GridION MK1是一款桌面測序儀,利用的納米孔測序技術(shù),實(shí)現(xiàn)對DNA和RNA分子的高通量單分子實(shí)時測序。
1.應(yīng)用廣泛:全基因組測序、靶向測序、RNA測序、宏基因組測序、表型研究等。樣本類型包括人類基因組、動植物基因組、微生物基因組以及各種臨床標(biāo)本的DNA和RNA
2.測序起始量需求從pg級到ug級都可以進(jìn)行建庫。
3.配合快速建庫試劑盒使用,可以在10分鐘之內(nèi)完成文庫的制備。
4.集成設(shè)備:GridION MK1本身集成了一臺高性能計算機(jī),可用于數(shù)據(jù)獲取,存儲以及堿基轉(zhuǎn)換(basecalling。
5.安裝簡便:沒有復(fù)雜的激光或光路系統(tǒng),插電即可使用。
6.產(chǎn)生數(shù)據(jù)快速:提供的單分子實(shí)時測序,上機(jī)后2分鐘產(chǎn)生堿基序列數(shù)據(jù)。并可以根據(jù)實(shí)驗(yàn)需求設(shè)置測序反應(yīng)時間,可選范圍在幾分鐘到48小時之間。
7.模塊化設(shè)計:允許同時運(yùn)行多至5個獨(dú)立的實(shí)驗(yàn),也可以單獨(dú)運(yùn)行1個測序?qū)嶒?yàn),為用戶提供了實(shí)驗(yàn)設(shè)計上的便利。
8.*單分子測序:DNA/RNA直接測序,無需PCR擴(kuò)增,免除PCR擴(kuò)增帶來的錯誤和GC偏差,DNA平均測序速度為450bp/s,快速、實(shí)時。
9.讀長長:讀長為核酸片段長度,最長超過2Mbp。
10.數(shù)據(jù)量大:理論只可產(chǎn)生250G數(shù)據(jù),用戶可產(chǎn)生150G數(shù)據(jù)。
11.*直接RNA測序:提取RNA無需轉(zhuǎn)換成cDNA即可進(jìn)行測序。
12.*甲基化檢測:堿基修飾基于電信號的差異檢測堿基,在DNA/RNA測序同時可直接檢測堿基修飾。
13.分析軟件豐富:數(shù)據(jù)分析工作站預(yù)先安裝了30多種可用于分析Nanopore測序數(shù)據(jù)的常用工具。