隨著基因組研究的不斷推進,單分子實時測序系統(tǒng)以PacBio測序為代表的第三代基因測序技術(shù)逐漸應(yīng)用到多個科研領(lǐng)域。該平臺利于單分子實時測序技術(shù),又稱作SMRT測序,基于納米小孔的單分子讀取技術(shù),無需擴增即可快速完成序列讀取。PacBio Sequel測序儀是美國太平洋生物技術(shù)公司基于PacBio RSII平臺的基礎(chǔ)上,新推出的第三代測序平臺,該系統(tǒng)以測序通量高、單Gb數(shù)據(jù)成本低、周期短而突出于RSII平臺。
單分子實時測序建立在兩項關(guān)鍵的技術(shù)創(chuàng)新之上,克服了測序領(lǐng)域的重大挑戰(zhàn)。
1、零模波導孔技術(shù)只允許激光照亮反應(yīng)孔底部,也就是DNA聚合酶和模板復合物固定的位置。
2、熒光基團標記在核苷酸的三磷酸末端,不僅可以模擬天然DNA鏈合成過程,而且可以實時記錄復合物上堿基摻入的順序。
§ 單分子實時測序系統(tǒng)特點:
單分子實時測序技術(shù)可以提供長讀長序列和均一覆蓋度的數(shù)據(jù),完成迄今為止更為全面的基因組從頭組裝。真正的全基因組測序應(yīng)該為基因組中所有類型的變異提供完整且準確的信息,包括結(jié)構(gòu)變異、可移動元件、單體型、低復雜度區(qū)域以及表現(xiàn)遺傳學修飾。
? 超越基因組草圖,產(chǎn)生Mb大小的contigs和完整基因組拼接;
? 獲得SNPs及其他基因組變異;
? 呈現(xiàn)基于擴增的測序技術(shù)無法獲得的基因組區(qū)域;
? 包含啟動子區(qū)的完整基因模型注釋;
? 獲得二倍體基因組的單體型信息;
? 捕獲表現(xiàn)遺傳學信息。