特點(diǎn)優(yōu)勢(shì):
1.特異性:所有產(chǎn)品使用的引物均經(jīng)過(guò)詳盡的生物信息學(xué)分析,經(jīng)過(guò)GenBank及自建龐大數(shù)據(jù)庫(kù)的比對(duì),確保所用的每一條引物均為種屬或血清型特異的基因序列區(qū)段,可實(shí)現(xiàn)對(duì)細(xì)菌種屬及血清型的特異檢測(cè),特異性均達(dá)到佳 。
2. 重現(xiàn)性:該系列所有產(chǎn)品均經(jīng)過(guò)大量實(shí)驗(yàn)菌株的驗(yàn)證,重現(xiàn)性為佳 。
3. 靈敏性:該系列產(chǎn)品可實(shí)現(xiàn)對(duì)檢測(cè)菌的高靈敏檢測(cè),當(dāng)樣品中細(xì)菌的濃度達(dá)到103cfu/ml時(shí),可實(shí)現(xiàn)對(duì)其的直接檢測(cè),無(wú)需繁瑣的增菌過(guò)程。
4. 實(shí)用性:檢測(cè)范圍廣,涵蓋了對(duì)人體危害較為嚴(yán)重的17種呼吸道及腸道致病菌,可實(shí)現(xiàn)對(duì)臨床樣品及其他環(huán)境取樣的快速檢測(cè),整個(gè)檢測(cè)過(guò)程為3-4個(gè)小時(shí)。
5. 優(yōu)勢(shì)1:序列資源豐富,除GenBank公布的序列外,公司還進(jìn)行了大量菌株的序列破譯,從理論上保證所選引物具有良好的保守性和特異性。
6. 優(yōu)勢(shì)2:該系列試劑盒均經(jīng)過(guò)大量的保守性及特異性實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證,憑借公司擁有的豐富的菌種資源,每一種檢測(cè)試劑盒均經(jīng)過(guò)了20余種標(biāo)準(zhǔn)菌株和臨床菌株的保守性驗(yàn)證及40余種近緣標(biāo)準(zhǔn)菌株和臨床菌株的特異性驗(yàn)證,確保在使用過(guò)程中不會(huì)出現(xiàn)任何的假陽(yáng)性及假陰性報(bào)告結(jié)果。
RNA和DNA提取:
裂解:裂解公式可能因您要提取 DNA 還是 RNA 而異,但共同點(diǎn)是含有高濃度離液鹽的裂解緩沖液。
Chaotropes(離液劑)的作用:Chaotrope會(huì)破壞氫鍵及疏水間的相互作用。離液鹽包括鹽酸胍、硫氰酸胍、尿素和高氯酸鋰。
洗滌劑:除了離液劑外,裂解緩沖液中通常還有一些去污劑,以幫助蛋白質(zhì)溶解和裂解。
溶jun酶和蛋白酶K:根據(jù)樣品類型,也可以使用酶進(jìn)行裂解。蛋白酶 K 就是其中之一,實(shí)際上在這些變性緩沖液中效果較 好;當(dāng)?shù)鞍踪|(zhì)變性增多,蛋白酶 K 的作用也會(huì)相應(yīng)增強(qiáng)。然而,溶jun酶在變性中不起作用,因此溶jun酶處理通常在添加變性鹽之前進(jìn)行。
提取步驟:
1.從負(fù)八十冰箱取出樣品,放置于冰上緩慢解凍; (提前預(yù)冷離心機(jī)至4度)
2.待解凍后(紅色),加入200 μl氯仿(加入氯仿體積為T(mén)rizol體積的1/5),劇烈震蕩(乳白紅色),冰上靜置10 min。 (氯仿為有機(jī)溶劑,有效的使有機(jī)相和無(wú)機(jī)相迅速分離。有機(jī)相中主要是酚和蛋白結(jié)合,從而使得蛋白和RNA脫離,RNA進(jìn)入水相。)
3.放置于預(yù)冷離心機(jī),離心(4度,12000 rpm,15 min),離心后可見(jiàn)明顯分三層(上層無(wú)色透明水相為RNA層,中間很薄的乳白色為DNA層,下層為紅色為蛋白層)。
4.小心緩慢吸取上清,約400 μl(寧可少吸,也不要多吸?。?,置于另一個(gè)新的1.5 ml RNase-free EP管中,加入等體積的異丙醇,上下顛倒混勻,常溫靜置放置15 min。
