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野外型高通量植物表型平臺(tái)——Field Scanalyzer

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同類產(chǎn)品

上海澤泉科技股份有限公司(Zealquest Scientific Technology Co., Ltd.)成立于2000年,是一家專注于科研設(shè)備研發(fā)、系統(tǒng)集成、技術(shù)推廣、咨詢、銷售和、科研服務(wù)的*。公司注冊資金3500萬元人民幣,具有進(jìn)出口貿(mào)易權(quán)。

公司總部位于上海浦西,在北京設(shè)有分公司,在廣州、成都、武漢分別設(shè)有代表處。公司全體員工均具有高等教育背景,其中80%的技術(shù)研發(fā)、技術(shù)支持和銷售人員具有碩士和博士學(xué)位,參加過很多國家和省部級重大科研項(xiàng)目,具有豐富的科研工作經(jīng)驗(yàn)。上海澤泉科技股份有限公司是上海市*、上海市普陀區(qū)科技小巨人企業(yè)、上海市科技型企業(yè)、中華全國*合會(huì)/上海市*合會(huì)/上海市商會(huì)會(huì)員單位,還是上海市專業(yè)技術(shù)服務(wù)平臺(tái)——生理生態(tài)測量與分析平臺(tái)的依托單位和上海市*成果轉(zhuǎn)化項(xiàng)目承擔(dān)單位。2012年公司通過了ISO9001質(zhì)量管理體系認(rèn)證,獲得AA*信用資質(zhì)等級認(rèn)定,獲得普陀區(qū)科技小巨人企業(yè)認(rèn)定,成為上海市研發(fā)公共服務(wù)平臺(tái)加盟單位和“上海市*合會(huì)”/“上海市商會(huì)”會(huì)員單位 。2015年獲得“專精特新”中小企業(yè)認(rèn)定。2016年成為“上海市生態(tài)學(xué)學(xué)會(huì)常務(wù)理事單位” ,和“上海種子行業(yè)協(xié)會(huì)”會(huì)員單位。

上海澤泉科技股份有限公司非常注重自主知識(shí)產(chǎn)權(quán)的申報(bào)和保護(hù),截止2017年初已獲得發(fā)明9項(xiàng)、實(shí)用新型33項(xiàng)及軟件著作8項(xiàng),國內(nèi)外科研期刊發(fā)表科研論文20多篇。公司還參與承擔(dān)了國家自然科學(xué)基金重點(diǎn)項(xiàng)目(41030529)和*948項(xiàng)目(200907)。

公司秉承推進(jìn)中國生態(tài)環(huán)境改善、農(nóng)業(yè)興國的理念,服務(wù)涉及植物表型組學(xué)和基因組學(xué)、植物生理生態(tài)、土壤、環(huán)境氣象、水文水利等領(lǐng)域的科研和技術(shù)支持,服務(wù)對象主要為各級科研單位、高校和政府機(jī)構(gòu)。公司先后為*“973”項(xiàng)目和“863”項(xiàng)目、國家科技重大專項(xiàng)、國家科技支撐計(jì)劃、國家“211”工程和“985”工程、中科院知識(shí)創(chuàng)新工程、*“948”項(xiàng)目、*“948”項(xiàng)目等提供技術(shù)咨詢、儀器設(shè)備、系統(tǒng)解決方案和系統(tǒng)集成服務(wù),為項(xiàng)目的順利完成提供了有力支持。

多年來,公司積極參與相關(guān)領(lǐng)域的學(xué)術(shù)會(huì)議,并定期舉辦相關(guān)儀器設(shè)備的技術(shù)講座和培訓(xùn)班,在科研和監(jiān)測領(lǐng)域產(chǎn)生了積極的反響,獲得了良好的口碑。截止2016年底,澤泉科技舉辦公開技術(shù)講座200場,參會(huì)人員超過7100人次;同時(shí)在國內(nèi)外應(yīng)邀參加學(xué)術(shù)會(huì)議和展會(huì)139次,與相關(guān)領(lǐng)域的客戶有非常密切的交流合作。

