán)型油菜的遺傳差異

隨著基因組學(xué)和測序技術(shù)的飛速發(fā)展,基因型數(shù)據(jù)海量擴(kuò)充,而高質(zhì)量表型數(shù)據(jù)的匱乏已經(jīng)逐步成為鑒定基因-性狀關(guān)聯(lián)、解析環(huán)境對性狀的影響,進(jìn)而實(shí)現(xiàn)作物改良和加快植物研究的瓶頸。近年來,信息技術(shù)、人工智能和農(nóng)業(yè)大數(shù)據(jù)等新興研究領(lǐng)域的不斷完善,多學(xué)科交叉為高通量、自動(dòng)化作物表型組研究奠定了堅(jiān)實(shí)的基礎(chǔ)。以植物生命史和田間生產(chǎn)的起點(diǎn)——發(fā)芽為例,種子發(fā)芽和幼苗建成不僅是自然界植物群落形成的主要瓶頸,也是糧食作物和很多園藝作物在田間快速、整齊生長發(fā)育的關(guān)鍵步驟。在科學(xué)研究和農(nóng)業(yè)生產(chǎn)中都是考評品種表現(xiàn)、栽培管理水平的重要依據(jù)。當(dāng)前大部分種子發(fā)芽表型的獲取依然依靠人工識別,對經(jīng)驗(yàn)和專業(yè)知識有較高要求,通量也受到極大的限制。此外,不同科研人員之間在評判上會(huì)有一定的偏差,很難實(shí)現(xiàn)客觀的量化分析。因此可用于多物種的種子發(fā)芽表型性狀的高通量、高精度、標(biāo)準(zhǔn)化獲取和分析方法的開發(fā)尤為重要和迫切


南農(nóng)大作物遺傳與種質(zhì)創(chuàng)新國家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室、作物表型組學(xué)交叉研究中心和江蘇省現(xiàn)代作物生產(chǎn)協(xié)同創(chuàng)新中心為通訊單位。此外,上海農(nóng)科院農(nóng)業(yè)生物基因中心和南農(nóng)大工學(xué)院盧偉副教授也參與了本項(xiàng)目。英國國立農(nóng)業(yè)植物研究所(National Institute of Agricultural Botany, NIAB)下屬的劍橋作物研究中心(Cambridge Crop Research Centre)也共同參與了本項(xiàng)目的研發(fā)、分析和測試。


周濟(jì),中國國籍,英國生物學(xué)會(huì)會(huì)士 (The Fellow of the Royal Society of Biology,F(xiàn)RSB);南京農(nóng)業(yè)大學(xué)作物表型組學(xué)交叉研究中心特聘教授,周濟(jì)實(shí)驗(yàn)室主任,博導(dǎo);英國國立農(nóng)業(yè)植物研究所、劍橋作物研究中心數(shù)字科學(xué)研發(fā)部門主管(Head of Data Sciences)、創(chuàng)新實(shí)驗(yàn)室主任,博導(dǎo)。在傳統(tǒng)表型采集和分析算法基礎(chǔ)上,依托南農(nóng)大、劍橋大學(xué)植物科學(xué)系和超算中心,專注于高通量植物表型分析算法、計(jì)算機(jī)視覺和人工智能算法在表型分析中的開發(fā)和應(yīng)用。2011年博士畢業(yè)至今,以生物信息學(xué)專家的身份參與完成多項(xiàng)交叉基礎(chǔ)、應(yīng)用研究項(xiàng)目。作為主要完成者在Nature,Nature Plants,Plant Cell,New Phytologist, GigaScience和Horticulture Research等國際期刊撰寫發(fā)表學(xué)術(shù)論文25篇,總影響因子超過180,自2015年起被引證超過1000次,其中以、通訊、共同通訊作者發(fā)表論文18篇。定期為多家國際學(xué)術(shù)期刊審稿。獲得國際發(fā)明1項(xiàng),英國發(fā)明1項(xiàng)。研究成果被多家歐洲媒體報(bào)道或?qū)TL,包括英國國家媒體如ITV,BBC,Guardian,Cambridge Network等。


產(chǎn)地:英國Anglia A.I.

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