5.離心(4度,12000 rpm,15 min),可見(jiàn)白色沉淀(有時(shí)細(xì)胞較少看不到沉淀,可放置負(fù)二十或負(fù)八十兩小時(shí)再繼續(xù)后面步驟)
6.棄上清,每管加入950 ul 75% 乙醇,上下顛倒混勻(切記不要用槍吹打混勻,這樣會(huì)造成RNA溶解)。
7.離心(4度,12000 rpm,10 min),可見(jiàn)底部明顯白色沉淀。
8.離心后,棄掉上清,放入離心機(jī)再次瞬離,用10 μl 的移液器洗去殘留液體, 開(kāi)蓋晾干(約5 min)。
9.每個(gè)樣品根據(jù)沉淀大小加入適量DEPC水(一般20~30 μl,有時(shí)看不到沉淀,可加10 μl DEPC水溶解),吹打溶解RNA,十一樓酶標(biāo)儀測(cè)濃度,OD值(260/280=1.8-2.0)標(biāo)記,負(fù)八十保存。
備注:對(duì)于中性粒細(xì)胞提取RNA建議細(xì)胞數(shù)目大于2x106/樣品;
備注:操作過(guò)程中佩戴口罩。
設(shè)計(jì)引物應(yīng)遵循以下原則:
①引物長(zhǎng)度: 15-30bp,常用為20bp左右。
②引物擴(kuò)增跨度: 以200-500bp為宜,特定條件下可擴(kuò)增長(zhǎng)至10kb的片段。
③引物堿基:G+C含量以40-60%為宜,G+C太少擴(kuò)增效果不佳,G+C過(guò)多易出現(xiàn)非特異條帶。ATGC好隨機(jī)分布,避免5個(gè)以上的嘌呤或嘧啶核苷酸的成串排列。
④避免引物內(nèi)部出現(xiàn)二級(jí)結(jié)構(gòu),避免兩條引物間互補(bǔ),特別是3’端的互補(bǔ),否則會(huì)形成引物二聚體,產(chǎn)生非特異的擴(kuò)增條帶。
⑤引物3’端的堿基,特別是 末及倒數(shù) 個(gè)堿基,應(yīng)嚴(yán)格要求配對(duì),以避免因末端堿基不配對(duì)而導(dǎo)致PCR失敗。
⑥引物中有或能加上合適的酶切位點(diǎn),被擴(kuò)增的靶序列 有適宜的酶切位點(diǎn),這對(duì)酶切分析或分子克隆很有好處。
⑦引物的特異性:引物應(yīng)與核酸序列數(shù)據(jù)庫(kù)的其它序列無(wú)明顯同源性。
注意事項(xiàng):
1. 試劑盒從冷藏環(huán)境中取出應(yīng)在室溫平衡15-30分鐘后方可使用,酶標(biāo)包被板開(kāi)封后如未用完,板條應(yīng)裝入密封袋中保存。濃洗滌液可能會(huì)有結(jié)晶析出,稀釋時(shí)可在水浴中加溫助溶,洗滌時(shí)不影響結(jié)果。
2.各步加樣均應(yīng)使用加樣器,并經(jīng)常校對(duì)其準(zhǔn)確性,以避免試驗(yàn)誤差。一次加樣時(shí)間控制在5分鐘內(nèi),如標(biāo)本數(shù)量多,推薦使用排槍加樣。
3.請(qǐng)每次測(cè)定的同時(shí)做標(biāo)準(zhǔn)曲線,做復(fù)孔。如標(biāo)本中待測(cè)物質(zhì)含量過(guò)高(樣本OD值大于標(biāo)準(zhǔn)品孔di一孔的OD值),請(qǐng)先用樣品稀釋液稀釋一定倍數(shù)(n倍)后再測(cè)定,計(jì)算時(shí)請(qǐng)再乘以總稀釋倍數(shù)(×n×5)。
4.封板膜只限一次性使用,以避免交叉污染。
5.底物請(qǐng)避光保存。
6.嚴(yán)格按照說(shuō)明書(shū)的操作進(jìn)行,試驗(yàn)結(jié)果判定必須以酶標(biāo)儀讀數(shù)為準(zhǔn).
7.所有樣品,洗滌液和各種廢棄物都應(yīng)按傳染物處理。
8.本試劑不同批號(hào)組分不得混用。
9.不能使用過(guò)期產(chǎn)品。
10. 如與英文說(shuō)明書(shū)有異,以英文說(shuō)明書(shū)為準(zhǔn)。