2014年2月,上海澤泉科技股份有限公司在上海浦東孫橋現(xiàn)代農(nóng)業(yè)園區(qū)投資成立了上海乾菲諾農(nóng)業(yè)科技有限公司,建設(shè)了亞洲*家AgriPhenoTM“高通量植物基因型-表型-育種服務(wù)平臺(tái)”,為植物科研和育種單位提供全面的樣品收集和栽培,實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)和項(xiàng)目合作,以及表型數(shù)據(jù)與生物信息學(xué)分析綜合服務(wù)。平臺(tái)運(yùn)營至今,成功主持了上海張江國家自主創(chuàng)新示范區(qū)專項(xiàng)發(fā)展資金重點(diǎn)項(xiàng)目“澤泉科技高通量植物基因型-表型-育種服務(wù)平臺(tái)”。作為主持單位或合作單位參與了上海市農(nóng)委和科委的30多項(xiàng)政府科研服務(wù)項(xiàng)目以及商業(yè)服務(wù)項(xiàng)目,如科技興農(nóng)種業(yè)發(fā)展項(xiàng)目“農(nóng)作物分子育種的技術(shù)創(chuàng)新研究”和“青菜高通量表型圖譜標(biāo)準(zhǔn)的建立及主要性狀分析”、科技興農(nóng)重點(diǎn)攻關(guān)項(xiàng)目“基于圖像分析及三維建模技術(shù)的黃瓜長勢快速評價(jià)方法研究”、 “蘭科觀賞花卉分子育種技術(shù)研究與產(chǎn)業(yè)化應(yīng)用”等。

結(jié)合Agripheno平臺(tái)現(xiàn)有實(shí)驗(yàn)室、溫室栽培和基礎(chǔ)科研條件,公司積極響應(yīng)上海市政府“崇明生態(tài)島建設(shè)”的發(fā)展方向,2016年12月澤泉科技在崇明城橋鎮(zhèn)投資成立了子公司—上海金盞農(nóng)業(yè)發(fā)展有限公司,擴(kuò)展建設(shè)田間智能化育種服務(wù)平臺(tái),以及智能化農(nóng)業(yè)物聯(lián)網(wǎng)“農(nóng)業(yè)云平臺(tái)”,以生態(tài)鄉(xiāng)村、能源鄉(xiāng)村的發(fā)展模式,展示并實(shí)施公司自主研發(fā)的*的農(nóng)業(yè)樓宇基礎(chǔ)設(shè)施、溫室與田間的智能化“多因子”調(diào)控的栽培管理模式;擬建成*擁有田間型高通量表型分析系統(tǒng)的“Agripheno智能化育種服務(wù)平臺(tái)”,提高上海種業(yè)商業(yè)化育種的進(jìn)程,并服務(wù)于全國和國外相關(guān)育種科研單位。

 展望未來,上海澤泉科技股份有限公司希望在社會(huì)多方資源的支持和關(guān)懷下,不斷提升自己,為社會(huì)提供更多、更優(yōu)秀的產(chǎn)品和的服務(wù)!

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野外型高通量植物表型平臺(tái)——Field Scanalyzer
野外型高通量植物表型平臺(tái)——Field Scanalyzer 產(chǎn)品詳情

2015-06-30-14.jpg

 

1  自動(dòng)化 FieldSystem 系統(tǒng)

Scanalyzer Field 是利用門式起重系統(tǒng)二設(shè)計(jì)和組建的3軸表型系統(tǒng),X軸方向的運(yùn)動(dòng)是通過軌道系統(tǒng)進(jìn)入地面,以允許自然排水和無障礙運(yùn)行,如傳統(tǒng)的混凝土地基可以充當(dāng)流動(dòng)屏障,Y軸垂直于軌道,并且承擔(dān)攝像機(jī)設(shè)置的升降裝置,Z軸描述的是升降單元上下移動(dòng)的方向。

X軸運(yùn)動(dòng)單元是由兩個(gè)變頻有源電源和兩個(gè)無源單元,將被綁定在支撐梁上,Y軸包括門式框架(鋁),并將保護(hù)Z軸的運(yùn)動(dòng),Scanalyzer Field 系統(tǒng)的推進(jìn)包括兩個(gè)電動(dòng)逆變器供電引擎,驅(qū)動(dòng)底部兩個(gè)齒輪傳輸,Y軸和Z軸同樣是由電動(dòng)逆變器和齒條一起供應(yīng)運(yùn)轉(zhuǎn)。

