PromethION是一款桌面測序儀,利用的納米孔測序技術,實現(xiàn)對DNA和RNA分子的高通量單分子實時測序。
1.應用廣泛:全基因組測序、靶向測序、RNA測序、宏基因組測序、表型研究等。樣本類型包括人類基因組、動植物基因組、微生物基因組以及各種臨床標本的DNA和RNA
2.測序起始量需求從pg級到ug級都可以進行建庫。
3.配合快速建庫試劑盒使用,可以在10分鐘之內(nèi)完成文庫的制備。
4.集成設備:PromethION本身集成了一臺高性能計算機,可用于數(shù)據(jù)獲取,存儲以及堿基轉(zhuǎn)換(basecalling。
5.安裝簡便:沒有復雜的激光或光路系統(tǒng),插電即可使用。
6.產(chǎn)生數(shù)據(jù)快速:提供的單分子實時測序,上機后2分鐘產(chǎn)生堿基序列數(shù)據(jù)。并可以根據(jù)實驗需求設置測序反應時間,可選范圍在幾分鐘到48小時之間。
7.模塊化設計:允許同時運行多至48個獨立的實驗,也可以單獨運行1個測序?qū)嶒?,為用戶提供了實驗設計上的便利。
8.單分子測序:DNA/RNA直接測序,無需PCR擴增,免除PCR擴增帶來的錯誤和GC偏差,DNA平均測序速度為450bp/s,快速、實時。
9.讀長長:讀長為核酸片段長度,最長超過2Mbp。
10.數(shù)據(jù)量大:單張芯片產(chǎn)生200G數(shù)據(jù),48張芯片可產(chǎn)生48*200G數(shù)據(jù)。
11.直接RNA測序:提取RNA無需轉(zhuǎn)換成cDNA即可進行測序。
12.甲基化檢測:堿基修飾基于電信號的差異檢測堿基,在DNA/RNA測序同時可直接檢測堿基修飾。
13.分析軟件豐富:數(shù)據(jù)分析工作站預先安裝了30多種可用于分析Nanopore測序數(shù)據(jù)的常用工具。