這樣的設(shè)置可以使系統(tǒng)精密的在X、Y和Z軸上運(yùn)動(dòng)。

Scanalyzer Field 系統(tǒng)上的運(yùn)行部件均來自其他手動(dòng)或自動(dòng)操作的系統(tǒng),比如船舶和火車卸貨等,因此Scanalyzer Field 系統(tǒng)的零件具有更耐久性和靈活性。

 

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圖1: ScanalyzerField系統(tǒng)示意圖

 

1.1 系統(tǒng)參數(shù)

未標(biāo)題-2.jpg

1.2  系統(tǒng)操作注意事項(xiàng)

開始的時(shí)候,接受過培訓(xùn)的人員利用遠(yuǎn)程操作進(jìn)行系統(tǒng)的運(yùn)行;

每個(gè)試驗(yàn)地的開始和結(jié)束位置,本步驟在每一個(gè)試驗(yàn)開始前進(jìn)行,在播種前就要做好;

一旦實(shí)驗(yàn)設(shè)置被保存,用戶需要使用控制軟件選取接下來的參數(shù),參數(shù)包括時(shí)間、頻率、地點(diǎn)等;

保證所有的圖像之間都有重復(fù),保證每一個(gè)植株都會(huì)被測量到;

熒光測量時(shí),如果是在晚上,要充分考慮到熒光對周圍植株的影響,不能緊接著進(jìn)行測量。

1.3  系統(tǒng)精確度

ScanalyzerField 系統(tǒng)的精度可以達(dá)到X軸<±50mm,Y軸<±5mm和Z軸<±5mm,除GPS定位外,每張照片都包含在ScanalyzerField系統(tǒng)三維空間的位置。

1.4  系統(tǒng)耐久性

因?yàn)樗械牟考疾捎霉I(yè)標(biāo)準(zhǔn),加載的重量遠(yuǎn)遠(yuǎn)低于設(shè)計(jì)時(shí)的承重能力,ScanalyzerField 系統(tǒng)可以持續(xù)使用5年以上的時(shí)間。

1.5  系統(tǒng)維護(hù)

盡管相機(jī)朝下且有保護(hù)附件,但是為了保證成像質(zhì)量,常規(guī)的清潔仍是必要的,如果下大雨,有必要清潔一下相機(jī)的外殼,清除殘余的水和殘?jiān)?/p>

在植物的生長季,如果ScanalyzerField 系統(tǒng)每天都要工作,那么每年進(jìn)行一次檢查和預(yù)防性維護(hù)是非常必要的。

維護(hù)包括檢查所有滑動(dòng)部件的潤滑性,也要對成像傳感器進(jìn)行檢測,在儀器運(yùn)行的前三年,不會(huì)跟換新的部件。

1.6  系統(tǒng)安全方案

1.6.1  ScanalyzerField系統(tǒng)常見風(fēng)險(xiǎn)

自動(dòng)模式:

系統(tǒng)自動(dòng)運(yùn)行時(shí),人員不能站在ScanalyzerField系統(tǒng)軌道間的任何區(qū)域;

ScanalyzerField系統(tǒng)會(huì)按照編輯的程序沿軌道進(jìn)行運(yùn)動(dòng),任何站在系統(tǒng)上方或離軌道較近的人員,都會(huì)有與ScanalyzerField系統(tǒng)碰撞的危險(xiǎn),系統(tǒng)自動(dòng)運(yùn)動(dòng)的速度可達(dá)60min/min;

自動(dòng)運(yùn)行模式下,圖像采集臂可以在2米以下高度移動(dòng);

熒光成像技術(shù)使用短LED脈沖(1-2s),亮度相當(dāng)于太陽光的4-6倍;

高度掃描設(shè)備包括可見激光。

手動(dòng)模式:

手動(dòng)模式下,操作者就會(huì)在運(yùn)行系統(tǒng)的周邊,并且成像時(shí),操作者需要與系統(tǒng)直接接觸;

系統(tǒng)不運(yùn)行的情況下,傳感器的蓋子被打開,所有的安全模塊開啟且顯示危險(xiǎn)警告。

1.6.2  ScanalyzerField系統(tǒng)風(fēng)險(xiǎn)應(yīng)對

技術(shù)性

導(dǎo)軌放在土層以上,減少人員站在導(dǎo)軌上的風(fēng)險(xiǎn);

ScanalyzerField系統(tǒng)會(huì)產(chǎn)生聲音和燈光信號,提醒周圍的工作人員;

ScanalyzerField系統(tǒng)的導(dǎo)軌如果碰到物體,不論在手動(dòng)狀態(tài)或自動(dòng)狀態(tài),緊急開關(guān)會(huì)將ScanalyzerField系統(tǒng)緊急停止,

安全保險(xiǎn)不能使用,因此系統(tǒng)有大約1m左右的斷裂長度。

人工控制ScanalyzerField系統(tǒng)時(shí),可以使用緊急暫停按鈕。

人工操作時(shí),ScanalyzerField系統(tǒng)運(yùn)行時(shí)的速度是有限制的。

當(dāng)人工操作系統(tǒng)時(shí),激光和熒光的光源是停用的。

當(dāng)遇到惡劣環(huán)境時(shí),自動(dòng)運(yùn)行模式不能維持,ScanalyzerField系統(tǒng)會(huì)進(jìn)入安全位置。

1.6.3  系統(tǒng)組織培訓(xùn)

ScanalyzerField系統(tǒng)的操作者會(huì)接受單獨(dú)培訓(xùn)。

系統(tǒng)維護(hù)人員需要較好掌握技術(shù)教育,并且接受ScanalyzerField系統(tǒng)的培訓(xùn)。

整個(gè)ScanalyzerField系統(tǒng)的外側(cè)都應(yīng)安裝有2m高的柵欄,并且進(jìn)入柵欄區(qū)域的應(yīng)該是接受過培訓(xùn)的人,入口處應(yīng)該粘貼安全條例。

 

2  傳感器平臺(tái)

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圖 2: 傳感器平臺(tái)概念圖(最終版本可能有所不同)

 

每一種相機(jī)系統(tǒng)都單獨(dú)安裝在密封殼體內(nèi),并綁定在靈活可調(diào)的成像盒中,照相機(jī)箱的總有效載荷可以達(dá)到500公斤,允許靈活的增加傳感器。

主要特點(diǎn):

天氣保護(hù)平臺(tái),單獨(dú)保護(hù)傳感器;

卷簾門在平臺(tái)下面的對面,充分保護(hù)不在使用的傳感器;

夜間使用的鹵素?zé)敉瑫r(shí)具有加熱元件,可以防止傳感器溫度過低而表面水分凝結(jié)。

大?。?/strong>

3m 寬

1.5m 高

1.5m 深度

載重:

500kg

 

2.1 FLIR 紅外相機(jī)

相機(jī)與樣品距離、大氣溫度、相對濕度等環(huán)境參數(shù)對測量結(jié)果影響很大,因此定期的重校準(zhǔn)很有必要。

結(jié)合前景/背景分離,可以提取出不同植物的精確溫度,溫度的高低將以假色圖像的形式表現(xiàn)出來,從而更容易觀察到顏色的變化,紅外傳感器所得到的數(shù)據(jù)可以以柱狀圖的形式表現(xiàn)出來,從而分析植物的溫度分布。

成像和光學(xué)參數(shù)

焦距                            

空間分辨率(IFOV)

鏡頭識(shí)別

焦距比數(shù)

熱敏度/NETD

像頻 (SC645) 

像頻 (SC 665) 

聚焦                                     


24.5 mm (0.96 in.)

0.69 mrad

自動(dòng)

1.0

< 0.05°C ,+30°C下 (+86°F) / 50 mK

25 Hz

50 Hz (100/200 Hz 和開窗)

自動(dòng)或手動(dòng) (內(nèi)裝電動(dòng)機(jī))

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2.2 RGB 相機(jī) 

界面        

分辨率

傳感器

傳感器類型

傳感器尺寸

電池尺寸

透鏡支架

A/D

On-board FIFO

IEEE 802.3 1000baseT   

3296 x 2472 

Truesense KAI-08050  

CCD 漸進(jìn)

4/3式

5.5 µm

F-Mount

14 bit

128 MB

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2.3 高光譜傳感器

表1 : 文獻(xiàn)中發(fā)表的高光譜指數(shù)

 123.png

 

彩色條顯示的是某些指數(shù)所需要的光譜范圍,綠色和黃色條可以通過VNIR相機(jī)成像(380-1000nm),黃色和紅色條可以通過VNIR相機(jī)(550-1700nm),近紅外相機(jī)不包含900nm以下的范圍,對于SWIR相機(jī),已知的參數(shù)主要在纖維素和木質(zhì)素相關(guān)的參數(shù)。

為了彌補(bǔ)不斷變化的現(xiàn)場光線,補(bǔ)償性設(shè)備會(huì)提供適量的光源,附加光源為鹵素?zé)?,并且范圍?00到2500納米。

 121212121.jpg

圖3: 附加光源的亮度


2.4 激光掃描器

從上部觀察的高度掃描儀是Frauenhofer IIS研究機(jī)構(gòu)專門為Lemna Tec公司開發(fā)。

使用NIR激光掃描器可以避免影響植物的正常生理,使用非常高的分辨率和很小的時(shí)間間隔。

頂部視圖時(shí),兩個(gè)單元將結(jié)合起來,詳見圖4.

兩個(gè)單元的交叉可以減少樹冠陰影面積的影響。

在側(cè)面掃描時(shí),每個(gè)側(cè)視圖由四個(gè)單元組合成一個(gè)傳感器,光學(xué)元件和角度的選擇將根據(jù)臺(tái)架安裝的最終設(shè)計(jì)而改變。

每一個(gè)單元都包含傳感器頭和電腦,將傳感器信息結(jié)合到plc文件里。

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圖4: 激光掃描設(shè)備從上部掃描植物冠層


2.5  用于PSII研究的熒光相機(jī)

熒光相機(jī)是使用直接熒光值,目前有一篇文獻(xiàn)(Strasser, R. J., A. Srivastava, and M. Tsimilli-Michael. "The fluorescence transient as a tool to characterize and screen photosynthetic samples." Probing photosynthesis: mechanisms, regulation and adaptation (2000): 445-483.)解釋為什么Lemna Tec會(huì)選擇直接熒光測定,或被稱為PAM直接熒光法:

目前使用的有兩種熒光技術(shù),直接熒光和調(diào)制熒光技術(shù),每一種技術(shù)都有優(yōu)勢和缺陷,隨著技術(shù)的發(fā)展,光電池和光電倍增管的低靈敏度要求高的激發(fā)光的強(qiáng)度,這樣使用直接熒光的方法是比較好的,但是有兩個(gè)缺點(diǎn):(a)強(qiáng)大的激發(fā)光會(huì)引起一個(gè)快速的熒光上升;(b)快門開放的時(shí)間過長(大約1ms),F(xiàn)o值無法測定。敏感的光電池,光電二極管和高性能放大器的發(fā)展,使得熒光信號的測量具有非常低的激發(fā)光的強(qiáng)度,低強(qiáng)度調(diào)制光束激發(fā)衡量熒光,初始和熒光都可以進(jìn)行測量,并且精度很高,但是仍有兩個(gè)限制:(a)該時(shí)間分辨率由調(diào)制和解調(diào)頻率的限制;(b)一種低成本調(diào)制熒光計(jì)以10微秒的時(shí)間12位信號的分辨率不可以實(shí)現(xiàn)。如PEA熒光儀,它耗電少且成本低,高分辨率熒光上升允許人們觀察幾個(gè)步驟,F(xiàn)0,K,J,I,P,缺點(diǎn)是需要外界光源,目前,直接熒光法比調(diào)制熒光法有一些優(yōu)勢,如每次測量的信息更多、低功耗、高采樣檢測率、重量輕、多種環(huán)境下采集數(shù)據(jù)和成本低。


表2: 儀器可以測量的熒光參數(shù)

未標(biāo)題-3.jpg

注:DA:測量暗適應(yīng)后的參數(shù),在測量以前,ScanalyzerField系統(tǒng)會(huì)保留暗適應(yīng)的時(shí)間,在測量下一個(gè)植株之前,為避免前個(gè)植株的影響,這樣的測量要在晚上進(jìn)行。

LA:所有需要光適應(yīng)的參數(shù)都是在白天進(jìn)行,因?yàn)閮蓚€(gè)不同相片的光密度有可能不同,因此標(biāo)記LA的參數(shù)需要額外的處理,所有的數(shù)據(jù)才能夠進(jìn)行比較,同樣,可以利用激發(fā)光的10%作為光化光,用戶可以在測量前15分鐘調(diào)整光適應(yīng)。

DL:光-暗交替的參數(shù)只能是整個(gè)植株的平均值,這是因?yàn)橹参锏纳L和葉片位置改變所造成兩次測量差異。


2.6  NDVI/PRI 傳感器

NDVI傳感器運(yùn)行一次,便可以快速對田間進(jìn)行評價(jià),NDVI傳感器同時(shí)可以測量PRI,這種傳感器適用于研究者研究整個(gè)田間的參數(shù),而不是單一的植株。

NDVI 波段:  630±5 和 800±5 nm 峰值波長, 50納米和40納米的全寬度半值(FWHM)頻帶寬度。

PRI 波段:     531±3 和570±3 nm 峰值波長, 10納米全寬度半值(FWHM)頻帶寬度。

前部光學(xué):

半球形:余弦校正聚四氟乙烯擴(kuò)散器,市場為半球形;

視場光闌:20°市場。

校準(zhǔn):NIST可溯源校準(zhǔn)到已知的光譜福照度(W m-2 nm-1)或輻射率(W m-2 nm-1 sr-1 )

精度: 光譜輻照度和輻射值在10%或更高

測量時(shí)間:< 300 ms

外形尺寸: 43 x 40 x 27mm


2.7  主動(dòng)反射傳感器


feature08.jpg

作物冠層傳感器Crop Circle ACS-430提供經(jīng)典的植物指數(shù)數(shù)據(jù)(NDVI和SRI等),以及來自植物冠層和土壤的基本反射信息。

與被動(dòng)傳感器不同,Crop Circle ACS-430不會(huì)受外界光強(qiáng)的限制,測量可以在白天或夜間進(jìn)行。

Crop Circle ACS-430傳感器可以安裝到各種類型的車輛上,并且進(jìn)行田間測量,緊湊的尺寸和低重量的設(shè)計(jì)使Crop Circle ACS-430可以很容易地適應(yīng)支桿安裝和手持式應(yīng)用。傳感器產(chǎn)生的信息可以被用于定量的營養(yǎng)物質(zhì)、水、疾病或其他生長條件對植物或作物的影響。

多通道光譜測量

ACS-430有三個(gè)可選的測量頻道,傳感器同時(shí)測量植物/土壤在670nm/730nm/780nm處的反射值,ACS-430傳感器的主要特點(diǎn)是測量時(shí)與高度無關(guān),Holland Scientific把這種反射測量稱作Pseudo Solar Reflectances (PSR)。因此光譜反射值會(huì)因?yàn)閭鞲衅鞯母叨榷淖?,因此不使用比例?jì)算,就可以獲得數(shù)十個(gè)參數(shù)。(來源于: -canopy -sensor/)


2.8 環(huán)境傳感器 

2.8.1  天氣傳感器

CLIMA SENSOR US NHTFB(超聲波)傳感器可以實(shí)現(xiàn)免維護(hù),且沒有可動(dòng)磨損部件,如或軸承等。

本系統(tǒng)可連接例如風(fēng)速、風(fēng)向、聲學(xué)虛擬溫度、空氣溫度、相對空氣濕度、亮度、空氣壓力、降雨量等傳感器,用于環(huán)境參數(shù)的收集。


2.9  常規(guī)傳感器

本系統(tǒng)可加載PAR傳感器、二氧化碳傳感器等。


德國IPK安裝的Rhizotrone根系分析系統(tǒng),由德國LemnaTec設(shè)計(jì)、德國MK公司施工建設(shè)。相關(guān)視頻,請點(diǎn)擊:德國IPK安裝的Rhizotrone根系分析系統(tǒng)。


產(chǎn)地:德國LemnaTec

熱門產(chǎn)品
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微型手提式真空泵 吸引器 生命科學(xué)儀器 ¥1300 上海市 上海精勝科學(xué)儀器有限公司 2023-11-24 在線詢價(jià)
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